Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QZ05

Protein Details
Accession C4QZ05    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
450-480LSSLDDKKIKKPPAKKQKKMTKKEMTTLHQNHydrophilic
493-517PPTTAANKKRGTYKKKNKYILIINDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
456-472KKIKKPPAKKQKKMTKK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 12.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0620  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MSQIQSSQVGAKNMQTAQPQAQQRPINGSVTLSNGQRINPQNLTPQQQRLLQQKVLHQKLKNYKFAETSEEILHKYEKFPPSLTFHIHENHYRFGDQDGVIPKNSSVIKAFLEYVAREEIPPALIEVTKDAGVQLYEGCIILRIYDHRHLVAHINDAKDSQHVSSESSANNTNNEKKEPSKVPKTYTTILRPTQLSLYADLLYQTDYLQVRFTDSLSLNIETEILTASKRNLDLSVPLNPHRATANLKPEVKYPYYDPETDTVVHEHRPDARGNMVNADTVDYRKLHEDMAQHGSDYERLMLLLSDRFDDDSQTQGSSVTSSQFMRLRFVEAWRKKEERLQESGGSSQRQRPLQPGQIPGMLSSFSSNTGNMNTMLDNLTPQQKAAIQQRMIQQGRAQPQQQQPDQEQLQEQQQQQPQQAMSQQRQQQLQQLYQRQQQHNQHHQQNQDELSSLDDKKIKKPPAKKQKKMTKKEMTTLHQNVAGKTIPSAESTPPTTAANKKRGTYKKKNKYILIIND
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.32
3 0.32
4 0.34
5 0.41
6 0.45
7 0.44
8 0.51
9 0.51
10 0.5
11 0.53
12 0.5
13 0.45
14 0.38
15 0.36
16 0.29
17 0.3
18 0.32
19 0.25
20 0.26
21 0.25
22 0.26
23 0.32
24 0.36
25 0.37
26 0.37
27 0.38
28 0.43
29 0.47
30 0.54
31 0.53
32 0.53
33 0.51
34 0.53
35 0.57
36 0.56
37 0.57
38 0.54
39 0.52
40 0.55
41 0.61
42 0.64
43 0.65
44 0.6
45 0.62
46 0.68
47 0.72
48 0.73
49 0.65
50 0.6
51 0.58
52 0.56
53 0.54
54 0.46
55 0.41
56 0.37
57 0.36
58 0.32
59 0.3
60 0.3
61 0.24
62 0.24
63 0.29
64 0.29
65 0.29
66 0.31
67 0.34
68 0.37
69 0.4
70 0.42
71 0.36
72 0.36
73 0.38
74 0.39
75 0.42
76 0.39
77 0.39
78 0.36
79 0.34
80 0.31
81 0.28
82 0.29
83 0.22
84 0.24
85 0.25
86 0.25
87 0.25
88 0.25
89 0.23
90 0.24
91 0.24
92 0.2
93 0.17
94 0.17
95 0.18
96 0.19
97 0.2
98 0.16
99 0.18
100 0.16
101 0.17
102 0.17
103 0.16
104 0.14
105 0.14
106 0.14
107 0.12
108 0.12
109 0.1
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.09
131 0.14
132 0.18
133 0.2
134 0.2
135 0.2
136 0.22
137 0.25
138 0.24
139 0.27
140 0.25
141 0.25
142 0.24
143 0.24
144 0.23
145 0.2
146 0.2
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.14
151 0.15
152 0.18
153 0.17
154 0.18
155 0.21
156 0.19
157 0.22
158 0.24
159 0.28
160 0.29
161 0.31
162 0.32
163 0.3
164 0.37
165 0.43
166 0.47
167 0.51
168 0.52
169 0.55
170 0.58
171 0.61
172 0.58
173 0.56
174 0.53
175 0.5
176 0.47
177 0.46
178 0.39
179 0.35
180 0.32
181 0.28
182 0.23
183 0.17
184 0.17
185 0.14
186 0.14
187 0.13
188 0.11
189 0.09
190 0.08
191 0.07
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.11
196 0.1
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.15
203 0.16
204 0.17
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.09
209 0.09
210 0.07
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.12
221 0.14
222 0.19
223 0.19
224 0.2
225 0.23
226 0.22
227 0.23
228 0.2
229 0.2
230 0.18
231 0.21
232 0.28
233 0.31
234 0.32
235 0.32
236 0.35
237 0.37
238 0.33
239 0.29
240 0.23
241 0.24
242 0.25
243 0.25
244 0.23
245 0.2
246 0.21
247 0.2
248 0.19
249 0.15
250 0.13
251 0.14
252 0.13
253 0.13
254 0.14
255 0.15
256 0.15
257 0.14
258 0.17
259 0.18
260 0.18
261 0.19
262 0.17
263 0.15
264 0.15
265 0.15
266 0.12
267 0.1
268 0.11
269 0.09
270 0.1
271 0.11
272 0.12
273 0.11
274 0.13
275 0.15
276 0.17
277 0.22
278 0.21
279 0.19
280 0.18
281 0.18
282 0.16
283 0.14
284 0.1
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.05
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.11
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.09
308 0.09
309 0.13
310 0.16
311 0.16
312 0.18
313 0.18
314 0.21
315 0.2
316 0.26
317 0.33
318 0.35
319 0.4
320 0.44
321 0.46
322 0.43
323 0.47
324 0.5
325 0.45
326 0.45
327 0.44
328 0.4
329 0.39
330 0.43
331 0.41
332 0.35
333 0.31
334 0.31
335 0.32
336 0.32
337 0.32
338 0.34
339 0.37
340 0.43
341 0.46
342 0.44
343 0.41
344 0.4
345 0.39
346 0.34
347 0.27
348 0.19
349 0.14
350 0.12
351 0.1
352 0.09
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.11
357 0.12
358 0.11
359 0.12
360 0.1
361 0.1
362 0.11
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.16
367 0.15
368 0.14
369 0.15
370 0.16
371 0.22
372 0.29
373 0.35
374 0.32
375 0.36
376 0.42
377 0.5
378 0.49
379 0.45
380 0.4
381 0.39
382 0.44
383 0.45
384 0.41
385 0.4
386 0.45
387 0.53
388 0.52
389 0.51
390 0.47
391 0.49
392 0.49
393 0.43
394 0.38
395 0.32
396 0.36
397 0.37
398 0.37
399 0.36
400 0.39
401 0.41
402 0.41
403 0.42
404 0.36
405 0.32
406 0.36
407 0.36
408 0.36
409 0.41
410 0.45
411 0.46
412 0.49
413 0.49
414 0.5
415 0.48
416 0.5
417 0.51
418 0.53
419 0.54
420 0.57
421 0.65
422 0.63
423 0.67
424 0.69
425 0.71
426 0.74
427 0.77
428 0.79
429 0.76
430 0.76
431 0.72
432 0.68
433 0.59
434 0.5
435 0.41
436 0.32
437 0.29
438 0.29
439 0.24
440 0.23
441 0.26
442 0.27
443 0.34
444 0.43
445 0.49
446 0.53
447 0.62
448 0.69
449 0.76
450 0.85
451 0.87
452 0.88
453 0.91
454 0.93
455 0.93
456 0.93
457 0.92
458 0.88
459 0.87
460 0.85
461 0.8
462 0.8
463 0.74
464 0.67
465 0.6
466 0.55
467 0.47
468 0.42
469 0.37
470 0.27
471 0.22
472 0.22
473 0.19
474 0.19
475 0.22
476 0.21
477 0.24
478 0.27
479 0.28
480 0.26
481 0.28
482 0.3
483 0.37
484 0.42
485 0.47
486 0.5
487 0.52
488 0.61
489 0.69
490 0.74
491 0.77
492 0.79
493 0.81
494 0.86
495 0.91
496 0.87
497 0.86