Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G2R1U2

Protein Details
Accession G2R1U2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-55SPEPAKTSDRKENAKKRDVLHydrophilic
59-78TQLDLKRKPRAPRVKLDETRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-100KRKPRAPRVKLDETRLLSDKGIPRLRRMAPKLKLKGK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12.5, cyto 6, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0031297  P:replication fork processing  
KEGG ttt:THITE_2111309  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MTSRTANSVLPGRDSGNFVNDYLADWPDDDPFRSPSPEPAKTSDRKENAKKRDVLGIETQLDLKRKPRAPRVKLDETRLLSDKGIPRLRRMAPKLKLKGKGHEFSDAARLLSFYQEWLDDLFPKATFLDALAMVEKEGHKTAMRNARQQWIDEDKPKPAAAEAEDDQDYRLHQGSSGPRQPERVAPVFEKAAQAGKERARTPAADDLFGDDDIYNATPRRDMGSTAPAGQVVNDGVPDEDDLDALMAEAEAEAQSGQSSGVASAPFTSIFGDGSKTATSAPAAEPDEDDLDALMAEVEAEGGATTRPSNDQKDSSSAGTDTGQPSVNFEDDEEAMAEMDGLW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.29
3 0.27
4 0.26
5 0.23
6 0.23
7 0.21
8 0.2
9 0.18
10 0.18
11 0.13
12 0.13
13 0.13
14 0.16
15 0.17
16 0.17
17 0.18
18 0.21
19 0.23
20 0.27
21 0.27
22 0.32
23 0.4
24 0.45
25 0.46
26 0.48
27 0.54
28 0.56
29 0.63
30 0.63
31 0.62
32 0.65
33 0.72
34 0.76
35 0.78
36 0.8
37 0.77
38 0.7
39 0.71
40 0.62
41 0.56
42 0.52
43 0.48
44 0.4
45 0.35
46 0.36
47 0.3
48 0.31
49 0.29
50 0.28
51 0.32
52 0.37
53 0.45
54 0.53
55 0.61
56 0.66
57 0.74
58 0.78
59 0.8
60 0.79
61 0.77
62 0.75
63 0.66
64 0.64
65 0.56
66 0.48
67 0.37
68 0.38
69 0.36
70 0.37
71 0.41
72 0.38
73 0.39
74 0.46
75 0.51
76 0.54
77 0.56
78 0.58
79 0.59
80 0.67
81 0.72
82 0.72
83 0.76
84 0.7
85 0.73
86 0.71
87 0.68
88 0.6
89 0.57
90 0.49
91 0.41
92 0.43
93 0.35
94 0.27
95 0.21
96 0.19
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.1
128 0.17
129 0.26
130 0.29
131 0.34
132 0.36
133 0.42
134 0.42
135 0.42
136 0.4
137 0.38
138 0.38
139 0.37
140 0.36
141 0.31
142 0.32
143 0.31
144 0.26
145 0.19
146 0.17
147 0.12
148 0.15
149 0.13
150 0.14
151 0.15
152 0.15
153 0.14
154 0.13
155 0.12
156 0.09
157 0.09
158 0.07
159 0.07
160 0.11
161 0.15
162 0.22
163 0.26
164 0.27
165 0.27
166 0.29
167 0.3
168 0.29
169 0.3
170 0.26
171 0.24
172 0.23
173 0.25
174 0.23
175 0.23
176 0.2
177 0.15
178 0.15
179 0.14
180 0.15
181 0.17
182 0.19
183 0.23
184 0.24
185 0.26
186 0.24
187 0.24
188 0.25
189 0.28
190 0.26
191 0.22
192 0.21
193 0.2
194 0.2
195 0.19
196 0.17
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.11
207 0.11
208 0.12
209 0.15
210 0.2
211 0.2
212 0.21
213 0.21
214 0.19
215 0.18
216 0.16
217 0.14
218 0.08
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.09
260 0.11
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.15
269 0.16
270 0.16
271 0.17
272 0.18
273 0.19
274 0.17
275 0.16
276 0.1
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.05
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.07
293 0.12
294 0.18
295 0.24
296 0.29
297 0.33
298 0.36
299 0.4
300 0.43
301 0.39
302 0.36
303 0.31
304 0.27
305 0.24
306 0.25
307 0.21
308 0.2
309 0.22
310 0.2
311 0.22
312 0.24
313 0.24
314 0.2
315 0.19
316 0.2
317 0.17
318 0.18
319 0.16
320 0.13
321 0.12
322 0.11