Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QYS0

Protein Details
Accession C4QYS0    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-112KESKIVKSKRNKKLTPEQLAHydrophilic
259-279VEKSRNIERKREKYGPSKKDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-108KSKRNKKLTP
113-113K
116-117KK
266-284ERKREKYGPSKKDEELRRS
293-306RRADAPAEIKKQKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0539  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MSKAASTSFLDLSSEDEDVESHVISDEEDLDLQSKNKSLKRGFDAFSEDDEDEDHDEDKGQDDHKDGKIATEHKEGDDDKESFLSEDLNNLTKESKIVKSKRNKKLTPEQLAKQQKKLKKTGVVYLSSLPPYMKPTKMRQILSRFGEVDRLYLKPEDILTQNKRVRFGGNKKRMYTEGWAEYLNKKDAKLAAETLNANSLGGKKGTFYYDDIINIKYLSGFKWHDLTEQIAKENERREAKLRQELTQENKLSKVFISNVEKSRNIERKREKYGPSKKDEELRRSFHQRDVASRRADAPAEIKKQKKSEKLEGVLSKVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.12
3 0.12
4 0.11
5 0.12
6 0.13
7 0.1
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.09
13 0.08
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.09
18 0.11
19 0.12
20 0.13
21 0.16
22 0.22
23 0.26
24 0.34
25 0.37
26 0.44
27 0.5
28 0.56
29 0.53
30 0.5
31 0.53
32 0.46
33 0.44
34 0.4
35 0.32
36 0.25
37 0.24
38 0.21
39 0.17
40 0.16
41 0.14
42 0.1
43 0.11
44 0.11
45 0.13
46 0.14
47 0.13
48 0.14
49 0.16
50 0.22
51 0.23
52 0.26
53 0.23
54 0.24
55 0.29
56 0.3
57 0.32
58 0.34
59 0.33
60 0.3
61 0.34
62 0.32
63 0.31
64 0.33
65 0.29
66 0.23
67 0.22
68 0.22
69 0.18
70 0.17
71 0.15
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.15
76 0.14
77 0.15
78 0.15
79 0.13
80 0.15
81 0.16
82 0.21
83 0.27
84 0.34
85 0.42
86 0.53
87 0.63
88 0.72
89 0.78
90 0.76
91 0.75
92 0.8
93 0.81
94 0.8
95 0.76
96 0.69
97 0.69
98 0.75
99 0.7
100 0.67
101 0.64
102 0.59
103 0.59
104 0.63
105 0.59
106 0.57
107 0.56
108 0.56
109 0.53
110 0.51
111 0.45
112 0.4
113 0.35
114 0.28
115 0.26
116 0.18
117 0.13
118 0.17
119 0.18
120 0.2
121 0.23
122 0.29
123 0.38
124 0.44
125 0.45
126 0.47
127 0.5
128 0.53
129 0.52
130 0.48
131 0.4
132 0.33
133 0.35
134 0.28
135 0.23
136 0.17
137 0.15
138 0.14
139 0.13
140 0.13
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.17
146 0.19
147 0.27
148 0.3
149 0.31
150 0.32
151 0.31
152 0.32
153 0.34
154 0.42
155 0.44
156 0.51
157 0.55
158 0.55
159 0.57
160 0.55
161 0.49
162 0.43
163 0.37
164 0.29
165 0.25
166 0.24
167 0.24
168 0.25
169 0.25
170 0.24
171 0.2
172 0.18
173 0.19
174 0.2
175 0.2
176 0.2
177 0.2
178 0.18
179 0.2
180 0.2
181 0.18
182 0.18
183 0.16
184 0.13
185 0.11
186 0.11
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.08
191 0.09
192 0.11
193 0.12
194 0.12
195 0.13
196 0.14
197 0.17
198 0.17
199 0.16
200 0.15
201 0.14
202 0.12
203 0.11
204 0.1
205 0.09
206 0.13
207 0.14
208 0.15
209 0.18
210 0.19
211 0.19
212 0.2
213 0.23
214 0.23
215 0.23
216 0.24
217 0.23
218 0.24
219 0.27
220 0.29
221 0.32
222 0.3
223 0.32
224 0.35
225 0.41
226 0.47
227 0.52
228 0.51
229 0.47
230 0.5
231 0.54
232 0.55
233 0.56
234 0.52
235 0.44
236 0.44
237 0.41
238 0.35
239 0.29
240 0.26
241 0.19
242 0.24
243 0.31
244 0.34
245 0.4
246 0.44
247 0.45
248 0.44
249 0.52
250 0.54
251 0.51
252 0.55
253 0.61
254 0.64
255 0.72
256 0.77
257 0.75
258 0.76
259 0.82
260 0.81
261 0.78
262 0.75
263 0.71
264 0.71
265 0.73
266 0.71
267 0.69
268 0.66
269 0.66
270 0.69
271 0.68
272 0.65
273 0.64
274 0.57
275 0.59
276 0.6
277 0.6
278 0.54
279 0.53
280 0.5
281 0.45
282 0.43
283 0.36
284 0.35
285 0.36
286 0.42
287 0.49
288 0.52
289 0.56
290 0.64
291 0.71
292 0.73
293 0.73
294 0.75
295 0.77
296 0.76
297 0.78
298 0.74