FuNGI

Q0UGB8

Protein Details

Accession

Q0UGB8

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
436-460	LGNHHVAGKRRVKKGKQQTGLEQLD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
341-347	GRKKKRK
444-449	KRRVKK

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005634 C:nucleus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
KEGG	pno:SNOG_09196 -
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPRRKFIDKKTAINYRLVHRAQNDPRIHDEDAPQMVFAETGAANMREDSEPAGSSRASQYSAATGRSKIKSRRELESEYEAKVRENEGEAANYGVYYDDTEYDYMQHLRDLGSGGGEAYFVEAPAEKKKGKQKLDLADALRNVSLDDRKSEAGLSISSNISSVSDVFGEDMAPSEFVRKTTYQDQQNIPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDDAYVDDEDDIFAALAEDGYEVDQREWDDTYDVEDRNAVDRFLDEEDEGWESDDTIKASSPKPKAAPTDPDSLPAPNEAPAAAEEGDLAYLEEFKKFKNDVKAGKTAKPTAPSGMESSIITGASALTAGGRKKKRKGAMTSTSGYSMSSSALHRTEGLTLLDQRFDKIEEDYADDGFGDFPDDASMVSGMSKMSGMSKMSGMSQWSSSEAPELRSDFDNIMDDFLGNHHVAGKRRVKKGKQQTGLEQLDEVRQGLGPARVSRPKTQATFV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.62
3	0.64
4	0.57
5	0.53
6	0.47
7	0.55
8	0.56
9	0.61
10	0.6
11	0.55
12	0.59
13	0.59
14	0.58
15	0.51
16	0.46
17	0.43
18	0.42
19	0.38
20	0.31
21	0.26
22	0.24
23	0.2
24	0.16
25	0.12
26	0.08
27	0.09
28	0.11
29	0.11
30	0.11
31	0.12
32	0.15
33	0.12
34	0.13
35	0.14
36	0.14
37	0.14
38	0.14
39	0.16
40	0.14
41	0.15
42	0.18
43	0.18
44	0.18
45	0.18
46	0.18
47	0.23
48	0.25
49	0.27
50	0.26
51	0.27
52	0.33
53	0.38
54	0.46
55	0.48
56	0.55
57	0.61
58	0.63
59	0.68
60	0.67
61	0.67
62	0.64
63	0.65
64	0.58
65	0.5
66	0.49
67	0.41
68	0.35
69	0.32
70	0.27
71	0.2
72	0.2
73	0.2
74	0.19
75	0.2
76	0.19
77	0.18
78	0.16
79	0.13
80	0.11
81	0.08
82	0.07
83	0.07
84	0.07
85	0.07
86	0.09
87	0.1
88	0.1
89	0.11
90	0.13
91	0.13
92	0.13
93	0.12
94	0.12
95	0.12
96	0.12
97	0.12
98	0.1
99	0.09
100	0.09
101	0.08
102	0.07
103	0.07
104	0.06
105	0.06
106	0.06
107	0.05
108	0.06
109	0.07
110	0.09
111	0.14
112	0.19
113	0.18
114	0.25
115	0.34
116	0.43
117	0.47
118	0.54
119	0.58
120	0.61
121	0.67
122	0.67
123	0.61
124	0.55
125	0.5
126	0.43
127	0.34
128	0.26
129	0.19
130	0.16
131	0.17
132	0.14
133	0.15
134	0.17
135	0.17
136	0.17
137	0.17
138	0.15
139	0.13
140	0.13
141	0.12
142	0.11
143	0.11
144	0.1
145	0.1
146	0.09
147	0.09
148	0.08
149	0.07
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.05
157	0.06
158	0.05
159	0.06
160	0.06
161	0.08
162	0.09
163	0.09
164	0.13
165	0.13
166	0.17
167	0.24
168	0.31
169	0.35
170	0.4
171	0.43
172	0.44
173	0.48
174	0.44
175	0.36
176	0.3
177	0.24
178	0.19
179	0.16
180	0.12
181	0.07
182	0.06
183	0.07
184	0.06
185	0.08
186	0.08
187	0.08
188	0.09
189	0.12
190	0.12
191	0.12
192	0.12
193	0.11
194	0.11
195	0.11
196	0.11
197	0.07
198	0.07
199	0.07
200	0.06
201	0.06
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.03
206	0.03
207	0.03
208	0.03
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.04
219	0.05
220	0.05
221	0.06
222	0.06
223	0.07
224	0.07
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.1
229	0.12
230	0.12
231	0.11
232	0.11
233	0.11
234	0.13
235	0.14
236	0.1
237	0.07
238	0.08
239	0.09
240	0.09
241	0.1
242	0.07
243	0.07
244	0.08
245	0.09
246	0.09
247	0.08
248	0.07
249	0.06
250	0.07
251	0.08
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.09
256	0.12
257	0.19
258	0.21
259	0.24
260	0.26
261	0.3
262	0.34
263	0.36
264	0.41
265	0.38
266	0.43
267	0.39
268	0.39
269	0.36
270	0.31
271	0.27
272	0.21
273	0.17
274	0.11
275	0.11
276	0.08
277	0.08
278	0.07
279	0.09
280	0.08
281	0.07
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.05
287	0.03
288	0.05
289	0.05
290	0.08
291	0.08
292	0.08
293	0.13
294	0.15
295	0.2
296	0.28
297	0.34
298	0.39
299	0.44
300	0.53
301	0.53
302	0.56
303	0.56
304	0.52
305	0.48
306	0.44
307	0.4
308	0.34
309	0.32
310	0.28
311	0.26
312	0.22
313	0.2
314	0.17
315	0.16
316	0.14
317	0.11
318	0.1
319	0.07
320	0.06
321	0.05
322	0.05
323	0.03
324	0.04
325	0.07
326	0.09
327	0.18
328	0.26
329	0.33
330	0.41
331	0.49
332	0.57
333	0.63
334	0.7
335	0.72
336	0.73
337	0.72
338	0.68
339	0.61
340	0.54
341	0.45
342	0.36
343	0.27
344	0.18
345	0.12
346	0.11
347	0.11
348	0.13
349	0.14
350	0.14
351	0.14
352	0.14
353	0.15
354	0.15
355	0.15
356	0.14
357	0.18
358	0.18
359	0.21
360	0.21
361	0.2
362	0.19
363	0.19
364	0.18
365	0.15
366	0.18
367	0.16
368	0.2
369	0.2
370	0.19
371	0.17
372	0.16
373	0.15
374	0.11
375	0.1
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.07
381	0.06
382	0.07
383	0.07
384	0.05
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.08
392	0.1
393	0.11
394	0.12
395	0.13
396	0.14
397	0.15
398	0.17
399	0.17
400	0.16
401	0.16
402	0.16
403	0.18
404	0.17
405	0.16
406	0.2
407	0.2
408	0.2
409	0.23
410	0.23
411	0.24
412	0.25
413	0.27
414	0.22
415	0.22
416	0.23
417	0.19
418	0.19
419	0.16
420	0.14
421	0.13
422	0.13
423	0.14
424	0.11
425	0.11
426	0.14
427	0.19
428	0.23
429	0.32
430	0.41
431	0.47
432	0.57
433	0.67
434	0.7
435	0.77
436	0.84
437	0.86
438	0.85
439	0.84
440	0.82
441	0.83
442	0.78
443	0.68
444	0.58
445	0.48
446	0.42
447	0.36
448	0.28
449	0.18
450	0.15
451	0.15
452	0.16
453	0.19
454	0.2
455	0.23
456	0.31
457	0.38
458	0.43
459	0.49
460	0.53
461	0.58

Q0UGB8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer