Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0UIK7

Protein Details
Accession Q0UIK7    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
523-549EASGNESTRKKHKKNRDRLPDGSRKSABasic
564-585MTDAGKLKKKSKKSKLVIGATPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-45RPRPPAKKAGGALRAPRKPLK
427-438KESRKRIAKREK
513-515KKR
529-548STRKKHKKNRDRLPDGSRKS
568-578GKLKKKSKKSK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 12.333, mito 10, cyto_mito 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005674  C:transcription factor TFIIF complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0016251  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity  
GO:0001096  F:TFIIF-class transcription factor complex binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG pno:SNOG_08407  -  
Amino Acid Sequences MNGHPPAASAPAAPPAANGQHVAQRPRPPAKKAGGALRAPRKPLKSITRPMVSLTKMNEMKAPAEPTGPPDSRQEADALRQEYIRQGANVYPLVVTRRDLKELRHHVMRLQHKGPVDIQDNQQFTPPIRLHRRDPRAPPSGAGSHFEEEETKEDMEEIKERERIELQKEDRRKVREENQAKIAPTGKTKTQAFKKNIEQKYRADDTPEAKKRQLLRYEETLPWHLEDFENKQTWVGTYESELSEAHVMLSMDPTNGHNAVYLAPMERWYRFNVKSKLKPTGDDVDKIAFKIENVGGFLGRLEAQAARKQRDEAMSKMGRGMATRLGGGADDEGRIRRPIDFDGGGAAIKREADADDIDFNLDEDFADDEEGLNGLFEGEAEEVKEAEEKLKRDRLAASLWDRPDEAQLALEEELEKKFAEENKLAEKESRKRIAKREKRYDVLDSDEENPYVTSSESDTDSETERLRAKEEQEKKALEADGKAPDGSNLPSGASSKGNNTPSGNHKSVDVKSKKRPGSPNLSEASGNESTRKKHKKNRDRLPDGSRKSALASHRGAASGSDSEMTDAGKLKKKSKKSKLVIGATPSGSPGASRAGSPAASPPMSGSRAGSPSASSPKPGMPTAKELYESLPPTGMNIQNLIAKFKGRVDKTNSALFIRLVKAVSSFDKANSWLTPLPQMPSEESINAFMNAAKPKPAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.22
4 0.22
5 0.22
6 0.19
7 0.25
8 0.31
9 0.36
10 0.39
11 0.44
12 0.52
13 0.61
14 0.66
15 0.65
16 0.68
17 0.69
18 0.71
19 0.68
20 0.69
21 0.67
22 0.66
23 0.7
24 0.7
25 0.68
26 0.66
27 0.67
28 0.62
29 0.59
30 0.62
31 0.63
32 0.63
33 0.68
34 0.71
35 0.69
36 0.66
37 0.65
38 0.62
39 0.54
40 0.49
41 0.43
42 0.44
43 0.4
44 0.4
45 0.39
46 0.34
47 0.34
48 0.34
49 0.34
50 0.25
51 0.26
52 0.25
53 0.27
54 0.34
55 0.33
56 0.3
57 0.31
58 0.35
59 0.33
60 0.34
61 0.32
62 0.25
63 0.3
64 0.35
65 0.32
66 0.28
67 0.28
68 0.28
69 0.29
70 0.29
71 0.25
72 0.19
73 0.19
74 0.2
75 0.23
76 0.23
77 0.2
78 0.17
79 0.17
80 0.19
81 0.19
82 0.18
83 0.22
84 0.24
85 0.3
86 0.32
87 0.36
88 0.44
89 0.51
90 0.56
91 0.55
92 0.53
93 0.51
94 0.57
95 0.61
96 0.58
97 0.52
98 0.5
99 0.44
100 0.46
101 0.44
102 0.43
103 0.38
104 0.34
105 0.37
106 0.4
107 0.4
108 0.38
109 0.38
110 0.32
111 0.29
112 0.34
113 0.31
114 0.33
115 0.41
116 0.46
117 0.52
118 0.61
119 0.69
120 0.69
121 0.75
122 0.74
123 0.72
124 0.68
125 0.61
126 0.56
127 0.52
128 0.45
129 0.4
130 0.35
131 0.28
132 0.27
133 0.26
134 0.22
135 0.18
136 0.19
137 0.18
138 0.15
139 0.13
140 0.13
141 0.14
142 0.16
143 0.18
144 0.18
145 0.2
146 0.23
147 0.23
148 0.25
149 0.29
150 0.31
151 0.33
152 0.39
153 0.41
154 0.47
155 0.53
156 0.59
157 0.61
158 0.61
159 0.6
160 0.59
161 0.63
162 0.65
163 0.65
164 0.63
165 0.64
166 0.63
167 0.59
168 0.53
169 0.48
170 0.39
171 0.37
172 0.35
173 0.29
174 0.32
175 0.35
176 0.41
177 0.46
178 0.54
179 0.54
180 0.58
181 0.65
182 0.68
183 0.72
184 0.72
185 0.67
186 0.61
187 0.64
188 0.62
189 0.52
190 0.46
191 0.43
192 0.4
193 0.46
194 0.5
195 0.46
196 0.42
197 0.47
198 0.49
199 0.53
200 0.56
201 0.51
202 0.48
203 0.51
204 0.55
205 0.52
206 0.49
207 0.43
208 0.36
209 0.31
210 0.26
211 0.2
212 0.16
213 0.17
214 0.19
215 0.22
216 0.22
217 0.21
218 0.21
219 0.2
220 0.2
221 0.19
222 0.15
223 0.1
224 0.1
225 0.13
226 0.12
227 0.13
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.07
250 0.07
251 0.1
252 0.11
253 0.12
254 0.13
255 0.16
256 0.22
257 0.26
258 0.35
259 0.41
260 0.48
261 0.55
262 0.58
263 0.64
264 0.58
265 0.55
266 0.51
267 0.52
268 0.45
269 0.39
270 0.36
271 0.3
272 0.29
273 0.27
274 0.23
275 0.14
276 0.11
277 0.13
278 0.13
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.08
291 0.13
292 0.17
293 0.19
294 0.2
295 0.21
296 0.23
297 0.27
298 0.29
299 0.26
300 0.31
301 0.3
302 0.29
303 0.29
304 0.27
305 0.22
306 0.18
307 0.18
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.1
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.07
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.06
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.1
325 0.1
326 0.13
327 0.13
328 0.12
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.1
333 0.08
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.05
349 0.03
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.02
363 0.02
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.06
372 0.05
373 0.09
374 0.12
375 0.14
376 0.19
377 0.24
378 0.24
379 0.25
380 0.27
381 0.25
382 0.24
383 0.28
384 0.27
385 0.27
386 0.27
387 0.26
388 0.25
389 0.23
390 0.22
391 0.17
392 0.13
393 0.09
394 0.08
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.06
404 0.09
405 0.12
406 0.16
407 0.17
408 0.19
409 0.26
410 0.28
411 0.28
412 0.29
413 0.33
414 0.36
415 0.43
416 0.49
417 0.48
418 0.53
419 0.63
420 0.7
421 0.74
422 0.77
423 0.79
424 0.78
425 0.75
426 0.73
427 0.68
428 0.59
429 0.54
430 0.45
431 0.36
432 0.32
433 0.29
434 0.25
435 0.2
436 0.18
437 0.13
438 0.11
439 0.09
440 0.07
441 0.07
442 0.08
443 0.09
444 0.1
445 0.11
446 0.11
447 0.13
448 0.14
449 0.14
450 0.15
451 0.18
452 0.18
453 0.2
454 0.22
455 0.24
456 0.32
457 0.4
458 0.43
459 0.45
460 0.46
461 0.44
462 0.44
463 0.41
464 0.33
465 0.27
466 0.24
467 0.21
468 0.21
469 0.2
470 0.16
471 0.15
472 0.16
473 0.15
474 0.13
475 0.1
476 0.09
477 0.1
478 0.11
479 0.12
480 0.13
481 0.13
482 0.15
483 0.21
484 0.23
485 0.25
486 0.25
487 0.28
488 0.33
489 0.4
490 0.38
491 0.32
492 0.33
493 0.36
494 0.38
495 0.44
496 0.45
497 0.45
498 0.53
499 0.62
500 0.65
501 0.67
502 0.72
503 0.7
504 0.72
505 0.7
506 0.67
507 0.6
508 0.56
509 0.48
510 0.4
511 0.39
512 0.31
513 0.26
514 0.24
515 0.25
516 0.27
517 0.38
518 0.48
519 0.5
520 0.58
521 0.69
522 0.75
523 0.83
524 0.9
525 0.91
526 0.89
527 0.88
528 0.88
529 0.87
530 0.8
531 0.76
532 0.66
533 0.56
534 0.49
535 0.45
536 0.39
537 0.36
538 0.33
539 0.29
540 0.28
541 0.28
542 0.26
543 0.22
544 0.21
545 0.14
546 0.13
547 0.11
548 0.1
549 0.1
550 0.11
551 0.1
552 0.09
553 0.13
554 0.18
555 0.25
556 0.29
557 0.37
558 0.45
559 0.55
560 0.65
561 0.72
562 0.77
563 0.78
564 0.84
565 0.85
566 0.84
567 0.79
568 0.73
569 0.67
570 0.57
571 0.49
572 0.39
573 0.3
574 0.22
575 0.17
576 0.13
577 0.12
578 0.11
579 0.11
580 0.13
581 0.14
582 0.15
583 0.15
584 0.18
585 0.19
586 0.18
587 0.18
588 0.19
589 0.22
590 0.23
591 0.23
592 0.21
593 0.21
594 0.23
595 0.24
596 0.22
597 0.19
598 0.23
599 0.29
600 0.28
601 0.25
602 0.26
603 0.29
604 0.32
605 0.34
606 0.35
607 0.31
608 0.38
609 0.39
610 0.39
611 0.37
612 0.34
613 0.33
614 0.34
615 0.32
616 0.26
617 0.24
618 0.21
619 0.22
620 0.28
621 0.28
622 0.22
623 0.21
624 0.22
625 0.24
626 0.25
627 0.26
628 0.21
629 0.2
630 0.2
631 0.26
632 0.33
633 0.33
634 0.41
635 0.46
636 0.54
637 0.56
638 0.61
639 0.57
640 0.5
641 0.48
642 0.41
643 0.37
644 0.3
645 0.28
646 0.22
647 0.2
648 0.2
649 0.21
650 0.23
651 0.23
652 0.22
653 0.21
654 0.24
655 0.25
656 0.27
657 0.24
658 0.26
659 0.24
660 0.25
661 0.3
662 0.3
663 0.31
664 0.3
665 0.32
666 0.31
667 0.32
668 0.33
669 0.28
670 0.27
671 0.28
672 0.26
673 0.24
674 0.21
675 0.18
676 0.21
677 0.24
678 0.24
679 0.24