FuNGI

G2QUF7

Protein Details

Accession

G2QUF7

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
12-66	AVVSSSQKSDKKHKRTKSDHKKKRSREDDDVALVEETPRKSKKTKSEDPNDADRG	Hydrophilic
73-97	VSIVDSPSSKKKRHRERDVNGEAHD	Hydrophilic
106-129	AEEARKEHKKSSKRSKDSEQPIPE	Basic
139-167	APAEEDRKQEKKRKEKKLKKQKVEDEAGI	Basic
173-198	QPEGLAQEKKKKRKSKERAKEASDVD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-37	DKKHKRTKSDHKKKRSR
82-87	KKKRHR
111-119	KEHKKSSKR
145-160	RKQEKKRKEKKLKKQK
180-192	EKKKKRKSKERAK

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.833, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like IPR005576 Rpb7-like_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
KEGG	ttt:THITE_2109250 -
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB PF03876 SHS2_Rpb7-N
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MSAPAGGSSQDAVVSSSQKSDKKHKRTKSDHKKKRSREDDDVALVEETPRKSKKTKSEDPNDADRGERREGAVSIVDSPSSKKKRHRERDVNGEAHDGVVEPPSTAEEARKEHKKSSKRSKDSEQPIPEPMVVDSSGAAPAEEDRKQEKKRKEKKLKKQKVEDEAGIHDESAQPEGLAQEKKKKRKSKERAKEASDVDATIQSQDMPAAAESFAELPADPDFPFFTQTISLYVPFFPVGFDKPLTNVAAQHLDPLVNHYSPVLRGVLLSYSNLNLSDRPAKASITHPPTDQTPALLHSIDEYAVGFGWLTFDANLFIPSRGKWMEGVVQLQSEGHIGVVCWNRFNASIEAKRLPAGWSWVDLTTGGAKQSASPVANEDGSGQDDQEEDMLDGEELQVVEQIHTTGYWVNERGRKVSGKLRFRIKNFDVGLAGDYGYLSIEGTCLDDDAERALAAQEREMERARRAKQSPGGLLRPLSRRVPEFSMTRFGKEDQEEDGGQRTVLYKGSRPGTPDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.14
3	0.19
4	0.25
5	0.28
6	0.34
7	0.44
8	0.53
9	0.62
10	0.71
11	0.75
12	0.81
13	0.87
14	0.93
15	0.93
16	0.94
17	0.94
18	0.95
19	0.96
20	0.95
21	0.95
22	0.94
23	0.92
24	0.9
25	0.87
26	0.83
27	0.76
28	0.67
29	0.57
30	0.47
31	0.37
32	0.3
33	0.27
34	0.22
35	0.25
36	0.27
37	0.3
38	0.36
39	0.44
40	0.53
41	0.58
42	0.67
43	0.7
44	0.77
45	0.83
46	0.83
47	0.83
48	0.76
49	0.67
50	0.6
51	0.54
52	0.48
53	0.42
54	0.37
55	0.29
56	0.29
57	0.28
58	0.27
59	0.25
60	0.21
61	0.19
62	0.18
63	0.17
64	0.15
65	0.18
66	0.26
67	0.3
68	0.36
69	0.43
70	0.54
71	0.65
72	0.75
73	0.83
74	0.84
75	0.86
76	0.91
77	0.9
78	0.84
79	0.73
80	0.65
81	0.54
82	0.42
83	0.33
84	0.22
85	0.14
86	0.11
87	0.1
88	0.07
89	0.07
90	0.08
91	0.09
92	0.09
93	0.12
94	0.14
95	0.19
96	0.27
97	0.35
98	0.37
99	0.44
100	0.53
101	0.59
102	0.65
103	0.72
104	0.76
105	0.76
106	0.81
107	0.82
108	0.83
109	0.82
110	0.82
111	0.77
112	0.69
113	0.63
114	0.57
115	0.48
116	0.39
117	0.3
118	0.22
119	0.16
120	0.13
121	0.1
122	0.09
123	0.09
124	0.08
125	0.08
126	0.06
127	0.07
128	0.12
129	0.13
130	0.15
131	0.2
132	0.28
133	0.36
134	0.45
135	0.53
136	0.6
137	0.69
138	0.78
139	0.84
140	0.87
141	0.91
142	0.94
143	0.95
144	0.94
145	0.94
146	0.91
147	0.89
148	0.84
149	0.75
150	0.66
151	0.57
152	0.5
153	0.39
154	0.3
155	0.21
156	0.17
157	0.14
158	0.12
159	0.1
160	0.07
161	0.07
162	0.08
163	0.12
164	0.14
165	0.15
166	0.25
167	0.33
168	0.43
169	0.52
170	0.61
171	0.67
172	0.75
173	0.84
174	0.86
175	0.89
176	0.9
177	0.9
178	0.86
179	0.82
180	0.72
181	0.66
182	0.54
183	0.43
184	0.33
185	0.25
186	0.2
187	0.13
188	0.12
189	0.07
190	0.06
191	0.06
192	0.05
193	0.05
194	0.04
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.05
204	0.06
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.08
210	0.1
211	0.09
212	0.09
213	0.09
214	0.09
215	0.1
216	0.1
217	0.11
218	0.09
219	0.1
220	0.09
221	0.09
222	0.08
223	0.07
224	0.07
225	0.08
226	0.09
227	0.1
228	0.09
229	0.1
230	0.12
231	0.13
232	0.12
233	0.11
234	0.11
235	0.13
236	0.12
237	0.12
238	0.11
239	0.1
240	0.09
241	0.12
242	0.12
243	0.1
244	0.1
245	0.09
246	0.1
247	0.09
248	0.11
249	0.08
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.06
257	0.06
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.09
263	0.14
264	0.14
265	0.16
266	0.16
267	0.16
268	0.17
269	0.2
270	0.25
271	0.26
272	0.27
273	0.25
274	0.25
275	0.26
276	0.28
277	0.25
278	0.19
279	0.13
280	0.14
281	0.15
282	0.14
283	0.12
284	0.09
285	0.1
286	0.08
287	0.08
288	0.06
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.04
293	0.03
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.05
300	0.06
301	0.07
302	0.07
303	0.08
304	0.09
305	0.09
306	0.13
307	0.12
308	0.13
309	0.12
310	0.13
311	0.17
312	0.17
313	0.19
314	0.16
315	0.15
316	0.15
317	0.14
318	0.13
319	0.08
320	0.06
321	0.05
322	0.04
323	0.04
324	0.1
325	0.15
326	0.15
327	0.15
328	0.15
329	0.16
330	0.17
331	0.21
332	0.19
333	0.21
334	0.24
335	0.28
336	0.3
337	0.29
338	0.29
339	0.26
340	0.24
341	0.18
342	0.19
343	0.15
344	0.15
345	0.16
346	0.16
347	0.15
348	0.14
349	0.14
350	0.12
351	0.12
352	0.11
353	0.1
354	0.09
355	0.1
356	0.12
357	0.15
358	0.13
359	0.13
360	0.15
361	0.16
362	0.17
363	0.16
364	0.14
365	0.12
366	0.13
367	0.13
368	0.1
369	0.09
370	0.09
371	0.09
372	0.08
373	0.08
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.05
380	0.06
381	0.05
382	0.05
383	0.07
384	0.07
385	0.08
386	0.08
387	0.08
388	0.07
389	0.07
390	0.08
391	0.08
392	0.09
393	0.12
394	0.15
395	0.2
396	0.25
397	0.27
398	0.29
399	0.32
400	0.33
401	0.35
402	0.41
403	0.45
404	0.49
405	0.54
406	0.62
407	0.65
408	0.65
409	0.71
410	0.65
411	0.64
412	0.56
413	0.52
414	0.43
415	0.36
416	0.34
417	0.24
418	0.21
419	0.12
420	0.1
421	0.08
422	0.07
423	0.06
424	0.05
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.07
433	0.07
434	0.08
435	0.09
436	0.07
437	0.08
438	0.09
439	0.12
440	0.12
441	0.13
442	0.17
443	0.19
444	0.23
445	0.27
446	0.29
447	0.33
448	0.41
449	0.44
450	0.48
451	0.49
452	0.54
453	0.57
454	0.62
455	0.64
456	0.63
457	0.63
458	0.56
459	0.57
460	0.55
461	0.53
462	0.5
463	0.46
464	0.43
465	0.43
466	0.45
467	0.47
468	0.45
469	0.44
470	0.44
471	0.48
472	0.45
473	0.45
474	0.42
475	0.39
476	0.41
477	0.39
478	0.37
479	0.31
480	0.34
481	0.32
482	0.31
483	0.33
484	0.26
485	0.23
486	0.22
487	0.2
488	0.17
489	0.2
490	0.22
491	0.22
492	0.29
493	0.34
494	0.35

G2QUF7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer