Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QYM3

Protein Details
Accession C4QYM3    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-73LLVRKRAIINPKRKIKKDTADKNNTESHydrophilic
124-144SEKSEDKKKGKKAIKRVDPNABasic
328-354ELSTSVKPKKRTMRISRCRNIPKPADKHydrophilic
422-445EGRAARRSEEHKKKLEQELKEKTKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-63RAIINPKRKIKK
126-139KSEDKKKGKKAIKR
376-377KK
381-381K
396-445RAEKGVKVRGMSGKGKATGVKKPRSKEGRAARRSEEHKKKLEQELKEKTK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030684  C:preribosome  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0493  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAKDTKEKEKANETSNVLEDIFGAPSAVDSSVSSLFSQPSAVDQNALLVRKRAIINPKRKIKKDTADKNNTESKQSESADVEEDNEEKSEPALKKQKRGSKEDEDEDLETRYLAKLNGKEKDSSEKSEDKKKGKKAIKRVDPNAVKESAFEQSERTVFVGNLPVIVAIEREEKEEFKEYMAKIGPVESIRFRSIAFKLPMPRRDAFLSKAFDETRSALNAYVVYENKNDSKKAKELNGKVFKDHHLRVDHVAHPSPQDNKKSIFIGNLDFEEEEESLWKYFTEKVGQDKVENVRIIRDTKTNFGKGFAMVQFKDFLEVDKCLMLNGEELSTSVKPKKRTMRISRCRNIPKPADKWFGGKEHTNLSEKDKTIMGRAKKVLSKKDRALVGSLVIEGQRAEKGVKVRGMSGKGKATGVKKPRSKEGRAARRSEEHKKKLEQELKEKTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.51
3 0.46
4 0.36
5 0.3
6 0.25
7 0.19
8 0.16
9 0.11
10 0.1
11 0.07
12 0.08
13 0.09
14 0.08
15 0.07
16 0.07
17 0.1
18 0.12
19 0.13
20 0.14
21 0.14
22 0.14
23 0.14
24 0.15
25 0.12
26 0.14
27 0.18
28 0.17
29 0.17
30 0.16
31 0.21
32 0.24
33 0.26
34 0.23
35 0.21
36 0.22
37 0.26
38 0.28
39 0.29
40 0.37
41 0.44
42 0.54
43 0.62
44 0.71
45 0.76
46 0.8
47 0.82
48 0.81
49 0.81
50 0.82
51 0.82
52 0.83
53 0.84
54 0.81
55 0.79
56 0.78
57 0.69
58 0.62
59 0.53
60 0.47
61 0.44
62 0.41
63 0.39
64 0.31
65 0.31
66 0.29
67 0.27
68 0.24
69 0.18
70 0.17
71 0.15
72 0.13
73 0.12
74 0.1
75 0.1
76 0.16
77 0.16
78 0.25
79 0.34
80 0.38
81 0.47
82 0.55
83 0.63
84 0.62
85 0.69
86 0.69
87 0.69
88 0.72
89 0.68
90 0.63
91 0.58
92 0.53
93 0.46
94 0.39
95 0.28
96 0.2
97 0.17
98 0.13
99 0.11
100 0.11
101 0.15
102 0.2
103 0.27
104 0.33
105 0.34
106 0.36
107 0.37
108 0.45
109 0.44
110 0.42
111 0.41
112 0.43
113 0.45
114 0.53
115 0.59
116 0.58
117 0.63
118 0.66
119 0.7
120 0.71
121 0.76
122 0.77
123 0.79
124 0.81
125 0.82
126 0.79
127 0.79
128 0.76
129 0.73
130 0.65
131 0.57
132 0.46
133 0.37
134 0.34
135 0.27
136 0.22
137 0.17
138 0.14
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.11
144 0.1
145 0.11
146 0.14
147 0.12
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.05
155 0.08
156 0.09
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.15
161 0.18
162 0.17
163 0.15
164 0.2
165 0.18
166 0.22
167 0.22
168 0.2
169 0.16
170 0.17
171 0.17
172 0.13
173 0.15
174 0.12
175 0.14
176 0.15
177 0.15
178 0.14
179 0.17
180 0.18
181 0.23
182 0.23
183 0.24
184 0.31
185 0.37
186 0.41
187 0.42
188 0.41
189 0.36
190 0.38
191 0.36
192 0.32
193 0.32
194 0.3
195 0.25
196 0.28
197 0.25
198 0.23
199 0.22
200 0.2
201 0.15
202 0.14
203 0.13
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.12
213 0.15
214 0.17
215 0.17
216 0.17
217 0.21
218 0.24
219 0.27
220 0.33
221 0.37
222 0.41
223 0.5
224 0.57
225 0.54
226 0.52
227 0.5
228 0.47
229 0.46
230 0.42
231 0.37
232 0.3
233 0.31
234 0.33
235 0.35
236 0.33
237 0.3
238 0.29
239 0.24
240 0.23
241 0.24
242 0.27
243 0.28
244 0.3
245 0.29
246 0.3
247 0.31
248 0.32
249 0.3
250 0.26
251 0.22
252 0.2
253 0.19
254 0.17
255 0.16
256 0.13
257 0.13
258 0.12
259 0.1
260 0.08
261 0.07
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.09
268 0.11
269 0.15
270 0.17
271 0.23
272 0.28
273 0.29
274 0.29
275 0.32
276 0.33
277 0.34
278 0.33
279 0.27
280 0.24
281 0.26
282 0.27
283 0.25
284 0.27
285 0.23
286 0.29
287 0.34
288 0.35
289 0.33
290 0.33
291 0.31
292 0.26
293 0.29
294 0.25
295 0.25
296 0.21
297 0.21
298 0.21
299 0.2
300 0.22
301 0.17
302 0.16
303 0.14
304 0.15
305 0.14
306 0.14
307 0.14
308 0.11
309 0.12
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.1
317 0.11
318 0.14
319 0.2
320 0.24
321 0.28
322 0.36
323 0.46
324 0.53
325 0.63
326 0.71
327 0.76
328 0.82
329 0.89
330 0.89
331 0.88
332 0.89
333 0.84
334 0.82
335 0.8
336 0.79
337 0.75
338 0.75
339 0.72
340 0.63
341 0.62
342 0.57
343 0.52
344 0.47
345 0.44
346 0.38
347 0.38
348 0.41
349 0.39
350 0.37
351 0.39
352 0.42
353 0.38
354 0.38
355 0.34
356 0.31
357 0.35
358 0.41
359 0.39
360 0.4
361 0.43
362 0.47
363 0.5
364 0.57
365 0.6
366 0.62
367 0.66
368 0.64
369 0.67
370 0.65
371 0.61
372 0.57
373 0.48
374 0.41
375 0.33
376 0.26
377 0.21
378 0.16
379 0.15
380 0.11
381 0.11
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.13
386 0.18
387 0.23
388 0.27
389 0.27
390 0.32
391 0.38
392 0.44
393 0.45
394 0.46
395 0.46
396 0.44
397 0.45
398 0.45
399 0.43
400 0.46
401 0.51
402 0.55
403 0.57
404 0.6
405 0.68
406 0.71
407 0.73
408 0.74
409 0.76
410 0.77
411 0.78
412 0.79
413 0.75
414 0.76
415 0.77
416 0.78
417 0.78
418 0.76
419 0.76
420 0.78
421 0.8
422 0.81
423 0.82
424 0.8
425 0.79