Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0U9C2

Protein Details
Accession Q0U9C2    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
348-371SSFGRDRRRGRRRMAWKESPHNNRBasic
738-763AKKGNGHIKKPTPVRQKIRHDLQRSPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
352-364RDRRRGRRRMAWK
746-746K
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017970  Homeobox_CS  
IPR001356  Homeobox_dom  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG pno:SNOG_11642  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00027  HOMEOBOX_1  
PS50071  HOMEOBOX_2  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MASHAFDDLDAFFDFDQLEHDHGIRTVTTPCQQHDDPSVHPGQVLSMDWVADAPHVLASPDFHTHNFIQKASYPQTCSYEIRHDGDAGTYPLPRPDYEDASASQDATSDQNPRPYIAPSSSSQMHSPGLGSPGRDIAADLHDEKDLVLHPTPTAIPLRQASTASWKPASAKRKGAQSRIPLEARQILEDEFAANPYPCSWEIDIIAHQANLDVKKVRNWFNNTRARKKGGDVDTLQQEHVDAVGCLLGARLSRDSLGALEQQGAEDVQPPQPLAVYLAQSYQEEAVQLPDVQAALETDTLSGSADFHDAWLGMPRGRTGSIITSVDSSDGTAPTSFTVSSSGSRSNISSFGRDRRRGRRRMAWKESPHNNRAKFNGVNSSGEPQKDLAFFCTFCPRAFKTKYEWVRHEDSVHALRTTWICCDTKAPFLQTCPFCGHMHPDDAHMAGHKYQQCSNKPESQRTFYRRDHFIQHLHHIHFANAKHPSVRVGCQARLMATEGHNFGCKDLAMRWRRFGAPMKRDDPMLHCGMCGKRSKDWSERCEHVAQHLVAREHDRSAWWPERKENHLENLYSASPFESFRCRYCLKVFTDVKEMNAHSHCKVWSCRFLRTFDDVTANNAGPPLCSDFPSAKAHHCHLCGAGYRTPHAEHAQNYHRHRSCNQEFYTSEDAFLAHLHNFHNALHPALLHGSSVIEQNFLRNKGASFEPVEFNESWQPCLMDLDDAPIGFAVDKASTPPSIAKKGNGHIKKPTPVRQKIRHDLQRSPIATIKAQRQRSETNTSGSDSHSPRFLRLSTFVPFWSSRIFYSRSNRPYLVPKDNTTVLEEIQKPHVASLVMSSGLVGMALTRWLIKPQHCSLSGMTELIISEDNRES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.09
3 0.12
4 0.12
5 0.13
6 0.14
7 0.15
8 0.15
9 0.16
10 0.17
11 0.15
12 0.15
13 0.16
14 0.2
15 0.26
16 0.28
17 0.3
18 0.36
19 0.37
20 0.39
21 0.43
22 0.42
23 0.38
24 0.41
25 0.41
26 0.34
27 0.33
28 0.29
29 0.23
30 0.21
31 0.2
32 0.16
33 0.13
34 0.13
35 0.13
36 0.13
37 0.12
38 0.1
39 0.09
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.1
46 0.13
47 0.16
48 0.18
49 0.18
50 0.23
51 0.24
52 0.33
53 0.34
54 0.31
55 0.3
56 0.32
57 0.39
58 0.4
59 0.44
60 0.39
61 0.4
62 0.44
63 0.45
64 0.44
65 0.41
66 0.43
67 0.43
68 0.42
69 0.4
70 0.36
71 0.32
72 0.31
73 0.29
74 0.23
75 0.19
76 0.18
77 0.17
78 0.2
79 0.21
80 0.2
81 0.24
82 0.26
83 0.3
84 0.3
85 0.32
86 0.3
87 0.34
88 0.34
89 0.28
90 0.23
91 0.18
92 0.17
93 0.17
94 0.18
95 0.19
96 0.21
97 0.27
98 0.28
99 0.29
100 0.3
101 0.3
102 0.32
103 0.29
104 0.3
105 0.25
106 0.3
107 0.32
108 0.32
109 0.31
110 0.29
111 0.26
112 0.23
113 0.22
114 0.18
115 0.19
116 0.18
117 0.17
118 0.16
119 0.17
120 0.17
121 0.16
122 0.15
123 0.12
124 0.13
125 0.16
126 0.16
127 0.15
128 0.15
129 0.15
130 0.14
131 0.14
132 0.13
133 0.13
134 0.14
135 0.13
136 0.13
137 0.15
138 0.15
139 0.16
140 0.18
141 0.15
142 0.18
143 0.2
144 0.23
145 0.23
146 0.24
147 0.22
148 0.28
149 0.31
150 0.31
151 0.29
152 0.28
153 0.31
154 0.38
155 0.44
156 0.42
157 0.47
158 0.47
159 0.57
160 0.63
161 0.65
162 0.66
163 0.67
164 0.65
165 0.63
166 0.61
167 0.52
168 0.49
169 0.47
170 0.4
171 0.32
172 0.28
173 0.21
174 0.2
175 0.19
176 0.16
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.12
184 0.12
185 0.16
186 0.16
187 0.16
188 0.17
189 0.19
190 0.19
191 0.19
192 0.19
193 0.14
194 0.14
195 0.13
196 0.15
197 0.14
198 0.16
199 0.17
200 0.17
201 0.24
202 0.3
203 0.36
204 0.4
205 0.48
206 0.54
207 0.6
208 0.69
209 0.71
210 0.75
211 0.74
212 0.7
213 0.65
214 0.6
215 0.59
216 0.54
217 0.53
218 0.46
219 0.45
220 0.47
221 0.45
222 0.41
223 0.32
224 0.27
225 0.2
226 0.17
227 0.12
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.07
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.12
265 0.13
266 0.12
267 0.13
268 0.11
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.05
296 0.06
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.12
303 0.13
304 0.13
305 0.11
306 0.12
307 0.14
308 0.14
309 0.14
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.11
314 0.1
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.07
323 0.06
324 0.08
325 0.08
326 0.1
327 0.12
328 0.13
329 0.13
330 0.14
331 0.15
332 0.14
333 0.17
334 0.17
335 0.18
336 0.2
337 0.28
338 0.35
339 0.42
340 0.48
341 0.55
342 0.64
343 0.68
344 0.72
345 0.73
346 0.76
347 0.8
348 0.82
349 0.8
350 0.78
351 0.79
352 0.81
353 0.79
354 0.75
355 0.72
356 0.66
357 0.59
358 0.54
359 0.51
360 0.43
361 0.37
362 0.37
363 0.31
364 0.3
365 0.27
366 0.28
367 0.25
368 0.23
369 0.22
370 0.15
371 0.15
372 0.14
373 0.14
374 0.14
375 0.13
376 0.13
377 0.14
378 0.2
379 0.19
380 0.18
381 0.22
382 0.22
383 0.28
384 0.31
385 0.32
386 0.32
387 0.4
388 0.49
389 0.51
390 0.52
391 0.49
392 0.51
393 0.5
394 0.45
395 0.36
396 0.31
397 0.28
398 0.25
399 0.2
400 0.15
401 0.15
402 0.16
403 0.15
404 0.13
405 0.13
406 0.12
407 0.12
408 0.15
409 0.16
410 0.19
411 0.19
412 0.21
413 0.18
414 0.2
415 0.26
416 0.23
417 0.24
418 0.21
419 0.23
420 0.21
421 0.2
422 0.23
423 0.18
424 0.2
425 0.19
426 0.18
427 0.16
428 0.16
429 0.15
430 0.11
431 0.1
432 0.09
433 0.13
434 0.14
435 0.15
436 0.2
437 0.27
438 0.31
439 0.36
440 0.39
441 0.43
442 0.44
443 0.51
444 0.5
445 0.49
446 0.52
447 0.53
448 0.56
449 0.53
450 0.55
451 0.51
452 0.49
453 0.49
454 0.45
455 0.45
456 0.4
457 0.42
458 0.42
459 0.39
460 0.4
461 0.35
462 0.32
463 0.3
464 0.27
465 0.25
466 0.22
467 0.22
468 0.19
469 0.19
470 0.21
471 0.19
472 0.2
473 0.22
474 0.23
475 0.23
476 0.25
477 0.25
478 0.22
479 0.21
480 0.2
481 0.15
482 0.13
483 0.15
484 0.13
485 0.13
486 0.15
487 0.14
488 0.13
489 0.12
490 0.1
491 0.09
492 0.11
493 0.2
494 0.26
495 0.27
496 0.3
497 0.32
498 0.32
499 0.35
500 0.41
501 0.42
502 0.42
503 0.47
504 0.47
505 0.45
506 0.45
507 0.43
508 0.37
509 0.32
510 0.27
511 0.21
512 0.18
513 0.21
514 0.21
515 0.24
516 0.26
517 0.24
518 0.26
519 0.31
520 0.37
521 0.43
522 0.5
523 0.51
524 0.52
525 0.52
526 0.51
527 0.5
528 0.44
529 0.37
530 0.36
531 0.3
532 0.27
533 0.27
534 0.24
535 0.22
536 0.25
537 0.23
538 0.18
539 0.18
540 0.16
541 0.15
542 0.22
543 0.29
544 0.31
545 0.32
546 0.38
547 0.44
548 0.47
549 0.51
550 0.47
551 0.46
552 0.45
553 0.43
554 0.37
555 0.34
556 0.31
557 0.24
558 0.2
559 0.14
560 0.11
561 0.11
562 0.12
563 0.15
564 0.17
565 0.18
566 0.24
567 0.25
568 0.27
569 0.31
570 0.36
571 0.34
572 0.42
573 0.43
574 0.4
575 0.47
576 0.44
577 0.41
578 0.38
579 0.35
580 0.3
581 0.3
582 0.3
583 0.23
584 0.25
585 0.25
586 0.25
587 0.3
588 0.31
589 0.37
590 0.37
591 0.44
592 0.44
593 0.47
594 0.47
595 0.47
596 0.44
597 0.36
598 0.38
599 0.3
600 0.3
601 0.3
602 0.25
603 0.19
604 0.18
605 0.16
606 0.12
607 0.13
608 0.15
609 0.13
610 0.14
611 0.17
612 0.17
613 0.21
614 0.26
615 0.26
616 0.26
617 0.29
618 0.31
619 0.34
620 0.33
621 0.31
622 0.27
623 0.28
624 0.27
625 0.28
626 0.27
627 0.23
628 0.24
629 0.25
630 0.25
631 0.25
632 0.24
633 0.24
634 0.23
635 0.3
636 0.37
637 0.43
638 0.46
639 0.53
640 0.53
641 0.53
642 0.54
643 0.57
644 0.56
645 0.57
646 0.54
647 0.5
648 0.47
649 0.5
650 0.54
651 0.44
652 0.36
653 0.27
654 0.25
655 0.19
656 0.19
657 0.14
658 0.08
659 0.1
660 0.1
661 0.12
662 0.13
663 0.13
664 0.18
665 0.17
666 0.18
667 0.16
668 0.16
669 0.15
670 0.15
671 0.15
672 0.09
673 0.08
674 0.08
675 0.08
676 0.11
677 0.1
678 0.11
679 0.11
680 0.16
681 0.21
682 0.22
683 0.23
684 0.22
685 0.22
686 0.23
687 0.25
688 0.23
689 0.21
690 0.23
691 0.24
692 0.24
693 0.28
694 0.24
695 0.25
696 0.29
697 0.27
698 0.25
699 0.23
700 0.23
701 0.19
702 0.2
703 0.18
704 0.13
705 0.12
706 0.14
707 0.14
708 0.13
709 0.13
710 0.11
711 0.1
712 0.08
713 0.09
714 0.06
715 0.06
716 0.06
717 0.08
718 0.11
719 0.11
720 0.12
721 0.18
722 0.23
723 0.29
724 0.31
725 0.35
726 0.39
727 0.47
728 0.56
729 0.57
730 0.56
731 0.58
732 0.63
733 0.66
734 0.68
735 0.71
736 0.71
737 0.75
738 0.81
739 0.81
740 0.85
741 0.86
742 0.88
743 0.88
744 0.83
745 0.8
746 0.77
747 0.77
748 0.68
749 0.61
750 0.55
751 0.49
752 0.47
753 0.45
754 0.47
755 0.47
756 0.52
757 0.52
758 0.53
759 0.57
760 0.59
761 0.62
762 0.55
763 0.52
764 0.48
765 0.46
766 0.41
767 0.37
768 0.39
769 0.33
770 0.32
771 0.33
772 0.32
773 0.32
774 0.35
775 0.33
776 0.3
777 0.3
778 0.32
779 0.3
780 0.31
781 0.29
782 0.3
783 0.29
784 0.26
785 0.28
786 0.25
787 0.24
788 0.27
789 0.3
790 0.33
791 0.4
792 0.49
793 0.5
794 0.55
795 0.55
796 0.54
797 0.6
798 0.61
799 0.63
800 0.59
801 0.56
802 0.56
803 0.58
804 0.55
805 0.49
806 0.42
807 0.33
808 0.35
809 0.34
810 0.31
811 0.32
812 0.34
813 0.3
814 0.29
815 0.3
816 0.22
817 0.2
818 0.2
819 0.18
820 0.15
821 0.14
822 0.14
823 0.11
824 0.1
825 0.1
826 0.06
827 0.04
828 0.04
829 0.05
830 0.06
831 0.07
832 0.08
833 0.14
834 0.2
835 0.25
836 0.33
837 0.39
838 0.47
839 0.46
840 0.49
841 0.45
842 0.45
843 0.42
844 0.34
845 0.28
846 0.2
847 0.19
848 0.17
849 0.18
850 0.12