Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R1P3

Protein Details
Accession C4R1P3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
366-389FDHFNKFHHKRKYRLNEKGDQKLEBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019680  Mediator_Med1  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG ppa:PAS_chr2-1_0886  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10744  Med1  
Amino Acid Sequences MPPVDPELALSLDEVSQILLKRPGAVGIKGIKRLSNLYGFETFTDIIDPVNKASAIQSPGPLGMNEKELSTIERLTIAGKIILIDIDFQEQKVSDVSLSLAIVTKLISGKDKGKLNFIDKACEPNIEKLLLQNLNESTLDDFNRNLRLLSLLDKLSNSVSLNDQLNRETGSGNDELSHERKYDLFNYMHILSFNLHRVYEYQVSHLDELDYKSPFLSDRNDISCFVREGLGGIGKVELNVGGRCGVFLKFWEDHRFVTQQLKQRVPNDEIHNDNFLLHFKIKEVDNEYCIKNIDTRIVYKEKWFEEGRWLVDSGKNDNDIVKFSVTLVAELLPTVWVPYDLLYKWNIDDIDEAEPDVKNNRLDALFDHFNKFHHKRKYRLNEKGDQKLEISMMSPCRFVKLHKLSHRVEQIQSIVDDLRTWCVISSFIRNVLSSCESEEETRTNVKSELNVDDVKLVEFVSEKPIIVNNRRDDEFRLSFSPSMDDLDHMLTTVEFKENNVYKKLQFSIIRGILDDVKPLTDNIDESTVKIKAWKVFRTEQILRSFQVIKNS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.08
3 0.1
4 0.11
5 0.14
6 0.17
7 0.18
8 0.19
9 0.2
10 0.25
11 0.26
12 0.26
13 0.29
14 0.33
15 0.38
16 0.42
17 0.43
18 0.39
19 0.38
20 0.41
21 0.39
22 0.38
23 0.35
24 0.34
25 0.35
26 0.34
27 0.32
28 0.32
29 0.27
30 0.2
31 0.19
32 0.14
33 0.12
34 0.15
35 0.15
36 0.12
37 0.15
38 0.14
39 0.13
40 0.15
41 0.19
42 0.2
43 0.21
44 0.22
45 0.21
46 0.22
47 0.23
48 0.22
49 0.2
50 0.17
51 0.2
52 0.18
53 0.17
54 0.17
55 0.17
56 0.19
57 0.18
58 0.17
59 0.14
60 0.14
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.13
65 0.11
66 0.1
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.13
77 0.13
78 0.14
79 0.13
80 0.13
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.13
95 0.15
96 0.2
97 0.26
98 0.33
99 0.33
100 0.38
101 0.42
102 0.44
103 0.48
104 0.44
105 0.44
106 0.38
107 0.43
108 0.36
109 0.36
110 0.33
111 0.3
112 0.32
113 0.28
114 0.27
115 0.23
116 0.29
117 0.27
118 0.25
119 0.24
120 0.21
121 0.22
122 0.22
123 0.21
124 0.16
125 0.16
126 0.17
127 0.14
128 0.15
129 0.15
130 0.19
131 0.19
132 0.17
133 0.14
134 0.15
135 0.15
136 0.18
137 0.19
138 0.16
139 0.17
140 0.17
141 0.17
142 0.16
143 0.16
144 0.14
145 0.11
146 0.12
147 0.15
148 0.17
149 0.19
150 0.19
151 0.18
152 0.19
153 0.18
154 0.17
155 0.14
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.15
163 0.16
164 0.18
165 0.14
166 0.14
167 0.16
168 0.17
169 0.19
170 0.21
171 0.2
172 0.19
173 0.23
174 0.23
175 0.22
176 0.19
177 0.17
178 0.13
179 0.14
180 0.17
181 0.14
182 0.13
183 0.13
184 0.14
185 0.18
186 0.22
187 0.2
188 0.19
189 0.21
190 0.23
191 0.22
192 0.21
193 0.18
194 0.14
195 0.15
196 0.16
197 0.13
198 0.12
199 0.11
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.14
204 0.15
205 0.18
206 0.21
207 0.22
208 0.23
209 0.25
210 0.24
211 0.21
212 0.18
213 0.15
214 0.12
215 0.11
216 0.11
217 0.1
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.08
232 0.08
233 0.06
234 0.07
235 0.12
236 0.12
237 0.15
238 0.2
239 0.21
240 0.21
241 0.24
242 0.25
243 0.21
244 0.27
245 0.29
246 0.31
247 0.35
248 0.39
249 0.39
250 0.42
251 0.45
252 0.41
253 0.43
254 0.4
255 0.38
256 0.36
257 0.34
258 0.32
259 0.27
260 0.24
261 0.18
262 0.14
263 0.13
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.11
268 0.11
269 0.13
270 0.17
271 0.16
272 0.18
273 0.21
274 0.21
275 0.19
276 0.19
277 0.17
278 0.15
279 0.14
280 0.16
281 0.14
282 0.15
283 0.19
284 0.22
285 0.22
286 0.23
287 0.28
288 0.24
289 0.28
290 0.27
291 0.23
292 0.27
293 0.29
294 0.28
295 0.24
296 0.24
297 0.2
298 0.21
299 0.22
300 0.18
301 0.17
302 0.16
303 0.15
304 0.16
305 0.16
306 0.15
307 0.15
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.14
312 0.12
313 0.11
314 0.1
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.03
324 0.04
325 0.05
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.13
333 0.12
334 0.1
335 0.11
336 0.11
337 0.13
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.12
344 0.12
345 0.1
346 0.11
347 0.13
348 0.12
349 0.13
350 0.14
351 0.19
352 0.21
353 0.23
354 0.26
355 0.24
356 0.25
357 0.34
358 0.38
359 0.39
360 0.45
361 0.51
362 0.55
363 0.66
364 0.75
365 0.77
366 0.82
367 0.81
368 0.8
369 0.8
370 0.82
371 0.73
372 0.63
373 0.53
374 0.44
375 0.37
376 0.28
377 0.21
378 0.15
379 0.18
380 0.17
381 0.19
382 0.17
383 0.2
384 0.2
385 0.21
386 0.28
387 0.32
388 0.41
389 0.48
390 0.56
391 0.55
392 0.63
393 0.69
394 0.61
395 0.54
396 0.48
397 0.41
398 0.35
399 0.32
400 0.26
401 0.18
402 0.15
403 0.15
404 0.12
405 0.12
406 0.11
407 0.11
408 0.1
409 0.09
410 0.11
411 0.12
412 0.18
413 0.18
414 0.21
415 0.22
416 0.22
417 0.22
418 0.24
419 0.25
420 0.19
421 0.19
422 0.18
423 0.18
424 0.19
425 0.21
426 0.18
427 0.18
428 0.22
429 0.21
430 0.21
431 0.21
432 0.21
433 0.22
434 0.23
435 0.24
436 0.24
437 0.24
438 0.23
439 0.23
440 0.22
441 0.19
442 0.16
443 0.13
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.13
448 0.14
449 0.13
450 0.14
451 0.19
452 0.26
453 0.32
454 0.39
455 0.4
456 0.45
457 0.47
458 0.48
459 0.48
460 0.49
461 0.45
462 0.41
463 0.38
464 0.36
465 0.35
466 0.34
467 0.32
468 0.24
469 0.24
470 0.2
471 0.18
472 0.16
473 0.17
474 0.16
475 0.13
476 0.13
477 0.1
478 0.11
479 0.12
480 0.13
481 0.11
482 0.12
483 0.21
484 0.27
485 0.31
486 0.34
487 0.36
488 0.36
489 0.42
490 0.44
491 0.43
492 0.41
493 0.4
494 0.46
495 0.46
496 0.44
497 0.39
498 0.38
499 0.36
500 0.32
501 0.31
502 0.22
503 0.19
504 0.19
505 0.18
506 0.18
507 0.14
508 0.15
509 0.15
510 0.2
511 0.19
512 0.2
513 0.24
514 0.23
515 0.22
516 0.25
517 0.28
518 0.29
519 0.36
520 0.41
521 0.44
522 0.5
523 0.57
524 0.63
525 0.64
526 0.64
527 0.64
528 0.62
529 0.55
530 0.53
531 0.51