FuNGI

Q0UPQ0

Protein Details

Accession

Q0UPQ0

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
104-129	GVAPRAKMNQQRSRRFRAAREAKEKD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
798-814	RGGWRGGRGGGRGGGGR
986-998	GGARGGRGGGRGG

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto 6.5, cyto_pero 4.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0000956 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process GO:0051984 P:positive regulation of chromosome segregation GO:0106354 P:tRNA surveillance
KEGG	pno:SNOG_06264 -
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPAMFRWLSQKYPKIVSTVQEEQPKKVGDEVIPVDRTGPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDKPAPKTEADMMMAIFEYTDRVVGMVRPRKLLYMAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAREAKEKDEERAEFLKMLNSQKASRGEDINSLEEVVEKTWDSNAITPGTPFMHLLAESLQYWCAYKFTTDPSWKDMKVIISDASVPGEGEHKIMNFVRSQRAIPTHDPNTRHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFRVLREDVFFDSGKDKACTRCGRKGHIRNNCEFPDDGKKLTEEEAAEEWAASEHPPKPYIWLHTNILREYLAVEMETPKRRFKYDLERSLDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIRDQGIDLLISIWRDLAAEMDDYVTKDGFPDMRRVQQILGALASREADIFKKRKEVSDRQAANRARREAQQNGRGRGRGDDTYSSGPPQKRVKESTDTYLNSGTIFFDPKDAQSNDTRRDHAAMRSPMPEAEGTQETDSATGVEAPVELGKRKADELEDADNGTPGRNTPVVPASPAAETPKKEDGTPEDTIKLWEDGYEERYYEQKFHVAPDDIAFRNKVARQYAEGLCWVLAYYMQGCPSWTWYFPHHYAPFAADFVGLEDMDPRKLFEKGTPFHPYEQLMVLPFIDSKRLLDAMATKYPELSDDERKRNEFGKETLMFSQEGGLFDDVEKALYRKGVKKHSIDPAQSRALHGDIEPHDLFVLDSQLVPPFDVDGDSEFEIVQDGSMRVYYEMPRLNSKNAHKSVLLPGTKMPTPALSPGEAESVRRSNERGGWRGGRGGGRGGGGRGGFNDRRNNDNMRGDYQNGGRGGYNNGGRGGYNNGGGRGGYNGNQGGYGAPQNFPPPFPNSWPPPPGGANFVPPPPPGWVPPPQQGGYQGGGGYGGPPGMPPAQRPAWMGNAPPHHGGPPPQQAGNNSSLRNEQYYRPADEILGRNGGGSGGYGGHRNDNPYNDRQPRNDRGGARGGRGGGRGGGGGGGGGYGGGGNRQSHNSNDYR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.52
3	0.53
4	0.52
5	0.5
6	0.49
7	0.49
8	0.49
9	0.53
10	0.53
11	0.5
12	0.53
13	0.5
14	0.43
15	0.4
16	0.38
17	0.3
18	0.36
19	0.37
20	0.38
21	0.37
22	0.36
23	0.34
24	0.32
25	0.32
26	0.31
27	0.3
28	0.27
29	0.28
30	0.3
31	0.3
32	0.3
33	0.32
34	0.28
35	0.27
36	0.23
37	0.21
38	0.21
39	0.17
40	0.16
41	0.13
42	0.1
43	0.08
44	0.09
45	0.09
46	0.09
47	0.1
48	0.13
49	0.18
50	0.21
51	0.22
52	0.29
53	0.38
54	0.46
55	0.53
56	0.56
57	0.54
58	0.51
59	0.53
60	0.5
61	0.45
62	0.38
63	0.31
64	0.25
65	0.22
66	0.21
67	0.17
68	0.12
69	0.08
70	0.07
71	0.06
72	0.07
73	0.06
74	0.06
75	0.07
76	0.11
77	0.21
78	0.28
79	0.3
80	0.34
81	0.35
82	0.36
83	0.37
84	0.38
85	0.32
86	0.31
87	0.3
88	0.26
89	0.27
90	0.25
91	0.25
92	0.23
93	0.19
94	0.12
95	0.15
96	0.21
97	0.28
98	0.39
99	0.46
100	0.55
101	0.66
102	0.74
103	0.79
104	0.83
105	0.81
106	0.77
107	0.79
108	0.79
109	0.79
110	0.81
111	0.78
112	0.72
113	0.75
114	0.7
115	0.64
116	0.61
117	0.52
118	0.47
119	0.43
120	0.4
121	0.33
122	0.32
123	0.31
124	0.28
125	0.32
126	0.31
127	0.32
128	0.32
129	0.37
130	0.42
131	0.41
132	0.4
133	0.39
134	0.36
135	0.39
136	0.4
137	0.36
138	0.3
139	0.26
140	0.22
141	0.2
142	0.19
143	0.13
144	0.11
145	0.09
146	0.1
147	0.1
148	0.12
149	0.12
150	0.15
151	0.17
152	0.18
153	0.18
154	0.18
155	0.19
156	0.19
157	0.18
158	0.15
159	0.13
160	0.12
161	0.12
162	0.13
163	0.12
164	0.12
165	0.12
166	0.12
167	0.12
168	0.11
169	0.12
170	0.11
171	0.11
172	0.1
173	0.11
174	0.12
175	0.17
176	0.26
177	0.32
178	0.34
179	0.39
180	0.44
181	0.43
182	0.42
183	0.4
184	0.34
185	0.3
186	0.29
187	0.24
188	0.19
189	0.2
190	0.18
191	0.16
192	0.13
193	0.11
194	0.09
195	0.1
196	0.09
197	0.09
198	0.1
199	0.09
200	0.13
201	0.14
202	0.16
203	0.18
204	0.21
205	0.27
206	0.28
207	0.28
208	0.3
209	0.34
210	0.37
211	0.39
212	0.44
213	0.45
214	0.49
215	0.5
216	0.48
217	0.51
218	0.47
219	0.42
220	0.34
221	0.28
222	0.23
223	0.23
224	0.2
225	0.12
226	0.11
227	0.1
228	0.09
229	0.08
230	0.06
231	0.04
232	0.03
233	0.03
234	0.04
235	0.05
236	0.06
237	0.07
238	0.08
239	0.14
240	0.16
241	0.15
242	0.19
243	0.22
244	0.26
245	0.26
246	0.27
247	0.24
248	0.25
249	0.25
250	0.22
251	0.2
252	0.17
253	0.18
254	0.18
255	0.18
256	0.19
257	0.27
258	0.35
259	0.4
260	0.47
261	0.5
262	0.57
263	0.66
264	0.73
265	0.74
266	0.75
267	0.75
268	0.71
269	0.74
270	0.66
271	0.58
272	0.48
273	0.42
274	0.42
275	0.37
276	0.33
277	0.27
278	0.26
279	0.25
280	0.26
281	0.25
282	0.15
283	0.16
284	0.16
285	0.16
286	0.15
287	0.13
288	0.12
289	0.09
290	0.09
291	0.07
292	0.1
293	0.12
294	0.14
295	0.15
296	0.15
297	0.2
298	0.23
299	0.28
300	0.29
301	0.31
302	0.32
303	0.36
304	0.39
305	0.35
306	0.33
307	0.27
308	0.22
309	0.18
310	0.15
311	0.1
312	0.07
313	0.07
314	0.1
315	0.15
316	0.23
317	0.25
318	0.29
319	0.31
320	0.33
321	0.36
322	0.38
323	0.44
324	0.47
325	0.55
326	0.56
327	0.57
328	0.56
329	0.59
330	0.52
331	0.41
332	0.3
333	0.21
334	0.15
335	0.13
336	0.11
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.07
344	0.07
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.07
349	0.08
350	0.12
351	0.14
352	0.14
353	0.14
354	0.14
355	0.14
356	0.13
357	0.13
358	0.08
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.07
374	0.07
375	0.08
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.1
381	0.1
382	0.17
383	0.19
384	0.24
385	0.25
386	0.26
387	0.25
388	0.24
389	0.24
390	0.18
391	0.16
392	0.11
393	0.1
394	0.09
395	0.09
396	0.07
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.14
401	0.18
402	0.19
403	0.27
404	0.28
405	0.34
406	0.41
407	0.48
408	0.49
409	0.56
410	0.59
411	0.55
412	0.63
413	0.61
414	0.59
415	0.56
416	0.52
417	0.44
418	0.43
419	0.45
420	0.45
421	0.48
422	0.5
423	0.51
424	0.53
425	0.53
426	0.5
427	0.45
428	0.39
429	0.35
430	0.28
431	0.24
432	0.21
433	0.21
434	0.23
435	0.22
436	0.22
437	0.23
438	0.23
439	0.26
440	0.31
441	0.33
442	0.35
443	0.39
444	0.42
445	0.44
446	0.45
447	0.45
448	0.45
449	0.4
450	0.37
451	0.34
452	0.29
453	0.22
454	0.19
455	0.15
456	0.09
457	0.09
458	0.08
459	0.09
460	0.09
461	0.1
462	0.16
463	0.15
464	0.17
465	0.23
466	0.28
467	0.32
468	0.34
469	0.34
470	0.29
471	0.31
472	0.3
473	0.27
474	0.3
475	0.26
476	0.26
477	0.26
478	0.26
479	0.23
480	0.22
481	0.19
482	0.12
483	0.12
484	0.11
485	0.11
486	0.1
487	0.11
488	0.1
489	0.1
490	0.09
491	0.06
492	0.05
493	0.04
494	0.04
495	0.03
496	0.03
497	0.03
498	0.04
499	0.05
500	0.05
501	0.06
502	0.07
503	0.07
504	0.08
505	0.09
506	0.08
507	0.1
508	0.13
509	0.15
510	0.15
511	0.15
512	0.15
513	0.14
514	0.14
515	0.12
516	0.08
517	0.06
518	0.07
519	0.08
520	0.08
521	0.09
522	0.12
523	0.12
524	0.13
525	0.13
526	0.12
527	0.11
528	0.12
529	0.14
530	0.14
531	0.15
532	0.18
533	0.23
534	0.22
535	0.22
536	0.23
537	0.24
538	0.27
539	0.28
540	0.25
541	0.21
542	0.21
543	0.21
544	0.21
545	0.16
546	0.1
547	0.08
548	0.09
549	0.09
550	0.12
551	0.12
552	0.11
553	0.11
554	0.14
555	0.15
556	0.15
557	0.14
558	0.15
559	0.15
560	0.16
561	0.19
562	0.17
563	0.17
564	0.17
565	0.21
566	0.17
567	0.18
568	0.17
569	0.14
570	0.16
571	0.18
572	0.2
573	0.18
574	0.18
575	0.2
576	0.25
577	0.26
578	0.24
579	0.22
580	0.19
581	0.16
582	0.15
583	0.12
584	0.06
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.07
590	0.07
591	0.08
592	0.08
593	0.12
594	0.13
595	0.13
596	0.15
597	0.17
598	0.22
599	0.24
600	0.31
601	0.28
602	0.27
603	0.27
604	0.26
605	0.24
606	0.19
607	0.17
608	0.09
609	0.08
610	0.08
611	0.08
612	0.06
613	0.05
614	0.07
615	0.08
616	0.09
617	0.09
618	0.09
619	0.1
620	0.11
621	0.12
622	0.14
623	0.21
624	0.22
625	0.28
626	0.33
627	0.33
628	0.34
629	0.36
630	0.33
631	0.26
632	0.25
633	0.2
634	0.15
635	0.13
636	0.11
637	0.09
638	0.09
639	0.08
640	0.09
641	0.08
642	0.08
643	0.09
644	0.1
645	0.09
646	0.09
647	0.14
648	0.16
649	0.2
650	0.21
651	0.19
652	0.19
653	0.19
654	0.19
655	0.18
656	0.18
657	0.25
658	0.31
659	0.39
660	0.42
661	0.44
662	0.45
663	0.46
664	0.46
665	0.39
666	0.34
667	0.35
668	0.33
669	0.34
670	0.33
671	0.3
672	0.26
673	0.22
674	0.22
675	0.16
676	0.15
677	0.14
678	0.13
679	0.11
680	0.11
681	0.13
682	0.1
683	0.09
684	0.09
685	0.08
686	0.08
687	0.12
688	0.15
689	0.2
690	0.27
691	0.36
692	0.43
693	0.47
694	0.53
695	0.59
696	0.63
697	0.62
698	0.6
699	0.56
700	0.55
701	0.5
702	0.44
703	0.36
704	0.3
705	0.25
706	0.2
707	0.2
708	0.16
709	0.22
710	0.21
711	0.19
712	0.18
713	0.18
714	0.18
715	0.12
716	0.12
717	0.06
718	0.06
719	0.07
720	0.09
721	0.09
722	0.1
723	0.09
724	0.08
725	0.08
726	0.08
727	0.08
728	0.07
729	0.1
730	0.1
731	0.1
732	0.09
733	0.09
734	0.09
735	0.09
736	0.07
737	0.06
738	0.06
739	0.06
740	0.07
741	0.07
742	0.07
743	0.1
744	0.11
745	0.16
746	0.2
747	0.22
748	0.29
749	0.3
750	0.34
751	0.39
752	0.45
753	0.49
754	0.48
755	0.49
756	0.42
757	0.43
758	0.46
759	0.48
760	0.41
761	0.32
762	0.31
763	0.33
764	0.33
765	0.31
766	0.24
767	0.17
768	0.18
769	0.2
770	0.2
771	0.17
772	0.17
773	0.17
774	0.2
775	0.19
776	0.19
777	0.19
778	0.21
779	0.22
780	0.22
781	0.23
782	0.23
783	0.3
784	0.36
785	0.35
786	0.39
787	0.41
788	0.41
789	0.42
790	0.41
791	0.37
792	0.31
793	0.29
794	0.24
795	0.21
796	0.21
797	0.18
798	0.17
799	0.15
800	0.14
801	0.13
802	0.19
803	0.21
804	0.26
805	0.34
806	0.34
807	0.39
808	0.43
809	0.47
810	0.47
811	0.5
812	0.48
813	0.44
814	0.45
815	0.42
816	0.42
817	0.38
818	0.37
819	0.29
820	0.27
821	0.23
822	0.22
823	0.23
824	0.24
825	0.24
826	0.21
827	0.22
828	0.21
829	0.2
830	0.2
831	0.22
832	0.18
833	0.2
834	0.2
835	0.19
836	0.19
837	0.19
838	0.18
839	0.16
840	0.16
841	0.13
842	0.16
843	0.16
844	0.16
845	0.16
846	0.15
847	0.13
848	0.13
849	0.16
850	0.14
851	0.13
852	0.14
853	0.19
854	0.2
855	0.21
856	0.23
857	0.24
858	0.26
859	0.32
860	0.38
861	0.41
862	0.48
863	0.49
864	0.47
865	0.46
866	0.45
867	0.4
868	0.39
869	0.33
870	0.31
871	0.31
872	0.31
873	0.3
874	0.27
875	0.28
876	0.26
877	0.27
878	0.24
879	0.27
880	0.33
881	0.36
882	0.43
883	0.47
884	0.44
885	0.43
886	0.44
887	0.42
888	0.36
889	0.31
890	0.24
891	0.17
892	0.16
893	0.14
894	0.12
895	0.08
896	0.07
897	0.05
898	0.05
899	0.08
900	0.12
901	0.13
902	0.14
903	0.21
904	0.24
905	0.27
906	0.29
907	0.3
908	0.33
909	0.34
910	0.35
911	0.36
912	0.38
913	0.39
914	0.39
915	0.37
916	0.32
917	0.33
918	0.35
919	0.36
920	0.4
921	0.41
922	0.41
923	0.42
924	0.44
925	0.46
926	0.48
927	0.44
928	0.36
929	0.34
930	0.36
931	0.36
932	0.38
933	0.36
934	0.33
935	0.37
936	0.41
937	0.43
938	0.41
939	0.39
940	0.35
941	0.4
942	0.4
943	0.34
944	0.32
945	0.28
946	0.26
947	0.25
948	0.23
949	0.16
950	0.12
951	0.09
952	0.08
953	0.09
954	0.12
955	0.13
956	0.19
957	0.21
958	0.27
959	0.3
960	0.36
961	0.41
962	0.46
963	0.55
964	0.58
965	0.63
966	0.66
967	0.71
968	0.72
969	0.74
970	0.74
971	0.67
972	0.63
973	0.67
974	0.62
975	0.56
976	0.51
977	0.45
978	0.4
979	0.39
980	0.34
981	0.25
982	0.22
983	0.18
984	0.15
985	0.12
986	0.09
987	0.08
988	0.06
989	0.05
990	0.04
991	0.03
992	0.03
993	0.03
994	0.03
995	0.05
996	0.08
997	0.11
998	0.14
999	0.18
1000	0.21
1001	0.25

Q0UPQ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer