FuNGI

F0UPN6

Protein Details

Accession

F0UPN6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
387-412	DEDAARERERRRRQQRQEAERQLRQS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
226-241	PKFKHKKIPRGPPSPP

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto 8, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MATSIAQGLFKSLPKPKYTGEDEELPPHTQPKGPRIVGAGAVNESQVVLKTAGPPPYGRRSGWRPRNPEDFADGGAFPEIPVAQYPLDMGRKGTSSTSNALAVQVDAEGKVKYDAIAKQGQGENRIVHASFKDLIPLRQRVDMGEISLARPSQEEVAEQMEKTKTALAKLVTGAVAAQKPKNVKGGKRNEPTFVRYTPANQMGDTSKKNDRIMKIVERQVDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWRIPPPVSNWKNPRGYTVPLDKRLAADGRGLQDVSINDKFAQFAEALFTADRHAREEVKQRAQMQQKLAEKEKAQKEEHLRQLAQKAREARSGGTSRQESRARTRSRSISGSRSPSPYSSRSATPSEDEDAARERERRRRQQRQEAERQLRQSRMGTERRIQMMAREQNRDISEKVALGLAKPTQSKETMYDSRLFNQTSGFESGFNEDQPYDKPLFAAQDAINSIYRPRAQADDFDDEEAAGAEMSRIERNSRFEVLGRAKQGFKGAADAEARDGPVQFEKDTSDPFGIDGMIAEVTGGSTQKRYGIQEAEGAKERGSKRARVDDDDDDHDRGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.42
3	0.43
4	0.49
5	0.53
6	0.54
7	0.51
8	0.53
9	0.52
10	0.54
11	0.53
12	0.47
13	0.41
14	0.37
15	0.33
16	0.3
17	0.33
18	0.35
19	0.42
20	0.41
21	0.42
22	0.43
23	0.43
24	0.43
25	0.39
26	0.33
27	0.25
28	0.24
29	0.22
30	0.18
31	0.15
32	0.12
33	0.1
34	0.1
35	0.09
36	0.1
37	0.15
38	0.2
39	0.24
40	0.25
41	0.28
42	0.32
43	0.41
44	0.44
45	0.4
46	0.44
47	0.49
48	0.59
49	0.67
50	0.7
51	0.69
52	0.72
53	0.8
54	0.75
55	0.69
56	0.63
57	0.53
58	0.46
59	0.4
60	0.32
61	0.24
62	0.2
63	0.17
64	0.11
65	0.11
66	0.09
67	0.07
68	0.08
69	0.09
70	0.09
71	0.09
72	0.1
73	0.14
74	0.17
75	0.17
76	0.18
77	0.18
78	0.19
79	0.21
80	0.22
81	0.21
82	0.22
83	0.24
84	0.25
85	0.24
86	0.23
87	0.23
88	0.2
89	0.16
90	0.13
91	0.1
92	0.08
93	0.07
94	0.08
95	0.08
96	0.08
97	0.09
98	0.09
99	0.09
100	0.13
101	0.15
102	0.19
103	0.24
104	0.23
105	0.28
106	0.32
107	0.33
108	0.32
109	0.33
110	0.29
111	0.26
112	0.28
113	0.22
114	0.2
115	0.19
116	0.18
117	0.17
118	0.16
119	0.2
120	0.2
121	0.24
122	0.29
123	0.34
124	0.32
125	0.34
126	0.34
127	0.29
128	0.32
129	0.28
130	0.22
131	0.21
132	0.19
133	0.16
134	0.18
135	0.17
136	0.12
137	0.12
138	0.12
139	0.11
140	0.11
141	0.11
142	0.11
143	0.16
144	0.16
145	0.16
146	0.19
147	0.17
148	0.17
149	0.17
150	0.18
151	0.15
152	0.15
153	0.19
154	0.16
155	0.17
156	0.18
157	0.18
158	0.15
159	0.14
160	0.13
161	0.12
162	0.13
163	0.14
164	0.14
165	0.16
166	0.19
167	0.21
168	0.29
169	0.32
170	0.36
171	0.44
172	0.53
173	0.6
174	0.67
175	0.67
176	0.65
177	0.63
178	0.61
179	0.56
180	0.46
181	0.38
182	0.3
183	0.31
184	0.31
185	0.33
186	0.29
187	0.24
188	0.25
189	0.26
190	0.31
191	0.29
192	0.27
193	0.27
194	0.31
195	0.35
196	0.38
197	0.37
198	0.37
199	0.41
200	0.45
201	0.46
202	0.47
203	0.48
204	0.43
205	0.43
206	0.38
207	0.33
208	0.27
209	0.27
210	0.27
211	0.24
212	0.25
213	0.34
214	0.39
215	0.4
216	0.5
217	0.52
218	0.58
219	0.67
220	0.76
221	0.75
222	0.77
223	0.79
224	0.78
225	0.76
226	0.72
227	0.65
228	0.56
229	0.52
230	0.49
231	0.5
232	0.5
233	0.5
234	0.48
235	0.48
236	0.51
237	0.46
238	0.43
239	0.43
240	0.41
241	0.4
242	0.37
243	0.34
244	0.34
245	0.33
246	0.32
247	0.28
248	0.21
249	0.15
250	0.16
251	0.18
252	0.26
253	0.29
254	0.36
255	0.4
256	0.46
257	0.52
258	0.49
259	0.5
260	0.43
261	0.42
262	0.39
263	0.43
264	0.42
265	0.4
266	0.41
267	0.36
268	0.33
269	0.33
270	0.29
271	0.2
272	0.16
273	0.14
274	0.14
275	0.15
276	0.14
277	0.11
278	0.13
279	0.12
280	0.15
281	0.13
282	0.12
283	0.12
284	0.12
285	0.13
286	0.11
287	0.11
288	0.06
289	0.06
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.09
297	0.1
298	0.1
299	0.11
300	0.12
301	0.16
302	0.25
303	0.31
304	0.34
305	0.38
306	0.38
307	0.44
308	0.49
309	0.5
310	0.44
311	0.44
312	0.43
313	0.44
314	0.45
315	0.41
316	0.37
317	0.41
318	0.44
319	0.43
320	0.39
321	0.4
322	0.45
323	0.5
324	0.54
325	0.51
326	0.45
327	0.42
328	0.48
329	0.48
330	0.42
331	0.38
332	0.37
333	0.34
334	0.38
335	0.36
336	0.3
337	0.31
338	0.32
339	0.3
340	0.3
341	0.3
342	0.28
343	0.34
344	0.37
345	0.34
346	0.39
347	0.47
348	0.46
349	0.48
350	0.51
351	0.5
352	0.5
353	0.54
354	0.49
355	0.48
356	0.49
357	0.5
358	0.47
359	0.45
360	0.42
361	0.38
362	0.39
363	0.34
364	0.32
365	0.29
366	0.29
367	0.29
368	0.3
369	0.29
370	0.27
371	0.26
372	0.24
373	0.23
374	0.21
375	0.18
376	0.19
377	0.2
378	0.2
379	0.23
380	0.26
381	0.35
382	0.45
383	0.54
384	0.62
385	0.71
386	0.79
387	0.85
388	0.9
389	0.9
390	0.91
391	0.91
392	0.89
393	0.82
394	0.79
395	0.73
396	0.64
397	0.57
398	0.49
399	0.44
400	0.43
401	0.45
402	0.43
403	0.44
404	0.47
405	0.47
406	0.46
407	0.4
408	0.36
409	0.39
410	0.42
411	0.42
412	0.4
413	0.38
414	0.42
415	0.44
416	0.42
417	0.33
418	0.27
419	0.23
420	0.19
421	0.19
422	0.16
423	0.14
424	0.12
425	0.14
426	0.13
427	0.15
428	0.16
429	0.17
430	0.18
431	0.2
432	0.21
433	0.22
434	0.28
435	0.3
436	0.31
437	0.35
438	0.34
439	0.37
440	0.39
441	0.36
442	0.29
443	0.26
444	0.24
445	0.22
446	0.24
447	0.2
448	0.16
449	0.17
450	0.2
451	0.19
452	0.18
453	0.16
454	0.13
455	0.14
456	0.16
457	0.19
458	0.17
459	0.16
460	0.16
461	0.16
462	0.19
463	0.18
464	0.2
465	0.16
466	0.18
467	0.19
468	0.2
469	0.19
470	0.17
471	0.17
472	0.18
473	0.19
474	0.17
475	0.19
476	0.22
477	0.22
478	0.27
479	0.32
480	0.34
481	0.33
482	0.33
483	0.31
484	0.25
485	0.24
486	0.19
487	0.13
488	0.07
489	0.05
490	0.04
491	0.06
492	0.07
493	0.1
494	0.1
495	0.14
496	0.19
497	0.24
498	0.29
499	0.3
500	0.31
501	0.3
502	0.38
503	0.42
504	0.44
505	0.43
506	0.41
507	0.4
508	0.4
509	0.42
510	0.36
511	0.28
512	0.27
513	0.24
514	0.25
515	0.25
516	0.24
517	0.23
518	0.22
519	0.22
520	0.18
521	0.18
522	0.15
523	0.19
524	0.2
525	0.18
526	0.18
527	0.2
528	0.22
529	0.24
530	0.26
531	0.22
532	0.2
533	0.2
534	0.19
535	0.16
536	0.13
537	0.11
538	0.08
539	0.07
540	0.06
541	0.06
542	0.05
543	0.05
544	0.06
545	0.07
546	0.07
547	0.08
548	0.1
549	0.14
550	0.18
551	0.22
552	0.27
553	0.29
554	0.3
555	0.35
556	0.37
557	0.38
558	0.4
559	0.37
560	0.31
561	0.35
562	0.35
563	0.38
564	0.41
565	0.42
566	0.45
567	0.55
568	0.6
569	0.59
570	0.64
571	0.63
572	0.63
573	0.63
574	0.59

F0UPN6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer