Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R884

Protein Details
Accession C4R884    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
363-383LTGMVRKRKANVKNSPNKRTNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 9.166, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG ppa:PAS_chr4_0549  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MALSNEVEALVNQGVKLLASKKYDDAAEKFSNACELHLQETGRDDAGLLFLYGKALFENAVSKSEILGGQSEEQEEEKPQQDDEANEVGKDGTGNFSFSEDVPLAEADEDQVVAAEEEAEDEVQQEGPKDTKHDGNQQSASEEHEENENVPKEDSEFDIAWDVLDSARGLFEEQLKQHPQTVPDVPPLKGVRDEPKDQITKIKKNLADVYDFLGQVSLETENFAQASIDFANCLKYRKELYPAYSQLISESHYMISLALEFTKEEGANEEETLKLEEKARLQAVEHMKQAISCIKQRYSLPETTSKDENLLQDMEQRLQELERDPLKELEQQKMDILKGILGQATSNSSSEKEQDANKPVNDLTGMVRKRKANVKNSPNKRTN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.14
4 0.15
5 0.19
6 0.22
7 0.25
8 0.27
9 0.3
10 0.33
11 0.35
12 0.35
13 0.37
14 0.37
15 0.36
16 0.34
17 0.32
18 0.34
19 0.28
20 0.26
21 0.22
22 0.21
23 0.22
24 0.26
25 0.26
26 0.21
27 0.24
28 0.25
29 0.2
30 0.18
31 0.15
32 0.12
33 0.13
34 0.12
35 0.09
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.11
46 0.11
47 0.13
48 0.14
49 0.14
50 0.14
51 0.16
52 0.15
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.14
57 0.15
58 0.15
59 0.13
60 0.14
61 0.14
62 0.15
63 0.17
64 0.19
65 0.19
66 0.18
67 0.2
68 0.21
69 0.21
70 0.23
71 0.25
72 0.21
73 0.2
74 0.21
75 0.18
76 0.16
77 0.15
78 0.11
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.15
87 0.12
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.03
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.13
117 0.15
118 0.2
119 0.23
120 0.32
121 0.35
122 0.4
123 0.42
124 0.39
125 0.39
126 0.33
127 0.31
128 0.25
129 0.21
130 0.16
131 0.15
132 0.15
133 0.14
134 0.19
135 0.18
136 0.16
137 0.15
138 0.15
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.13
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.1
148 0.1
149 0.08
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.08
159 0.11
160 0.12
161 0.17
162 0.19
163 0.2
164 0.23
165 0.24
166 0.22
167 0.23
168 0.26
169 0.23
170 0.27
171 0.29
172 0.25
173 0.28
174 0.28
175 0.25
176 0.23
177 0.23
178 0.25
179 0.27
180 0.3
181 0.27
182 0.32
183 0.33
184 0.32
185 0.38
186 0.38
187 0.4
188 0.41
189 0.45
190 0.4
191 0.42
192 0.46
193 0.39
194 0.34
195 0.28
196 0.27
197 0.23
198 0.22
199 0.18
200 0.14
201 0.12
202 0.1
203 0.1
204 0.07
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.04
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.1
219 0.11
220 0.14
221 0.13
222 0.15
223 0.19
224 0.21
225 0.28
226 0.27
227 0.31
228 0.37
229 0.39
230 0.38
231 0.36
232 0.33
233 0.27
234 0.24
235 0.21
236 0.14
237 0.13
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.08
250 0.08
251 0.07
252 0.1
253 0.11
254 0.12
255 0.13
256 0.12
257 0.11
258 0.12
259 0.14
260 0.12
261 0.12
262 0.13
263 0.16
264 0.18
265 0.22
266 0.23
267 0.21
268 0.21
269 0.27
270 0.32
271 0.33
272 0.32
273 0.29
274 0.28
275 0.27
276 0.29
277 0.27
278 0.23
279 0.24
280 0.28
281 0.28
282 0.33
283 0.34
284 0.4
285 0.4
286 0.42
287 0.41
288 0.45
289 0.47
290 0.47
291 0.49
292 0.41
293 0.38
294 0.36
295 0.33
296 0.27
297 0.24
298 0.2
299 0.22
300 0.23
301 0.23
302 0.2
303 0.2
304 0.17
305 0.17
306 0.19
307 0.16
308 0.21
309 0.23
310 0.25
311 0.26
312 0.28
313 0.29
314 0.34
315 0.35
316 0.36
317 0.35
318 0.34
319 0.35
320 0.36
321 0.34
322 0.3
323 0.28
324 0.21
325 0.19
326 0.19
327 0.16
328 0.13
329 0.13
330 0.11
331 0.15
332 0.15
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.17
337 0.19
338 0.22
339 0.22
340 0.27
341 0.34
342 0.4
343 0.45
344 0.43
345 0.44
346 0.41
347 0.39
348 0.33
349 0.27
350 0.25
351 0.28
352 0.32
353 0.34
354 0.41
355 0.42
356 0.48
357 0.56
358 0.61
359 0.61
360 0.68
361 0.73
362 0.78
363 0.85