Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0UP51

Protein Details
Accession F0UP51    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
735-756DVSPRDSRKVSRKQPKIARSLSHydrophilic
1025-1050SLEWGYGISRQRKRRKFDFKSTDVDCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 8.5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd08039  Adenylation_DNA_ligase_Fungal  
Amino Acid Sequences MGFKFSYVCDLFTSLENNLTLRASTASRHRNPDVATIANWFSQHGKQIHGGETDRLALLSCLFPERRPERVFGLKEPSLVKIIGRCLLLGISRRQALDSYKICGNGDLGQCVERVMRQAENDNPEDSGVTVEDIDTVLNHIASRCRFSGPDVRRRRTAAGVDEVLGPILRHLTSCEAKWLIRIILKDLSPLTLPARLILQNFHFLLPDLLLLQDSLGAAVALLSRDPMKRFPWRPDPDYAKLLASFAFSRISLDVGVKVGRPTFYKARGIKHCCKMAGKRTMSVERKYDGEYCQIHVDLSKGSGCIQIFSKSGKNSTMDRVGIHSTVKECLRIGKVGCKISRNCILEGELLVWSDVESKILPFHKLRKHVIRSGSFIGTENDSPPHSYEHLYIMLFDVLLIDDQACLPKSYRERRALLKEISHPIDGRAGIAEQEYIDFSLPESQEMLTTAFATAISQRWEGLVLKASDEPYFVIEQQEHSNFGHWIKLKKDYIAGIGDTADFALIGARYDAREAAKLQSIKGVQWTSFFVGCRDTGSKYPYDARPLFRVVDVLNRHNVNIQLLRTLNQSGRFCSCDVDDEDAPFIIKTDQIQLPKVQVLFKTPFVVEMVGSGFEKPAGANYFTLRFPRVLKIHMDRDVEDATTLEELQVLAEAANSVPKDELSQNTAWWAERLDAVDGEPGYIIDTSEHSPISVVSISQPTNLENAPSDTPLRRHLVANEQKVVTSMGKRREIDVSPRDSRKVSRKQPKIARSLSPCIAIHSDHTQTTANTHLSHSQDSVGARHLSNISNLSQPNPIPTYASVGDCEDAVATTSLGNKIECSTTLRKLDEDGLSRSPQPSQQKSAGQNPYQEQQCFAQLELGLAGSSPSVGPLDTLSFLSETPILLGTGVSRDKVDSIPLDPKLLTTSITEFLEKLLDPNFPDKSHFHHSNPDAAQNFSKCSGIVLVESNTTKASQAASDIARIGNALAINQRTGRLPSKRGKLIFLRCEAMLQHGLFERNQAGHPENIRERWESHGKQLFAGSLEWGYGISRQRKRRKFDFKSTDVDCEESSRVGRTKANDSPSPPTMGVDVQLSWDWREVLSLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.2
4 0.19
5 0.18
6 0.17
7 0.15
8 0.14
9 0.15
10 0.13
11 0.17
12 0.27
13 0.36
14 0.42
15 0.49
16 0.51
17 0.54
18 0.55
19 0.58
20 0.53
21 0.46
22 0.4
23 0.37
24 0.36
25 0.32
26 0.29
27 0.23
28 0.22
29 0.22
30 0.29
31 0.27
32 0.28
33 0.32
34 0.36
35 0.39
36 0.4
37 0.39
38 0.34
39 0.34
40 0.32
41 0.26
42 0.22
43 0.18
44 0.14
45 0.13
46 0.12
47 0.12
48 0.16
49 0.17
50 0.19
51 0.28
52 0.32
53 0.39
54 0.4
55 0.43
56 0.44
57 0.53
58 0.55
59 0.51
60 0.56
61 0.48
62 0.49
63 0.48
64 0.43
65 0.35
66 0.32
67 0.28
68 0.23
69 0.25
70 0.25
71 0.24
72 0.21
73 0.2
74 0.21
75 0.22
76 0.23
77 0.25
78 0.26
79 0.28
80 0.29
81 0.29
82 0.3
83 0.31
84 0.35
85 0.33
86 0.32
87 0.32
88 0.34
89 0.33
90 0.31
91 0.29
92 0.26
93 0.26
94 0.23
95 0.21
96 0.2
97 0.2
98 0.2
99 0.19
100 0.13
101 0.15
102 0.16
103 0.18
104 0.2
105 0.26
106 0.31
107 0.37
108 0.38
109 0.35
110 0.32
111 0.3
112 0.27
113 0.22
114 0.16
115 0.11
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.09
128 0.14
129 0.16
130 0.21
131 0.21
132 0.23
133 0.23
134 0.28
135 0.37
136 0.4
137 0.49
138 0.55
139 0.59
140 0.62
141 0.65
142 0.64
143 0.61
144 0.58
145 0.53
146 0.5
147 0.45
148 0.41
149 0.38
150 0.34
151 0.27
152 0.21
153 0.15
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.07
158 0.09
159 0.15
160 0.18
161 0.19
162 0.24
163 0.25
164 0.25
165 0.27
166 0.28
167 0.25
168 0.25
169 0.26
170 0.24
171 0.26
172 0.26
173 0.26
174 0.24
175 0.22
176 0.19
177 0.2
178 0.18
179 0.17
180 0.17
181 0.15
182 0.17
183 0.18
184 0.18
185 0.2
186 0.21
187 0.22
188 0.23
189 0.23
190 0.2
191 0.18
192 0.18
193 0.15
194 0.13
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.08
212 0.11
213 0.13
214 0.17
215 0.22
216 0.32
217 0.37
218 0.45
219 0.54
220 0.59
221 0.61
222 0.67
223 0.69
224 0.64
225 0.62
226 0.55
227 0.46
228 0.38
229 0.34
230 0.25
231 0.2
232 0.15
233 0.13
234 0.13
235 0.11
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.13
248 0.15
249 0.2
250 0.25
251 0.29
252 0.37
253 0.4
254 0.47
255 0.56
256 0.63
257 0.66
258 0.67
259 0.67
260 0.62
261 0.65
262 0.64
263 0.64
264 0.65
265 0.58
266 0.55
267 0.56
268 0.62
269 0.61
270 0.58
271 0.52
272 0.44
273 0.43
274 0.41
275 0.38
276 0.3
277 0.31
278 0.28
279 0.26
280 0.27
281 0.25
282 0.22
283 0.19
284 0.19
285 0.12
286 0.12
287 0.11
288 0.09
289 0.1
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.14
294 0.15
295 0.16
296 0.19
297 0.22
298 0.21
299 0.23
300 0.24
301 0.25
302 0.25
303 0.29
304 0.32
305 0.28
306 0.27
307 0.28
308 0.27
309 0.25
310 0.23
311 0.19
312 0.15
313 0.18
314 0.18
315 0.17
316 0.15
317 0.18
318 0.2
319 0.21
320 0.22
321 0.25
322 0.31
323 0.36
324 0.38
325 0.4
326 0.39
327 0.42
328 0.49
329 0.44
330 0.39
331 0.34
332 0.33
333 0.28
334 0.26
335 0.21
336 0.13
337 0.11
338 0.1
339 0.08
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.11
347 0.12
348 0.16
349 0.17
350 0.26
351 0.31
352 0.38
353 0.45
354 0.51
355 0.56
356 0.59
357 0.63
358 0.58
359 0.56
360 0.53
361 0.47
362 0.37
363 0.32
364 0.28
365 0.22
366 0.2
367 0.16
368 0.14
369 0.13
370 0.14
371 0.13
372 0.14
373 0.14
374 0.14
375 0.14
376 0.16
377 0.17
378 0.16
379 0.15
380 0.13
381 0.12
382 0.1
383 0.09
384 0.06
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.03
389 0.03
390 0.04
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.07
395 0.12
396 0.21
397 0.29
398 0.38
399 0.43
400 0.46
401 0.53
402 0.6
403 0.61
404 0.56
405 0.52
406 0.49
407 0.48
408 0.46
409 0.4
410 0.33
411 0.26
412 0.26
413 0.22
414 0.16
415 0.11
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.09
428 0.09
429 0.09
430 0.1
431 0.09
432 0.09
433 0.1
434 0.11
435 0.06
436 0.07
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.07
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.1
448 0.1
449 0.1
450 0.13
451 0.11
452 0.12
453 0.13
454 0.14
455 0.13
456 0.12
457 0.12
458 0.09
459 0.1
460 0.09
461 0.09
462 0.08
463 0.1
464 0.13
465 0.13
466 0.13
467 0.13
468 0.14
469 0.13
470 0.14
471 0.16
472 0.16
473 0.19
474 0.19
475 0.26
476 0.26
477 0.26
478 0.27
479 0.24
480 0.24
481 0.21
482 0.19
483 0.12
484 0.12
485 0.11
486 0.09
487 0.08
488 0.05
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.03
495 0.04
496 0.04
497 0.05
498 0.06
499 0.06
500 0.07
501 0.08
502 0.1
503 0.14
504 0.14
505 0.14
506 0.17
507 0.17
508 0.16
509 0.19
510 0.18
511 0.14
512 0.15
513 0.16
514 0.14
515 0.14
516 0.14
517 0.11
518 0.11
519 0.11
520 0.12
521 0.12
522 0.12
523 0.13
524 0.15
525 0.15
526 0.16
527 0.2
528 0.19
529 0.25
530 0.26
531 0.26
532 0.27
533 0.28
534 0.27
535 0.23
536 0.22
537 0.15
538 0.19
539 0.2
540 0.19
541 0.21
542 0.2
543 0.2
544 0.21
545 0.21
546 0.16
547 0.16
548 0.14
549 0.13
550 0.13
551 0.14
552 0.14
553 0.15
554 0.15
555 0.18
556 0.19
557 0.18
558 0.2
559 0.2
560 0.19
561 0.19
562 0.17
563 0.14
564 0.15
565 0.18
566 0.16
567 0.15
568 0.15
569 0.14
570 0.13
571 0.1
572 0.09
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.1
577 0.13
578 0.14
579 0.15
580 0.16
581 0.17
582 0.18
583 0.19
584 0.16
585 0.13
586 0.17
587 0.18
588 0.18
589 0.18
590 0.16
591 0.16
592 0.15
593 0.15
594 0.1
595 0.08
596 0.08
597 0.07
598 0.07
599 0.06
600 0.06
601 0.05
602 0.05
603 0.05
604 0.07
605 0.08
606 0.09
607 0.09
608 0.11
609 0.13
610 0.14
611 0.16
612 0.14
613 0.14
614 0.15
615 0.2
616 0.2
617 0.2
618 0.25
619 0.29
620 0.33
621 0.37
622 0.37
623 0.31
624 0.33
625 0.31
626 0.26
627 0.2
628 0.15
629 0.1
630 0.09
631 0.08
632 0.05
633 0.05
634 0.04
635 0.04
636 0.04
637 0.04
638 0.03
639 0.03
640 0.03
641 0.03
642 0.06
643 0.05
644 0.06
645 0.06
646 0.06
647 0.08
648 0.1
649 0.12
650 0.14
651 0.15
652 0.14
653 0.16
654 0.17
655 0.14
656 0.13
657 0.12
658 0.08
659 0.09
660 0.1
661 0.09
662 0.09
663 0.09
664 0.1
665 0.1
666 0.09
667 0.08
668 0.07
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.05
673 0.06
674 0.08
675 0.09
676 0.09
677 0.08
678 0.08
679 0.08
680 0.1
681 0.08
682 0.07
683 0.07
684 0.11
685 0.11
686 0.12
687 0.13
688 0.12
689 0.13
690 0.13
691 0.12
692 0.1
693 0.13
694 0.12
695 0.13
696 0.15
697 0.15
698 0.17
699 0.21
700 0.23
701 0.22
702 0.22
703 0.23
704 0.32
705 0.38
706 0.41
707 0.41
708 0.37
709 0.36
710 0.35
711 0.34
712 0.26
713 0.23
714 0.24
715 0.28
716 0.34
717 0.34
718 0.36
719 0.39
720 0.39
721 0.42
722 0.43
723 0.43
724 0.44
725 0.46
726 0.46
727 0.43
728 0.47
729 0.48
730 0.52
731 0.55
732 0.59
733 0.65
734 0.73
735 0.81
736 0.83
737 0.82
738 0.76
739 0.73
740 0.69
741 0.66
742 0.58
743 0.53
744 0.45
745 0.38
746 0.35
747 0.28
748 0.24
749 0.22
750 0.22
751 0.18
752 0.2
753 0.18
754 0.17
755 0.18
756 0.19
757 0.17
758 0.16
759 0.17
760 0.2
761 0.21
762 0.22
763 0.21
764 0.18
765 0.19
766 0.19
767 0.19
768 0.18
769 0.17
770 0.16
771 0.17
772 0.18
773 0.17
774 0.18
775 0.19
776 0.17
777 0.19
778 0.2
779 0.19
780 0.21
781 0.2
782 0.22
783 0.22
784 0.2
785 0.18
786 0.18
787 0.21
788 0.2
789 0.2
790 0.17
791 0.17
792 0.16
793 0.14
794 0.14
795 0.08
796 0.07
797 0.07
798 0.06
799 0.05
800 0.06
801 0.08
802 0.09
803 0.1
804 0.1
805 0.1
806 0.11
807 0.12
808 0.12
809 0.17
810 0.2
811 0.26
812 0.3
813 0.31
814 0.3
815 0.31
816 0.35
817 0.33
818 0.32
819 0.3
820 0.29
821 0.3
822 0.31
823 0.3
824 0.26
825 0.28
826 0.34
827 0.36
828 0.38
829 0.42
830 0.48
831 0.52
832 0.6
833 0.62
834 0.56
835 0.55
836 0.52
837 0.53
838 0.51
839 0.46
840 0.38
841 0.32
842 0.34
843 0.29
844 0.26
845 0.22
846 0.18
847 0.18
848 0.16
849 0.14
850 0.09
851 0.08
852 0.08
853 0.04
854 0.04
855 0.04
856 0.04
857 0.04
858 0.05
859 0.05
860 0.06
861 0.08
862 0.08
863 0.09
864 0.09
865 0.09
866 0.09
867 0.11
868 0.1
869 0.09
870 0.08
871 0.09
872 0.08
873 0.07
874 0.07
875 0.06
876 0.1
877 0.11
878 0.11
879 0.11
880 0.11
881 0.13
882 0.13
883 0.16
884 0.14
885 0.17
886 0.23
887 0.23
888 0.25
889 0.23
890 0.23
891 0.22
892 0.21
893 0.18
894 0.14
895 0.16
896 0.17
897 0.19
898 0.19
899 0.16
900 0.16
901 0.17
902 0.15
903 0.14
904 0.12
905 0.13
906 0.15
907 0.2
908 0.22
909 0.21
910 0.25
911 0.25
912 0.3
913 0.37
914 0.41
915 0.38
916 0.45
917 0.47
918 0.51
919 0.52
920 0.52
921 0.45
922 0.42
923 0.44
924 0.36
925 0.36
926 0.29
927 0.28
928 0.2
929 0.2
930 0.18
931 0.14
932 0.14
933 0.15
934 0.14
935 0.18
936 0.18
937 0.18
938 0.17
939 0.17
940 0.15
941 0.13
942 0.13
943 0.1
944 0.12
945 0.15
946 0.16
947 0.17
948 0.17
949 0.16
950 0.15
951 0.15
952 0.13
953 0.1
954 0.1
955 0.1
956 0.13
957 0.14
958 0.16
959 0.17
960 0.18
961 0.18
962 0.23
963 0.3
964 0.32
965 0.4
966 0.47
967 0.55
968 0.62
969 0.62
970 0.64
971 0.65
972 0.69
973 0.68
974 0.64
975 0.57
976 0.49
977 0.49
978 0.42
979 0.38
980 0.33
981 0.25
982 0.23
983 0.23
984 0.25
985 0.23
986 0.26
987 0.24
988 0.2
989 0.22
990 0.24
991 0.24
992 0.28
993 0.31
994 0.37
995 0.4
996 0.42
997 0.44
998 0.42
999 0.41
1000 0.43
1001 0.5
1002 0.44
1003 0.48
1004 0.52
1005 0.49
1006 0.48
1007 0.48
1008 0.42
1009 0.33
1010 0.31
1011 0.22
1012 0.15
1013 0.14
1014 0.12
1015 0.11
1016 0.1
1017 0.13
1018 0.2
1019 0.28
1020 0.36
1021 0.47
1022 0.58
1023 0.66
1024 0.75
1025 0.81
1026 0.85
1027 0.85
1028 0.88
1029 0.88
1030 0.83
1031 0.83
1032 0.78
1033 0.74
1034 0.65
1035 0.57
1036 0.47
1037 0.4
1038 0.36
1039 0.29
1040 0.27
1041 0.25
1042 0.26
1043 0.26
1044 0.3
1045 0.31
1046 0.38
1047 0.43
1048 0.49
1049 0.49
1050 0.51
1051 0.55
1052 0.54
1053 0.54
1054 0.46
1055 0.4
1056 0.34
1057 0.3
1058 0.26
1059 0.21
1060 0.18
1061 0.16
1062 0.18
1063 0.18
1064 0.18
1065 0.19
1066 0.18
1067 0.16