FuNGI

F0UKP8

Protein Details

Accession

F0UKP8

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
547-566	SSPSSEPKTAKPRHPNHDHD	Hydrophilic
650-676	IKDKTPEERANRKREELRKQLEARNKT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
394-412	RSKSKGLGNIGGRHPPRRK
541-541	K
653-693	KTPEERANRKREELRKQLEARNKTGGTGPGVGGPAKKRRRF

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 10.333, mito 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015381 XLF_N IPR038051 XRCC4-like_N_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006302 P:double-strand break repair
Pfam	View protein in Pfam PF09302 XLF
CDD	cd22285 HD_XLF_N

Amino Acid Sequences

MSKWSKLQLPSDSPAPPLLYKYLTSKLGCEIYVTDLAHVWSQSLSRKEILKNASKYNTSIDPGEDEEQYFVFLQKISDALRGSEGSSLLLTSDPGGEKLKLLTSTKLPTPLVPLEWTFTLSQQPPNALAKHILLPILKGEANHEARILSLIGHVKQKDWTLNKLFDKIESSGVDLSMVFHGMGGVRLSRKESVYSQASQLIKGVAPFDENLWNNEYQVKDADYNLGVHIANELSFTSSFADRQIDDFAPDNWWNKLGTDSFGNARQTARKDKEQKNPVSEISPPPAEKDEASHSDDDEFQTMETPPRLRSPSRSKTKHDNLHKSPKSTGGSHVESDQDSAEESLETPTSSKNRSKHKTNIAGHPPKKKVQASSSAETTASEEDGNYVRSTSRHRSKSKGLGNIGGRHPPRRKQSLMELAGSTQSEAEYEAPINPKTISKTKGSLWAIGGKKKTQRPFQESPIGSTASDISDAPGTTPNSNPTKQTVDNDTPTESENEADLSTSRTVQHTLPEPSVLTSSPPLKPQSKSRGIGAIGQIGGKKKQPEPSSPSSEPKTAKPRHPNHDHDGNGDERETPPVFLPGPTKLKHQGGKLGMIGGRGAPAASNSRKERSRSQEVPELSPPPKPAMTPGDSEQPRAELGEKGIEAKQEIKDKTPEERANRKREELRKQLEARNKTGGTGPGVGGPAKKRRRF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.39
3	0.32
4	0.28
5	0.27
6	0.25
7	0.25
8	0.29
9	0.32
10	0.35
11	0.35
12	0.33
13	0.35
14	0.35
15	0.33
16	0.29
17	0.25
18	0.23
19	0.27
20	0.26
21	0.21
22	0.19
23	0.2
24	0.2
25	0.19
26	0.15
27	0.11
28	0.14
29	0.2
30	0.23
31	0.25
32	0.27
33	0.33
34	0.36
35	0.42
36	0.48
37	0.51
38	0.53
39	0.58
40	0.6
41	0.57
42	0.55
43	0.52
44	0.49
45	0.42
46	0.38
47	0.31
48	0.27
49	0.29
50	0.3
51	0.26
52	0.22
53	0.2
54	0.18
55	0.18
56	0.16
57	0.13
58	0.11
59	0.11
60	0.11
61	0.1
62	0.13
63	0.13
64	0.16
65	0.16
66	0.16
67	0.18
68	0.19
69	0.19
70	0.19
71	0.17
72	0.14
73	0.13
74	0.12
75	0.09
76	0.09
77	0.08
78	0.07
79	0.09
80	0.09
81	0.11
82	0.14
83	0.14
84	0.14
85	0.16
86	0.18
87	0.2
88	0.22
89	0.23
90	0.26
91	0.3
92	0.32
93	0.36
94	0.33
95	0.3
96	0.34
97	0.33
98	0.3
99	0.28
100	0.26
101	0.23
102	0.23
103	0.24
104	0.19
105	0.17
106	0.21
107	0.21
108	0.25
109	0.24
110	0.25
111	0.26
112	0.31
113	0.31
114	0.26
115	0.26
116	0.23
117	0.25
118	0.24
119	0.23
120	0.19
121	0.18
122	0.18
123	0.18
124	0.17
125	0.14
126	0.16
127	0.22
128	0.24
129	0.24
130	0.24
131	0.2
132	0.2
133	0.21
134	0.18
135	0.1
136	0.11
137	0.13
138	0.15
139	0.21
140	0.21
141	0.21
142	0.24
143	0.27
144	0.31
145	0.32
146	0.37
147	0.38
148	0.45
149	0.47
150	0.49
151	0.46
152	0.4
153	0.4
154	0.34
155	0.31
156	0.24
157	0.24
158	0.19
159	0.19
160	0.17
161	0.13
162	0.13
163	0.09
164	0.09
165	0.07
166	0.06
167	0.06
168	0.06
169	0.07
170	0.06
171	0.08
172	0.09
173	0.1
174	0.13
175	0.15
176	0.16
177	0.18
178	0.19
179	0.24
180	0.27
181	0.28
182	0.27
183	0.31
184	0.3
185	0.28
186	0.26
187	0.21
188	0.17
189	0.16
190	0.15
191	0.09
192	0.09
193	0.09
194	0.1
195	0.16
196	0.16
197	0.17
198	0.19
199	0.19
200	0.19
201	0.22
202	0.2
203	0.15
204	0.16
205	0.15
206	0.13
207	0.14
208	0.15
209	0.13
210	0.13
211	0.12
212	0.13
213	0.11
214	0.1
215	0.1
216	0.08
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.08
224	0.09
225	0.09
226	0.1
227	0.12
228	0.1
229	0.12
230	0.15
231	0.13
232	0.14
233	0.15
234	0.14
235	0.16
236	0.18
237	0.19
238	0.15
239	0.16
240	0.15
241	0.14
242	0.16
243	0.13
244	0.13
245	0.13
246	0.14
247	0.14
248	0.18
249	0.19
250	0.17
251	0.18
252	0.21
253	0.23
254	0.31
255	0.34
256	0.39
257	0.49
258	0.57
259	0.65
260	0.71
261	0.72
262	0.68
263	0.66
264	0.58
265	0.5
266	0.44
267	0.37
268	0.31
269	0.28
270	0.23
271	0.21
272	0.22
273	0.21
274	0.17
275	0.17
276	0.18
277	0.19
278	0.22
279	0.21
280	0.19
281	0.19
282	0.2
283	0.18
284	0.14
285	0.1
286	0.07
287	0.09
288	0.09
289	0.1
290	0.11
291	0.11
292	0.12
293	0.16
294	0.19
295	0.19
296	0.27
297	0.36
298	0.44
299	0.53
300	0.58
301	0.59
302	0.66
303	0.74
304	0.75
305	0.74
306	0.74
307	0.72
308	0.78
309	0.76
310	0.68
311	0.6
312	0.57
313	0.5
314	0.41
315	0.38
316	0.32
317	0.31
318	0.29
319	0.29
320	0.24
321	0.21
322	0.2
323	0.15
324	0.09
325	0.07
326	0.07
327	0.06
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.07
335	0.1
336	0.13
337	0.18
338	0.24
339	0.34
340	0.4
341	0.47
342	0.53
343	0.6
344	0.67
345	0.66
346	0.69
347	0.69
348	0.73
349	0.71
350	0.71
351	0.65
352	0.59
353	0.62
354	0.55
355	0.49
356	0.43
357	0.48
358	0.46
359	0.45
360	0.43
361	0.37
362	0.34
363	0.3
364	0.27
365	0.17
366	0.11
367	0.08
368	0.06
369	0.07
370	0.08
371	0.09
372	0.08
373	0.07
374	0.08
375	0.09
376	0.15
377	0.22
378	0.31
379	0.38
380	0.42
381	0.47
382	0.54
383	0.62
384	0.63
385	0.62
386	0.54
387	0.52
388	0.52
389	0.52
390	0.46
391	0.44
392	0.39
393	0.39
394	0.42
395	0.43
396	0.47
397	0.48
398	0.49
399	0.46
400	0.54
401	0.56
402	0.54
403	0.48
404	0.41
405	0.35
406	0.33
407	0.29
408	0.2
409	0.1
410	0.08
411	0.06
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.07
416	0.09
417	0.11
418	0.11
419	0.12
420	0.12
421	0.13
422	0.17
423	0.22
424	0.23
425	0.23
426	0.26
427	0.27
428	0.36
429	0.35
430	0.33
431	0.3
432	0.34
433	0.34
434	0.36
435	0.37
436	0.32
437	0.38
438	0.42
439	0.48
440	0.49
441	0.55
442	0.59
443	0.63
444	0.65
445	0.68
446	0.61
447	0.58
448	0.52
449	0.43
450	0.34
451	0.29
452	0.23
453	0.14
454	0.14
455	0.1
456	0.08
457	0.08
458	0.08
459	0.09
460	0.12
461	0.14
462	0.14
463	0.16
464	0.21
465	0.25
466	0.26
467	0.27
468	0.26
469	0.3
470	0.32
471	0.34
472	0.36
473	0.36
474	0.38
475	0.38
476	0.36
477	0.31
478	0.29
479	0.28
480	0.2
481	0.15
482	0.12
483	0.11
484	0.1
485	0.1
486	0.09
487	0.1
488	0.1
489	0.11
490	0.12
491	0.12
492	0.14
493	0.14
494	0.18
495	0.22
496	0.24
497	0.24
498	0.24
499	0.23
500	0.22
501	0.23
502	0.18
503	0.14
504	0.14
505	0.18
506	0.18
507	0.22
508	0.27
509	0.3
510	0.34
511	0.41
512	0.48
513	0.53
514	0.53
515	0.51
516	0.52
517	0.48
518	0.49
519	0.42
520	0.35
521	0.26
522	0.25
523	0.25
524	0.21
525	0.22
526	0.22
527	0.25
528	0.26
529	0.33
530	0.37
531	0.43
532	0.49
533	0.55
534	0.6
535	0.6
536	0.62
537	0.58
538	0.6
539	0.54
540	0.54
541	0.56
542	0.54
543	0.6
544	0.64
545	0.69
546	0.73
547	0.8
548	0.8
549	0.77
550	0.79
551	0.7
552	0.62
553	0.57
554	0.49
555	0.41
556	0.34
557	0.27
558	0.19
559	0.22
560	0.2
561	0.18
562	0.16
563	0.18
564	0.18
565	0.19
566	0.21
567	0.23
568	0.29
569	0.29
570	0.34
571	0.38
572	0.45
573	0.48
574	0.48
575	0.49
576	0.46
577	0.49
578	0.44
579	0.41
580	0.34
581	0.3
582	0.27
583	0.19
584	0.16
585	0.12
586	0.11
587	0.07
588	0.08
589	0.15
590	0.19
591	0.27
592	0.3
593	0.38
594	0.43
595	0.48
596	0.56
597	0.58
598	0.64
599	0.62
600	0.65
601	0.66
602	0.64
603	0.64
604	0.6
605	0.57
606	0.48
607	0.46
608	0.41
609	0.37
610	0.35
611	0.3
612	0.31
613	0.32
614	0.34
615	0.35
616	0.36
617	0.41
618	0.41
619	0.43
620	0.38
621	0.32
622	0.29
623	0.26
624	0.25
625	0.18
626	0.19
627	0.21
628	0.2
629	0.22
630	0.23
631	0.23
632	0.23
633	0.25
634	0.29
635	0.32
636	0.34
637	0.36
638	0.41
639	0.43
640	0.49
641	0.54
642	0.57
643	0.58
644	0.67
645	0.72
646	0.75
647	0.78
648	0.79
649	0.79
650	0.81
651	0.82
652	0.81
653	0.79
654	0.79
655	0.8
656	0.8
657	0.8
658	0.77
659	0.72
660	0.7
661	0.63
662	0.54
663	0.51
664	0.47
665	0.41
666	0.37
667	0.32
668	0.27
669	0.28
670	0.27
671	0.27
672	0.3
673	0.37

F0UKP8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer