Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0UDB7

Protein Details
Accession F0UDB7    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-247AYIKGKEEKARREKARKEKAFVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-66PRYGKREGPSEPPRAANPALARPRGGRGGR
201-220KPNEGVKADKKWATAKALKR
228-245IKGKEEKARREKARKEKA
257-295PRGNRGGRGGGRGGAGGRGRGGAPGGAGHRGGRGGPAGG
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSDVRSKNLYELLGNDPEEDSDREPSPPTSAVTKPGPRYGKREGPSEPPRAANPALARPRGGRGGRYGNEQAFRDPEASARANRKKPVDAPLPDVPTGVVKNRDARGNLLREDRTNRSDRTETTKQVEQGWGATSGESAWEDERAGAATAKRETKEGPGGDAAANDAEAAEAEDKAKSYAEYLAEQAEQRRDDLGIKEARKPNEGVKADKKWATAKALKRDEDEEAYIKGKEEKARREKARKEKAFVEVDMRFVEQPRGNRGGRGGGRGGAGGRGRGGAPGGAGHRGGRGGPAGGPAAGPSVDEKNFPALGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.27
3 0.23
4 0.23
5 0.24
6 0.23
7 0.2
8 0.2
9 0.21
10 0.21
11 0.23
12 0.24
13 0.24
14 0.23
15 0.23
16 0.24
17 0.25
18 0.29
19 0.35
20 0.41
21 0.41
22 0.48
23 0.54
24 0.53
25 0.58
26 0.61
27 0.63
28 0.59
29 0.61
30 0.56
31 0.58
32 0.62
33 0.62
34 0.56
35 0.49
36 0.47
37 0.46
38 0.43
39 0.38
40 0.33
41 0.36
42 0.4
43 0.38
44 0.39
45 0.35
46 0.38
47 0.42
48 0.4
49 0.33
50 0.32
51 0.4
52 0.4
53 0.45
54 0.45
55 0.41
56 0.44
57 0.42
58 0.38
59 0.31
60 0.31
61 0.25
62 0.2
63 0.18
64 0.19
65 0.21
66 0.23
67 0.31
68 0.39
69 0.43
70 0.49
71 0.51
72 0.51
73 0.53
74 0.56
75 0.55
76 0.49
77 0.5
78 0.51
79 0.51
80 0.45
81 0.41
82 0.33
83 0.26
84 0.24
85 0.21
86 0.18
87 0.17
88 0.23
89 0.25
90 0.28
91 0.27
92 0.3
93 0.33
94 0.34
95 0.35
96 0.35
97 0.34
98 0.33
99 0.38
100 0.38
101 0.37
102 0.37
103 0.35
104 0.36
105 0.37
106 0.36
107 0.4
108 0.41
109 0.39
110 0.39
111 0.41
112 0.37
113 0.37
114 0.35
115 0.27
116 0.22
117 0.19
118 0.16
119 0.12
120 0.11
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.09
136 0.11
137 0.14
138 0.14
139 0.14
140 0.15
141 0.17
142 0.22
143 0.2
144 0.18
145 0.16
146 0.17
147 0.16
148 0.15
149 0.12
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.05
165 0.06
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.12
173 0.14
174 0.15
175 0.14
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.14
180 0.15
181 0.19
182 0.22
183 0.23
184 0.3
185 0.35
186 0.36
187 0.36
188 0.37
189 0.35
190 0.38
191 0.39
192 0.38
193 0.41
194 0.44
195 0.47
196 0.47
197 0.45
198 0.39
199 0.4
200 0.41
201 0.4
202 0.43
203 0.48
204 0.53
205 0.53
206 0.51
207 0.5
208 0.47
209 0.42
210 0.37
211 0.29
212 0.24
213 0.23
214 0.21
215 0.2
216 0.2
217 0.2
218 0.24
219 0.3
220 0.38
221 0.47
222 0.56
223 0.65
224 0.72
225 0.79
226 0.83
227 0.87
228 0.84
229 0.79
230 0.75
231 0.73
232 0.67
233 0.58
234 0.54
235 0.43
236 0.39
237 0.34
238 0.3
239 0.23
240 0.2
241 0.25
242 0.22
243 0.25
244 0.29
245 0.35
246 0.34
247 0.35
248 0.36
249 0.39
250 0.37
251 0.38
252 0.33
253 0.28
254 0.28
255 0.27
256 0.26
257 0.21
258 0.2
259 0.16
260 0.15
261 0.14
262 0.14
263 0.14
264 0.14
265 0.09
266 0.09
267 0.11
268 0.12
269 0.13
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.15
274 0.14
275 0.13
276 0.13
277 0.12
278 0.12
279 0.14
280 0.14
281 0.13
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.1
286 0.1
287 0.11
288 0.15
289 0.16
290 0.17
291 0.18
292 0.22
293 0.22