Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0TX37

Protein Details
Accession Q0TX37    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
286-307DDGTRGRRSNKRRKGESRGPLSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
290-302RGRRSNKRRKGES
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 9.5, cyto_mito 6, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040194  Cwf19-like  
IPR006768  Cwf19-like_C_dom-1  
IPR006767  Cwf19-like_C_dom-2  
IPR036265  HIT-like_sf  
Gene Ontology GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0061632  F:RNA lariat debranching enzyme activator activity  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pno:SNOG_15859  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04677  CwfJ_C_1  
PF04676  CwfJ_C_2  
CDD cd07380  MPP_CWF19_N  
Amino Acid Sequences MASKIVVVGDVNGHFRTVFQKLGALHAKNNFAFAIIAGSLFGDAEDVNSVDQSDVQLLIDGKIEVPLPTYFALTSRPLPPAVVEQLEASNDELCSNLFFLGKRSVTKTSENIRIVALGGQLDPNIIAGHSKDKYPPFYGETDAKTLRGATTADILITNEWPEDIRKRSRVEFQPDLQPQSQQCIADLDVLLKPRYHFSTSGGAFYEREPFFHAPSDETDNLYPITRFISMAAYGNPNKQKWIYAFSIDPSASHPASPPAGATACPVTLSEKKRPAPEHREQALVYDDGTRGRRSNKRRKGESRGPLSASECFFCLANENIATHLVTSIGDNAYVTTAKGPLSTSQTFPKLGFPCHMLIIPFTHQPTLGSMEEEERQATYGEMQKYRVAMNTMLKSVANEDYGSVTWEVSKSSLPHTHWQYLPVPSDLIRKGLVEAAFKALAENMHWPKFEKEDVADGFEETSDFFRILVWDPATDPSKQTSYVLRFDETIRFHSQFGREVLAKLLRLDQRIDWRDCGQTQAQEEQDVAKFKEAFTEFDFASE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.2
4 0.2
5 0.2
6 0.18
7 0.22
8 0.22
9 0.3
10 0.37
11 0.35
12 0.37
13 0.4
14 0.45
15 0.41
16 0.42
17 0.34
18 0.26
19 0.24
20 0.19
21 0.17
22 0.1
23 0.1
24 0.09
25 0.09
26 0.08
27 0.07
28 0.07
29 0.04
30 0.04
31 0.05
32 0.06
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.08
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.1
44 0.11
45 0.11
46 0.12
47 0.11
48 0.1
49 0.11
50 0.12
51 0.09
52 0.11
53 0.11
54 0.12
55 0.12
56 0.13
57 0.12
58 0.12
59 0.16
60 0.16
61 0.2
62 0.21
63 0.23
64 0.22
65 0.22
66 0.23
67 0.25
68 0.25
69 0.23
70 0.2
71 0.19
72 0.2
73 0.2
74 0.19
75 0.15
76 0.12
77 0.11
78 0.1
79 0.09
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.12
87 0.19
88 0.21
89 0.23
90 0.27
91 0.31
92 0.33
93 0.38
94 0.42
95 0.42
96 0.49
97 0.48
98 0.44
99 0.39
100 0.36
101 0.32
102 0.26
103 0.2
104 0.11
105 0.1
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.07
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.13
116 0.13
117 0.15
118 0.2
119 0.24
120 0.29
121 0.31
122 0.33
123 0.3
124 0.32
125 0.34
126 0.34
127 0.32
128 0.33
129 0.31
130 0.28
131 0.25
132 0.23
133 0.19
134 0.16
135 0.14
136 0.1
137 0.12
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.09
149 0.14
150 0.2
151 0.26
152 0.3
153 0.34
154 0.38
155 0.47
156 0.52
157 0.55
158 0.55
159 0.52
160 0.57
161 0.56
162 0.57
163 0.49
164 0.44
165 0.36
166 0.34
167 0.33
168 0.23
169 0.21
170 0.18
171 0.18
172 0.16
173 0.15
174 0.13
175 0.12
176 0.14
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.15
181 0.18
182 0.19
183 0.18
184 0.19
185 0.27
186 0.27
187 0.28
188 0.26
189 0.23
190 0.21
191 0.21
192 0.26
193 0.17
194 0.17
195 0.2
196 0.2
197 0.21
198 0.23
199 0.23
200 0.16
201 0.19
202 0.24
203 0.2
204 0.2
205 0.19
206 0.17
207 0.17
208 0.17
209 0.14
210 0.09
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.13
220 0.14
221 0.19
222 0.22
223 0.21
224 0.22
225 0.22
226 0.23
227 0.21
228 0.25
229 0.22
230 0.2
231 0.2
232 0.19
233 0.22
234 0.19
235 0.18
236 0.14
237 0.16
238 0.14
239 0.14
240 0.13
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.1
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.09
254 0.15
255 0.19
256 0.25
257 0.31
258 0.34
259 0.39
260 0.44
261 0.49
262 0.52
263 0.56
264 0.59
265 0.53
266 0.53
267 0.48
268 0.44
269 0.37
270 0.29
271 0.21
272 0.13
273 0.12
274 0.12
275 0.14
276 0.13
277 0.13
278 0.2
279 0.28
280 0.37
281 0.48
282 0.55
283 0.63
284 0.72
285 0.79
286 0.82
287 0.84
288 0.82
289 0.78
290 0.72
291 0.64
292 0.56
293 0.49
294 0.42
295 0.33
296 0.25
297 0.17
298 0.14
299 0.12
300 0.1
301 0.11
302 0.09
303 0.09
304 0.1
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.08
310 0.07
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.08
327 0.09
328 0.16
329 0.17
330 0.19
331 0.22
332 0.24
333 0.25
334 0.25
335 0.3
336 0.25
337 0.25
338 0.25
339 0.23
340 0.22
341 0.22
342 0.22
343 0.15
344 0.14
345 0.15
346 0.15
347 0.15
348 0.15
349 0.14
350 0.14
351 0.14
352 0.15
353 0.17
354 0.15
355 0.13
356 0.13
357 0.15
358 0.16
359 0.16
360 0.15
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.09
365 0.1
366 0.15
367 0.19
368 0.21
369 0.22
370 0.23
371 0.24
372 0.25
373 0.24
374 0.2
375 0.19
376 0.24
377 0.25
378 0.24
379 0.24
380 0.23
381 0.21
382 0.22
383 0.19
384 0.14
385 0.11
386 0.11
387 0.12
388 0.12
389 0.14
390 0.11
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.09
396 0.11
397 0.11
398 0.16
399 0.22
400 0.25
401 0.33
402 0.38
403 0.43
404 0.42
405 0.44
406 0.43
407 0.42
408 0.41
409 0.34
410 0.29
411 0.24
412 0.3
413 0.27
414 0.25
415 0.21
416 0.18
417 0.18
418 0.21
419 0.22
420 0.17
421 0.17
422 0.19
423 0.18
424 0.18
425 0.17
426 0.14
427 0.13
428 0.12
429 0.19
430 0.21
431 0.24
432 0.25
433 0.27
434 0.29
435 0.32
436 0.33
437 0.28
438 0.24
439 0.28
440 0.29
441 0.3
442 0.28
443 0.24
444 0.23
445 0.19
446 0.17
447 0.11
448 0.11
449 0.09
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.1
454 0.13
455 0.17
456 0.16
457 0.16
458 0.17
459 0.23
460 0.24
461 0.23
462 0.22
463 0.22
464 0.23
465 0.23
466 0.24
467 0.28
468 0.31
469 0.37
470 0.38
471 0.35
472 0.34
473 0.36
474 0.4
475 0.35
476 0.34
477 0.34
478 0.33
479 0.33
480 0.37
481 0.37
482 0.36
483 0.35
484 0.36
485 0.31
486 0.3
487 0.35
488 0.33
489 0.31
490 0.27
491 0.32
492 0.31
493 0.32
494 0.34
495 0.34
496 0.41
497 0.47
498 0.5
499 0.46
500 0.45
501 0.49
502 0.47
503 0.47
504 0.41
505 0.39
506 0.39
507 0.41
508 0.4
509 0.35
510 0.34
511 0.33
512 0.32
513 0.31
514 0.29
515 0.28
516 0.27
517 0.26
518 0.34
519 0.32
520 0.32
521 0.31
522 0.33