Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R043

Protein Details
Accession C4R043    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
270-291LDNVCTKYRRWRMRKLVWRMEEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9.5, mito 5, cyto 4.5, extr 1, pero 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024391  LDB19_N  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000138  C:Golgi trans cisterna  
GO:0005886  C:plasma membrane  
GO:0031625  F:ubiquitin protein ligase binding  
GO:0002092  P:positive regulation of receptor internalization  
GO:0070086  P:ubiquitin-dependent endocytosis  
KEGG ppa:PAS_chr2-1_0255  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13002  LDB19  
Amino Acid Sequences MAIFGSRLVRKDDKNASGLGGPSPSNTNLHSSPVKLSISLESPPVVLYGQPHESTGSILSGLLSLDVLSYTQIASPTMSGSNSPGILTPVRSTSSLNVLTPTTSLTMSQDYSKLDSIEIVNVTLSFVQTITYGKPLAPPSNTLQNCPDCKQKKLELARWDILAQPTSFAKGAVHAYPFSHLLPGALPATTLLGNTNTVIKYELVADAEYLNARKKPEYLRIKLPIIIKRSILRGPDRNSLRVFPPTDVTATAVLPNVVYPKSTFPIELRLDNVCTKYRRWRMRKLVWRMEEHIKVRAVSCEKHETKLKVLQDYANKQHHRFKRPHNTGGQTFTHLSVGTASGHDINTNGPINPVRTVTTEEEVAITPAAGGIDHVALTQEALAQEQAREYESRYGGSAANSNSENHNNNTNSSNTENSNIPIDHFNDERGSNKPVLFLEEIRTISQGEIKSGWKSDFSGKGVVELVADINIMNLSSIALDSSLSNLSSVTSQNCNQPMFNHDDLFVSSMANCSCDLSEKELGVFVSHLLVVEIVVAEELIQRKGVTHTHRGSNSQAKSPSVRFGGVNGGGNAFEQTHSSEPADDTDELRFQLSNNSELPVSEVTSEQDNDSVVGIATGVARVLRMQFKVLLTERSGLGVSWDDEVPPTYENVSALSPPTYDQARKPEGPMTGEDLTPPTHPAGAHTRERETPLNSSPSMVTPGVLYGIGDTPGVSIDGVLQLDDAIQELKLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.5
3 0.46
4 0.42
5 0.39
6 0.32
7 0.25
8 0.2
9 0.19
10 0.22
11 0.21
12 0.21
13 0.21
14 0.25
15 0.23
16 0.29
17 0.3
18 0.29
19 0.31
20 0.34
21 0.33
22 0.27
23 0.28
24 0.26
25 0.26
26 0.25
27 0.23
28 0.19
29 0.18
30 0.17
31 0.16
32 0.13
33 0.11
34 0.12
35 0.16
36 0.2
37 0.2
38 0.21
39 0.21
40 0.21
41 0.21
42 0.2
43 0.15
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.07
50 0.06
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.05
56 0.05
57 0.06
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.09
63 0.11
64 0.12
65 0.12
66 0.12
67 0.14
68 0.16
69 0.15
70 0.15
71 0.14
72 0.15
73 0.16
74 0.18
75 0.17
76 0.17
77 0.19
78 0.19
79 0.21
80 0.2
81 0.26
82 0.26
83 0.25
84 0.24
85 0.22
86 0.22
87 0.2
88 0.19
89 0.14
90 0.11
91 0.12
92 0.12
93 0.14
94 0.15
95 0.17
96 0.18
97 0.18
98 0.21
99 0.22
100 0.2
101 0.17
102 0.18
103 0.17
104 0.18
105 0.17
106 0.14
107 0.13
108 0.12
109 0.13
110 0.11
111 0.1
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.17
122 0.2
123 0.25
124 0.25
125 0.27
126 0.29
127 0.39
128 0.4
129 0.38
130 0.4
131 0.42
132 0.45
133 0.44
134 0.5
135 0.44
136 0.48
137 0.52
138 0.52
139 0.55
140 0.6
141 0.64
142 0.62
143 0.66
144 0.64
145 0.58
146 0.52
147 0.46
148 0.38
149 0.33
150 0.25
151 0.19
152 0.17
153 0.18
154 0.17
155 0.14
156 0.12
157 0.12
158 0.15
159 0.15
160 0.17
161 0.15
162 0.16
163 0.17
164 0.19
165 0.16
166 0.14
167 0.12
168 0.11
169 0.1
170 0.12
171 0.1
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.09
182 0.12
183 0.1
184 0.11
185 0.12
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.12
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.11
198 0.13
199 0.14
200 0.15
201 0.19
202 0.24
203 0.34
204 0.42
205 0.45
206 0.51
207 0.56
208 0.57
209 0.57
210 0.57
211 0.52
212 0.47
213 0.44
214 0.37
215 0.33
216 0.35
217 0.34
218 0.32
219 0.34
220 0.37
221 0.4
222 0.46
223 0.47
224 0.47
225 0.46
226 0.44
227 0.4
228 0.38
229 0.35
230 0.27
231 0.26
232 0.23
233 0.22
234 0.2
235 0.19
236 0.14
237 0.13
238 0.12
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.1
248 0.13
249 0.13
250 0.14
251 0.13
252 0.21
253 0.22
254 0.22
255 0.22
256 0.21
257 0.23
258 0.24
259 0.25
260 0.22
261 0.22
262 0.24
263 0.32
264 0.4
265 0.48
266 0.54
267 0.62
268 0.68
269 0.76
270 0.83
271 0.83
272 0.84
273 0.78
274 0.75
275 0.69
276 0.65
277 0.61
278 0.53
279 0.47
280 0.39
281 0.34
282 0.3
283 0.31
284 0.27
285 0.22
286 0.25
287 0.3
288 0.3
289 0.33
290 0.38
291 0.35
292 0.36
293 0.41
294 0.39
295 0.32
296 0.32
297 0.33
298 0.34
299 0.38
300 0.41
301 0.44
302 0.43
303 0.44
304 0.51
305 0.55
306 0.55
307 0.57
308 0.6
309 0.63
310 0.68
311 0.72
312 0.7
313 0.68
314 0.63
315 0.61
316 0.51
317 0.43
318 0.36
319 0.3
320 0.23
321 0.18
322 0.15
323 0.1
324 0.1
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.08
334 0.09
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.11
339 0.11
340 0.12
341 0.1
342 0.11
343 0.15
344 0.15
345 0.16
346 0.15
347 0.14
348 0.14
349 0.13
350 0.12
351 0.08
352 0.06
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.08
377 0.12
378 0.12
379 0.13
380 0.13
381 0.14
382 0.14
383 0.14
384 0.16
385 0.12
386 0.13
387 0.14
388 0.14
389 0.15
390 0.18
391 0.19
392 0.17
393 0.23
394 0.22
395 0.23
396 0.24
397 0.23
398 0.22
399 0.21
400 0.22
401 0.16
402 0.18
403 0.17
404 0.16
405 0.17
406 0.15
407 0.14
408 0.14
409 0.15
410 0.15
411 0.15
412 0.15
413 0.15
414 0.15
415 0.16
416 0.16
417 0.17
418 0.17
419 0.17
420 0.18
421 0.16
422 0.19
423 0.19
424 0.17
425 0.18
426 0.19
427 0.2
428 0.18
429 0.19
430 0.15
431 0.14
432 0.17
433 0.14
434 0.11
435 0.13
436 0.14
437 0.15
438 0.16
439 0.16
440 0.13
441 0.15
442 0.19
443 0.21
444 0.21
445 0.24
446 0.22
447 0.23
448 0.23
449 0.21
450 0.16
451 0.11
452 0.09
453 0.06
454 0.06
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.03
465 0.03
466 0.04
467 0.04
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.07
475 0.09
476 0.1
477 0.13
478 0.15
479 0.2
480 0.23
481 0.24
482 0.23
483 0.23
484 0.24
485 0.28
486 0.28
487 0.24
488 0.21
489 0.21
490 0.2
491 0.21
492 0.17
493 0.1
494 0.08
495 0.1
496 0.09
497 0.09
498 0.09
499 0.08
500 0.08
501 0.11
502 0.13
503 0.16
504 0.18
505 0.17
506 0.17
507 0.18
508 0.18
509 0.15
510 0.13
511 0.08
512 0.07
513 0.07
514 0.06
515 0.05
516 0.05
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.03
521 0.03
522 0.03
523 0.03
524 0.05
525 0.07
526 0.07
527 0.08
528 0.08
529 0.09
530 0.12
531 0.18
532 0.21
533 0.29
534 0.34
535 0.4
536 0.43
537 0.45
538 0.48
539 0.51
540 0.49
541 0.46
542 0.44
543 0.4
544 0.42
545 0.41
546 0.4
547 0.33
548 0.32
549 0.25
550 0.24
551 0.27
552 0.25
553 0.25
554 0.2
555 0.19
556 0.17
557 0.17
558 0.16
559 0.11
560 0.09
561 0.07
562 0.1
563 0.11
564 0.13
565 0.13
566 0.14
567 0.14
568 0.15
569 0.18
570 0.16
571 0.16
572 0.16
573 0.17
574 0.16
575 0.16
576 0.15
577 0.11
578 0.18
579 0.19
580 0.2
581 0.19
582 0.2
583 0.19
584 0.19
585 0.22
586 0.15
587 0.14
588 0.12
589 0.12
590 0.12
591 0.15
592 0.16
593 0.13
594 0.13
595 0.12
596 0.12
597 0.12
598 0.11
599 0.07
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.06
609 0.1
610 0.14
611 0.15
612 0.17
613 0.2
614 0.21
615 0.27
616 0.29
617 0.29
618 0.27
619 0.28
620 0.26
621 0.24
622 0.24
623 0.17
624 0.16
625 0.15
626 0.13
627 0.13
628 0.13
629 0.12
630 0.13
631 0.14
632 0.14
633 0.12
634 0.12
635 0.11
636 0.12
637 0.12
638 0.13
639 0.13
640 0.13
641 0.13
642 0.13
643 0.13
644 0.13
645 0.16
646 0.2
647 0.21
648 0.26
649 0.33
650 0.39
651 0.41
652 0.43
653 0.45
654 0.43
655 0.43
656 0.41
657 0.38
658 0.33
659 0.3
660 0.28
661 0.25
662 0.23
663 0.21
664 0.2
665 0.15
666 0.15
667 0.15
668 0.19
669 0.26
670 0.31
671 0.38
672 0.41
673 0.44
674 0.46
675 0.51
676 0.52
677 0.47
678 0.46
679 0.44
680 0.46
681 0.42
682 0.4
683 0.36
684 0.32
685 0.34
686 0.28
687 0.22
688 0.16
689 0.17
690 0.16
691 0.14
692 0.12
693 0.09
694 0.1
695 0.1
696 0.1
697 0.09
698 0.08
699 0.09
700 0.09
701 0.07
702 0.06
703 0.06
704 0.09
705 0.09
706 0.09
707 0.08
708 0.08
709 0.08
710 0.08
711 0.08
712 0.06