FuNGI

Q0U9N8

Protein Details

Accession

Q0U9N8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
421-443	LCTYDKVQRVKNKWKCTLKDGIL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
354-356	KKR

Subcellular Location(s)

nucl 8, cyto 8, cyto_nucl 8, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004855 TFIIA_asu/bsu IPR009088 TFIIA_b-brl
Gene Ontology	GO:0005672 C:transcription factor TFIIA complex GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	pno:SNOG_11526 -
Pfam	View protein in Pfam PF03153 TFIIA
CDD	cd07976 TFIIA_alpha_beta_like

Amino Acid Sequences

MSNTIVGAVYQQIIDKVIQASQNDFEEFGVDQTTLDEMKQVRDSLVGYPAIAPSFSSAMAATRSCSTLSTLFHVYFLFLELFIDRCAAMDDGAMQPGSGDQEPGLTYFQGWQDKLSALKVAQFPWDPQPELPRQPPTVPSNVKTDNDMPPVSAPQDALNFPNVPIKAEGGGYQQPLSNYPQGQTANGGGYTGGYDQNLAQQRAASLVQQRVMQQNGMQQPVMNFPNVGQQQQMPHMPMQGQQVQQGQRMMAPQQQQQQQQQQRMPQQIPQQQQHQQHQQQQRPPQQGQVYQSQVDGSGDAMADWNALKAARAAALQDEAGRLAADQFMRARIDAMAMRQDSGLMVPLDSMPKGKKRRAAVRVLQAEDAEASPSAPGPARFDGDDDVKEEDPDDAINSDLDDPEDELNDGDNSDDEMVDYMLCTYDKVQRVKNKWKCTLKDGILTTNKKEYLFHKANGEFEW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.13
3	0.13
4	0.15
5	0.19
6	0.19
7	0.22
8	0.24
9	0.26
10	0.24
11	0.23
12	0.2
13	0.18
14	0.17
15	0.15
16	0.12
17	0.1
18	0.09
19	0.09
20	0.11
21	0.1
22	0.09
23	0.13
24	0.13
25	0.17
26	0.2
27	0.2
28	0.19
29	0.2
30	0.22
31	0.2
32	0.23
33	0.2
34	0.17
35	0.17
36	0.18
37	0.16
38	0.15
39	0.13
40	0.1
41	0.11
42	0.1
43	0.1
44	0.09
45	0.1
46	0.13
47	0.13
48	0.13
49	0.13
50	0.14
51	0.14
52	0.14
53	0.16
54	0.18
55	0.19
56	0.22
57	0.23
58	0.23
59	0.23
60	0.22
61	0.2
62	0.16
63	0.16
64	0.12
65	0.08
66	0.09
67	0.09
68	0.1
69	0.09
70	0.09
71	0.07
72	0.07
73	0.09
74	0.08
75	0.08
76	0.07
77	0.09
78	0.09
79	0.1
80	0.1
81	0.08
82	0.08
83	0.08
84	0.11
85	0.09
86	0.09
87	0.07
88	0.09
89	0.1
90	0.11
91	0.11
92	0.08
93	0.09
94	0.11
95	0.16
96	0.19
97	0.19
98	0.19
99	0.2
100	0.21
101	0.22
102	0.2
103	0.18
104	0.13
105	0.19
106	0.2
107	0.19
108	0.22
109	0.21
110	0.23
111	0.28
112	0.31
113	0.27
114	0.26
115	0.32
116	0.34
117	0.39
118	0.42
119	0.4
120	0.39
121	0.39
122	0.44
123	0.41
124	0.45
125	0.43
126	0.4
127	0.42
128	0.43
129	0.42
130	0.39
131	0.39
132	0.35
133	0.35
134	0.33
135	0.26
136	0.23
137	0.24
138	0.21
139	0.18
140	0.13
141	0.11
142	0.13
143	0.13
144	0.13
145	0.15
146	0.14
147	0.14
148	0.18
149	0.17
150	0.16
151	0.15
152	0.15
153	0.13
154	0.13
155	0.14
156	0.12
157	0.15
158	0.14
159	0.14
160	0.15
161	0.14
162	0.16
163	0.18
164	0.18
165	0.16
166	0.16
167	0.2
168	0.19
169	0.19
170	0.19
171	0.16
172	0.14
173	0.13
174	0.12
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.07
179	0.06
180	0.05
181	0.06
182	0.06
183	0.12
184	0.16
185	0.16
186	0.15
187	0.15
188	0.15
189	0.16
190	0.17
191	0.13
192	0.13
193	0.14
194	0.16
195	0.17
196	0.19
197	0.2
198	0.2
199	0.18
200	0.15
201	0.19
202	0.21
203	0.2
204	0.18
205	0.16
206	0.16
207	0.2
208	0.19
209	0.14
210	0.11
211	0.1
212	0.17
213	0.17
214	0.17
215	0.14
216	0.14
217	0.15
218	0.18
219	0.19
220	0.13
221	0.12
222	0.13
223	0.13
224	0.15
225	0.17
226	0.19
227	0.18
228	0.19
229	0.24
230	0.24
231	0.26
232	0.24
233	0.2
234	0.17
235	0.17
236	0.16
237	0.15
238	0.17
239	0.19
240	0.25
241	0.31
242	0.34
243	0.38
244	0.46
245	0.48
246	0.51
247	0.5
248	0.5
249	0.5
250	0.52
251	0.48
252	0.43
253	0.46
254	0.47
255	0.5
256	0.48
257	0.48
258	0.49
259	0.54
260	0.57
261	0.58
262	0.57
263	0.6
264	0.65
265	0.65
266	0.65
267	0.67
268	0.69
269	0.67
270	0.61
271	0.59
272	0.54
273	0.52
274	0.48
275	0.45
276	0.4
277	0.33
278	0.32
279	0.26
280	0.22
281	0.18
282	0.15
283	0.08
284	0.06
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.04
292	0.04
293	0.04
294	0.05
295	0.05
296	0.06
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.08
301	0.09
302	0.09
303	0.08
304	0.08
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.06
309	0.05
310	0.08
311	0.07
312	0.09
313	0.09
314	0.11
315	0.12
316	0.12
317	0.13
318	0.1
319	0.13
320	0.12
321	0.13
322	0.17
323	0.16
324	0.17
325	0.16
326	0.16
327	0.13
328	0.13
329	0.14
330	0.08
331	0.08
332	0.08
333	0.09
334	0.1
335	0.1
336	0.13
337	0.14
338	0.23
339	0.3
340	0.35
341	0.41
342	0.48
343	0.59
344	0.64
345	0.7
346	0.69
347	0.72
348	0.74
349	0.7
350	0.62
351	0.52
352	0.44
353	0.35
354	0.27
355	0.18
356	0.1
357	0.08
358	0.07
359	0.07
360	0.08
361	0.09
362	0.1
363	0.13
364	0.16
365	0.18
366	0.18
367	0.19
368	0.22
369	0.23
370	0.23
371	0.21
372	0.22
373	0.2
374	0.2
375	0.19
376	0.16
377	0.13
378	0.12
379	0.11
380	0.08
381	0.09
382	0.09
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.1
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.1
392	0.09
393	0.11
394	0.1
395	0.09
396	0.08
397	0.08
398	0.09
399	0.09
400	0.08
401	0.07
402	0.08
403	0.08
404	0.07
405	0.07
406	0.06
407	0.07
408	0.07
409	0.08
410	0.1
411	0.17
412	0.25
413	0.3
414	0.38
415	0.47
416	0.56
417	0.67
418	0.74
419	0.77
420	0.8
421	0.85
422	0.82
423	0.79
424	0.8
425	0.75
426	0.73
427	0.66
428	0.65
429	0.65
430	0.63
431	0.61
432	0.58
433	0.55
434	0.47
435	0.48
436	0.42
437	0.43
438	0.46
439	0.45
440	0.46
441	0.47

Q0U9N8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer