Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0UM19

Protein Details
Accession F0UM19    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
145-164ESEKWDKRMEKKQRHRDDTABasic
252-274LRKAEEIRLKKRKDRGRDDEEADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-266RLKKRKDR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPDQDNQQHHPSSGSELATPVALQDEAGVQVVNSKSPISPKENPVSNTASTLSADLENNKTTDAAFRTREMRDRFKALQARAKNAAEKNLRETAAESKRLATDPSLLSSISRKHAFASHNLLKADTEAQGEDFERKRAWDWTVDESEKWDKRMEKKQRHRDDTAFQDYRQDARKIYKRQMRQMQPDLEAYEKEKILAVEKAAASGGLQIVEAEDGELVAVDKNGTFYSTADSVDFAENKPERAAVDRLVADLRKAEEIRLKKRKDRGRDDEEADVTYINDKNKKFNQQLARFYNKYTAEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.23
3 0.22
4 0.22
5 0.2
6 0.18
7 0.12
8 0.1
9 0.08
10 0.07
11 0.07
12 0.08
13 0.08
14 0.09
15 0.08
16 0.06
17 0.11
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.13
22 0.14
23 0.19
24 0.25
25 0.28
26 0.34
27 0.41
28 0.48
29 0.54
30 0.54
31 0.54
32 0.53
33 0.46
34 0.41
35 0.35
36 0.28
37 0.22
38 0.21
39 0.17
40 0.14
41 0.15
42 0.16
43 0.18
44 0.18
45 0.18
46 0.17
47 0.16
48 0.14
49 0.18
50 0.18
51 0.21
52 0.21
53 0.24
54 0.28
55 0.31
56 0.39
57 0.41
58 0.45
59 0.45
60 0.49
61 0.49
62 0.53
63 0.57
64 0.54
65 0.56
66 0.52
67 0.53
68 0.52
69 0.51
70 0.49
71 0.44
72 0.48
73 0.45
74 0.43
75 0.42
76 0.41
77 0.39
78 0.33
79 0.33
80 0.34
81 0.34
82 0.36
83 0.31
84 0.28
85 0.29
86 0.29
87 0.28
88 0.2
89 0.19
90 0.16
91 0.18
92 0.17
93 0.15
94 0.15
95 0.17
96 0.19
97 0.19
98 0.2
99 0.18
100 0.18
101 0.24
102 0.25
103 0.26
104 0.33
105 0.33
106 0.36
107 0.35
108 0.34
109 0.29
110 0.28
111 0.25
112 0.17
113 0.12
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.13
119 0.12
120 0.13
121 0.12
122 0.13
123 0.14
124 0.16
125 0.17
126 0.18
127 0.2
128 0.23
129 0.27
130 0.27
131 0.26
132 0.26
133 0.32
134 0.28
135 0.27
136 0.25
137 0.25
138 0.32
139 0.42
140 0.49
141 0.53
142 0.63
143 0.73
144 0.79
145 0.82
146 0.79
147 0.73
148 0.69
149 0.65
150 0.64
151 0.54
152 0.44
153 0.42
154 0.37
155 0.36
156 0.35
157 0.29
158 0.21
159 0.28
160 0.37
161 0.38
162 0.46
163 0.5
164 0.52
165 0.6
166 0.68
167 0.69
168 0.69
169 0.7
170 0.65
171 0.59
172 0.54
173 0.46
174 0.38
175 0.3
176 0.24
177 0.19
178 0.15
179 0.13
180 0.13
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.12
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.05
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.1
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.12
220 0.14
221 0.15
222 0.12
223 0.19
224 0.19
225 0.2
226 0.2
227 0.19
228 0.18
229 0.21
230 0.23
231 0.17
232 0.21
233 0.2
234 0.21
235 0.23
236 0.22
237 0.19
238 0.18
239 0.18
240 0.18
241 0.18
242 0.2
243 0.25
244 0.33
245 0.44
246 0.51
247 0.56
248 0.59
249 0.68
250 0.75
251 0.78
252 0.8
253 0.8
254 0.79
255 0.8
256 0.77
257 0.73
258 0.66
259 0.56
260 0.46
261 0.36
262 0.27
263 0.23
264 0.22
265 0.21
266 0.26
267 0.26
268 0.34
269 0.41
270 0.51
271 0.53
272 0.59
273 0.65
274 0.68
275 0.77
276 0.76
277 0.78
278 0.69
279 0.66
280 0.65
281 0.55
282 0.5
283 0.44
284 0.41
285 0.39
286 0.39
287 0.41
288 0.4
289 0.4
290 0.37