Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G2R425

Protein Details
Accession G2R425    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-260DSGSVRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSASQPGSKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-152RKLRRKG
234-266RSRSRSRSRSRSRSRSRSRSASQPGSKSRSRSP
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 14, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
IPR024767  PRP38_C  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ttt:THITE_2111896  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
PF12871  PRP38_assoc  
Amino Acid Sequences MSKPAVHRADERRFLDERGTTGPLAPNGLNPATIMEKAVRERIVESYFYKEQCFGVNEADIVDRVVEHVHFIGGVYGSGGQRPTPFLCLAFKLLQLAPGDDVLREYIGFGGDKFKYLRALALFYVRLTRPDKDVYMTLEPFLEDRRKLRRKGRNGTSLTYMDEFVDDLLTKDRVCGTSLWKMRKRDILEDLEILEPRVSPLGTLEDLLDEEDEAMQNGDGANGDGHEGDSGSVRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSASQPGSKSRSRSPGERSDHDRMDIDGSEGRRSAGGRSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.52
3 0.45
4 0.38
5 0.33
6 0.34
7 0.28
8 0.29
9 0.31
10 0.25
11 0.26
12 0.23
13 0.2
14 0.22
15 0.22
16 0.19
17 0.16
18 0.17
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.14
23 0.17
24 0.19
25 0.24
26 0.22
27 0.21
28 0.23
29 0.26
30 0.26
31 0.26
32 0.25
33 0.28
34 0.31
35 0.31
36 0.31
37 0.27
38 0.25
39 0.26
40 0.27
41 0.21
42 0.19
43 0.19
44 0.18
45 0.17
46 0.17
47 0.13
48 0.11
49 0.09
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.05
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.09
67 0.08
68 0.09
69 0.12
70 0.13
71 0.14
72 0.15
73 0.15
74 0.16
75 0.17
76 0.2
77 0.19
78 0.18
79 0.18
80 0.17
81 0.19
82 0.17
83 0.16
84 0.13
85 0.13
86 0.13
87 0.1
88 0.11
89 0.08
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.1
98 0.1
99 0.12
100 0.12
101 0.13
102 0.14
103 0.14
104 0.16
105 0.13
106 0.15
107 0.13
108 0.15
109 0.15
110 0.13
111 0.16
112 0.14
113 0.17
114 0.18
115 0.18
116 0.18
117 0.2
118 0.21
119 0.19
120 0.2
121 0.2
122 0.21
123 0.2
124 0.18
125 0.15
126 0.15
127 0.13
128 0.14
129 0.13
130 0.11
131 0.14
132 0.24
133 0.31
134 0.37
135 0.47
136 0.54
137 0.61
138 0.7
139 0.75
140 0.75
141 0.71
142 0.68
143 0.62
144 0.53
145 0.45
146 0.36
147 0.27
148 0.18
149 0.14
150 0.12
151 0.07
152 0.07
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.11
163 0.13
164 0.22
165 0.27
166 0.36
167 0.41
168 0.43
169 0.46
170 0.52
171 0.51
172 0.48
173 0.49
174 0.45
175 0.41
176 0.38
177 0.36
178 0.3
179 0.27
180 0.22
181 0.15
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.07
186 0.06
187 0.07
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.07
217 0.07
218 0.09
219 0.13
220 0.13
221 0.18
222 0.24
223 0.32
224 0.41
225 0.5
226 0.58
227 0.66
228 0.76
229 0.82
230 0.88
231 0.9
232 0.91
233 0.93
234 0.94
235 0.93
236 0.91
237 0.89
238 0.83
239 0.83
240 0.81
241 0.8
242 0.77
243 0.75
244 0.75
245 0.72
246 0.71
247 0.66
248 0.64
249 0.64
250 0.61
251 0.6
252 0.6
253 0.63
254 0.67
255 0.69
256 0.69
257 0.68
258 0.66
259 0.61
260 0.54
261 0.45
262 0.41
263 0.34
264 0.29
265 0.24
266 0.23
267 0.23
268 0.23
269 0.22
270 0.2
271 0.2