Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G2YZ40

Protein Details
Accession G2YZ40    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
188-212GGMGKRTEKKKTKAPEKGAVRKDGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-214KRTEKKKTKAPEKGAVRKDGRVR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, cyto 5.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019364  Mediatior_Med8_fun/met  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10232  Med8  
Amino Acid Sequences MALQQEDLKALEQTRQRLLHLTSNIASLKADFQRGAPLPEYSSIMTSSSILSTNIQSVIDHLAANSALLSRIVAFPSTNFPGRTQEGLLLQLLRKKLEPQVETWVDEGRNLQIDGTGDGEDIEETWKWAAEWIGPRIRQYALTEATDDYTWEERASGDVDNVNTGLKDEEDTDDEDEDEDEDEDEVMGGMGKRTEKKKTKAPEKGAVRKDGRVRTKEEILRFATSGVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.34
3 0.34
4 0.38
5 0.4
6 0.42
7 0.4
8 0.4
9 0.33
10 0.35
11 0.34
12 0.29
13 0.26
14 0.19
15 0.22
16 0.2
17 0.22
18 0.18
19 0.18
20 0.26
21 0.27
22 0.29
23 0.25
24 0.24
25 0.23
26 0.24
27 0.26
28 0.18
29 0.18
30 0.15
31 0.14
32 0.14
33 0.12
34 0.12
35 0.1
36 0.1
37 0.1
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.12
42 0.11
43 0.1
44 0.1
45 0.12
46 0.12
47 0.11
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.12
64 0.15
65 0.17
66 0.17
67 0.18
68 0.22
69 0.24
70 0.24
71 0.2
72 0.19
73 0.17
74 0.17
75 0.17
76 0.13
77 0.12
78 0.14
79 0.14
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.17
84 0.23
85 0.23
86 0.23
87 0.3
88 0.31
89 0.31
90 0.3
91 0.27
92 0.2
93 0.2
94 0.18
95 0.1
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.05
116 0.06
117 0.08
118 0.12
119 0.16
120 0.21
121 0.21
122 0.22
123 0.23
124 0.23
125 0.22
126 0.2
127 0.21
128 0.19
129 0.19
130 0.19
131 0.18
132 0.19
133 0.17
134 0.15
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.1
139 0.1
140 0.08
141 0.1
142 0.11
143 0.09
144 0.08
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.09
157 0.11
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.07
178 0.11
179 0.17
180 0.22
181 0.33
182 0.41
183 0.48
184 0.56
185 0.66
186 0.73
187 0.78
188 0.82
189 0.81
190 0.83
191 0.86
192 0.83
193 0.82
194 0.74
195 0.71
196 0.71
197 0.71
198 0.7
199 0.65
200 0.65
201 0.62
202 0.68
203 0.67
204 0.64
205 0.61
206 0.56
207 0.54
208 0.48