Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7TJM9

Protein Details
Accession A7TJM9    Localization Confidence High Confidence Score 25.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MAVTSDRKNNRKKAITKFNDLDFHydrophilic
46-74TSENKSVKTPAKSKKGKKNDPVKINGNGDHydrophilic
656-679GENMIKHKKEIQSRPKRTWFQSEAHydrophilic
687-752LDTLQKNKKTVNSKKRKRLEALEDNDNSRSYKKTQKDRVVDQERSMKKQKIANGKKSKNKKKFNKRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-63PAKSKKGKK
663-664KK
692-704KNKKTVNSKKRKR
730-752RSMKKQKIANGKKSKNKKKFNKR
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG vpo:Kpol_534p53  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17947  DEADc_DDX27  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MAVTSDRKNNRKKAITKFNDLDFVPTISDSEEDVPDLDDSDDELLTSENKSVKTPAKSKKGKKNDPVKINGNGDEVAEDLNPDFRFNIDGGELSTNFQGWDFVGDQKENDDDMKKDVDLDGIIRRKGGLLNMAHIEVAEEEEEEEEEEEEEEEEEEEELAMDGFGMGATKKNEQEEAGDEDDDDNEEEEEEEVDDDKEDDDEEREEDTAEEMASFYAPESESSEATSTVHSTFNSLTLSRPVLKGLSDLGYTKPSPIQSATIPIGLSGKDIIAGAVTGSGKTAAFMIPIIERLLYKPAKVASTRVIVLTPTRELAIQIADVGKKIGKYVSGLTFGLAVGGLNLRQQEQELKTRPDIVIATPGRFIDHVRNSSSFNVDSVEVLVMDEADRMLEEGFQEELNEILTLLPSKRQTLLFSATMNSRIKSLISLSLRKPVRIMINPPKQAAARLTQEFVRIRKRDHLKPALLFYLIRKLDGTGQKRIVVFVARKEMAHKLRIILGLLGMKVGELHGSLTQEQRLQSVNNFKSLEVPVLICTDLASRGLDIPKIEVVINFDMPKSYEIYLHRVGRTARAGREGRSVTFVGESSQDRSIVRSAIKSVEESSSKNKAVSRNVEWTQIEETNKLVESFGETIDDILVEEKQEKEILRAEMQLRKGENMIKHKKEIQSRPKRTWFQSEAEKKNAKILDTLQKNKKTVNSKKRKRLEALEDNDNSRSYKKTQKDRVVDQERSMKKQKIANGKKSKNKKKFNKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.84
3 0.84
4 0.8
5 0.74
6 0.69
7 0.61
8 0.54
9 0.45
10 0.38
11 0.29
12 0.24
13 0.2
14 0.15
15 0.16
16 0.13
17 0.14
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.14
22 0.13
23 0.13
24 0.12
25 0.09
26 0.1
27 0.11
28 0.1
29 0.08
30 0.09
31 0.08
32 0.09
33 0.1
34 0.13
35 0.15
36 0.16
37 0.18
38 0.24
39 0.31
40 0.39
41 0.48
42 0.54
43 0.61
44 0.71
45 0.79
46 0.84
47 0.88
48 0.89
49 0.9
50 0.91
51 0.9
52 0.89
53 0.88
54 0.83
55 0.8
56 0.74
57 0.67
58 0.58
59 0.48
60 0.39
61 0.31
62 0.24
63 0.17
64 0.12
65 0.1
66 0.08
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.14
73 0.13
74 0.15
75 0.11
76 0.11
77 0.12
78 0.16
79 0.16
80 0.15
81 0.16
82 0.14
83 0.13
84 0.13
85 0.11
86 0.08
87 0.11
88 0.11
89 0.15
90 0.18
91 0.18
92 0.18
93 0.2
94 0.21
95 0.19
96 0.2
97 0.19
98 0.17
99 0.19
100 0.22
101 0.2
102 0.19
103 0.18
104 0.17
105 0.14
106 0.16
107 0.2
108 0.23
109 0.23
110 0.23
111 0.22
112 0.22
113 0.23
114 0.23
115 0.22
116 0.18
117 0.22
118 0.24
119 0.24
120 0.22
121 0.2
122 0.19
123 0.12
124 0.11
125 0.08
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.04
154 0.07
155 0.09
156 0.13
157 0.15
158 0.17
159 0.19
160 0.19
161 0.21
162 0.21
163 0.24
164 0.23
165 0.21
166 0.19
167 0.18
168 0.18
169 0.16
170 0.13
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.04
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.13
221 0.14
222 0.12
223 0.12
224 0.14
225 0.16
226 0.16
227 0.16
228 0.16
229 0.15
230 0.14
231 0.14
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.12
236 0.12
237 0.15
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.15
242 0.16
243 0.16
244 0.17
245 0.14
246 0.19
247 0.19
248 0.17
249 0.17
250 0.15
251 0.15
252 0.12
253 0.12
254 0.08
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.14
281 0.14
282 0.13
283 0.15
284 0.16
285 0.19
286 0.2
287 0.21
288 0.18
289 0.2
290 0.21
291 0.19
292 0.17
293 0.15
294 0.16
295 0.15
296 0.12
297 0.1
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.07
314 0.08
315 0.11
316 0.13
317 0.15
318 0.15
319 0.14
320 0.14
321 0.13
322 0.12
323 0.08
324 0.06
325 0.03
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.11
334 0.13
335 0.21
336 0.24
337 0.27
338 0.27
339 0.29
340 0.28
341 0.25
342 0.23
343 0.16
344 0.21
345 0.19
346 0.19
347 0.17
348 0.17
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.15
353 0.19
354 0.2
355 0.22
356 0.23
357 0.25
358 0.25
359 0.26
360 0.19
361 0.14
362 0.13
363 0.11
364 0.1
365 0.09
366 0.08
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.04
371 0.03
372 0.03
373 0.03
374 0.02
375 0.02
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.04
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.04
389 0.03
390 0.04
391 0.05
392 0.05
393 0.08
394 0.08
395 0.1
396 0.12
397 0.13
398 0.14
399 0.16
400 0.2
401 0.19
402 0.18
403 0.19
404 0.18
405 0.22
406 0.22
407 0.18
408 0.15
409 0.14
410 0.14
411 0.13
412 0.13
413 0.14
414 0.17
415 0.21
416 0.22
417 0.3
418 0.3
419 0.29
420 0.29
421 0.26
422 0.28
423 0.27
424 0.35
425 0.37
426 0.46
427 0.48
428 0.48
429 0.46
430 0.4
431 0.39
432 0.32
433 0.26
434 0.22
435 0.21
436 0.22
437 0.21
438 0.26
439 0.27
440 0.28
441 0.33
442 0.3
443 0.31
444 0.39
445 0.45
446 0.48
447 0.55
448 0.59
449 0.55
450 0.55
451 0.56
452 0.48
453 0.42
454 0.35
455 0.26
456 0.27
457 0.22
458 0.2
459 0.17
460 0.16
461 0.22
462 0.3
463 0.32
464 0.3
465 0.32
466 0.35
467 0.35
468 0.34
469 0.28
470 0.26
471 0.24
472 0.21
473 0.26
474 0.23
475 0.23
476 0.25
477 0.32
478 0.31
479 0.32
480 0.29
481 0.24
482 0.26
483 0.27
484 0.25
485 0.18
486 0.15
487 0.14
488 0.12
489 0.11
490 0.08
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.05
495 0.03
496 0.05
497 0.06
498 0.08
499 0.09
500 0.11
501 0.12
502 0.14
503 0.14
504 0.15
505 0.15
506 0.15
507 0.19
508 0.27
509 0.27
510 0.3
511 0.31
512 0.29
513 0.32
514 0.31
515 0.28
516 0.19
517 0.18
518 0.13
519 0.14
520 0.14
521 0.1
522 0.09
523 0.09
524 0.08
525 0.09
526 0.08
527 0.07
528 0.1
529 0.11
530 0.12
531 0.12
532 0.12
533 0.12
534 0.13
535 0.13
536 0.11
537 0.14
538 0.14
539 0.16
540 0.15
541 0.15
542 0.14
543 0.15
544 0.15
545 0.14
546 0.12
547 0.15
548 0.17
549 0.23
550 0.29
551 0.32
552 0.32
553 0.33
554 0.33
555 0.34
556 0.39
557 0.38
558 0.33
559 0.37
560 0.39
561 0.37
562 0.45
563 0.42
564 0.35
565 0.34
566 0.32
567 0.24
568 0.24
569 0.22
570 0.15
571 0.16
572 0.17
573 0.16
574 0.17
575 0.17
576 0.16
577 0.18
578 0.19
579 0.19
580 0.19
581 0.18
582 0.19
583 0.21
584 0.22
585 0.21
586 0.21
587 0.23
588 0.23
589 0.24
590 0.29
591 0.32
592 0.32
593 0.33
594 0.35
595 0.36
596 0.43
597 0.47
598 0.47
599 0.49
600 0.49
601 0.53
602 0.5
603 0.46
604 0.42
605 0.39
606 0.35
607 0.27
608 0.26
609 0.22
610 0.22
611 0.2
612 0.15
613 0.11
614 0.13
615 0.14
616 0.13
617 0.12
618 0.12
619 0.12
620 0.11
621 0.11
622 0.07
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.09
627 0.09
628 0.11
629 0.13
630 0.14
631 0.16
632 0.21
633 0.24
634 0.24
635 0.28
636 0.32
637 0.35
638 0.38
639 0.4
640 0.36
641 0.34
642 0.35
643 0.35
644 0.38
645 0.43
646 0.5
647 0.5
648 0.54
649 0.6
650 0.64
651 0.68
652 0.72
653 0.72
654 0.73
655 0.78
656 0.82
657 0.85
658 0.87
659 0.82
660 0.82
661 0.76
662 0.71
663 0.73
664 0.73
665 0.7
666 0.71
667 0.7
668 0.6
669 0.62
670 0.58
671 0.48
672 0.42
673 0.42
674 0.42
675 0.47
676 0.57
677 0.59
678 0.63
679 0.64
680 0.65
681 0.66
682 0.67
683 0.68
684 0.7
685 0.72
686 0.76
687 0.85
688 0.9
689 0.91
690 0.88
691 0.87
692 0.86
693 0.86
694 0.81
695 0.8
696 0.74
697 0.68
698 0.61
699 0.53
700 0.44
701 0.35
702 0.33
703 0.29
704 0.35
705 0.42
706 0.51
707 0.6
708 0.69
709 0.76
710 0.81
711 0.86
712 0.86
713 0.81
714 0.77
715 0.76
716 0.72
717 0.71
718 0.7
719 0.65
720 0.62
721 0.63
722 0.64
723 0.65
724 0.7
725 0.73
726 0.76
727 0.8
728 0.84
729 0.9
730 0.93
731 0.92
732 0.93