Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0U906

Protein Details
Accession F0U906    Localization Confidence Low Confidence Score 7.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
341-366MKNRCRGTSVHAWRRSRKSRTRYNEFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 8, mito 7.5, cyto_mito 7, cyto 5.5, plas 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF07928  Vps54  
Amino Acid Sequences MSTPSGGKSGNPRSVAVSLSPRAEDPFPGHDWSSRSPRQLAIRDSNARSVRPAFRRDVIYRKRWLKPLTCRAFVQAVDKAQSEMTKVLRVRTEQTVRFRLTDFLSYFTLNRLFVNECEAVSGHSGTALKDVANNQILGFIPFLHEVEKQKLVQKMEFEKWERIDFKPQDELILAHIAYAAKQNKKGPTLAVIEEGKFMLVDSAVFALRGIEQYTILLASILAMANEISTVLLDYRKLHNSCTPLLIFGAGARITAGLTNINAKHLALTSQSLSFIALIPYVRKCVRRRPSITASGMAEYDRLKRLFQDHRSSIHEKLIDIMSFRVTLYIREMEKIKWDDEMKNRCRGTSVHAWRRSRKSRTRYNEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.42
3 0.36
4 0.34
5 0.31
6 0.31
7 0.31
8 0.27
9 0.29
10 0.28
11 0.27
12 0.24
13 0.26
14 0.27
15 0.29
16 0.29
17 0.3
18 0.33
19 0.37
20 0.42
21 0.42
22 0.43
23 0.42
24 0.47
25 0.52
26 0.55
27 0.57
28 0.55
29 0.59
30 0.62
31 0.62
32 0.65
33 0.59
34 0.53
35 0.49
36 0.47
37 0.47
38 0.46
39 0.49
40 0.46
41 0.48
42 0.54
43 0.56
44 0.6
45 0.6
46 0.61
47 0.65
48 0.69
49 0.7
50 0.71
51 0.73
52 0.72
53 0.73
54 0.77
55 0.75
56 0.7
57 0.65
58 0.6
59 0.57
60 0.48
61 0.42
62 0.36
63 0.3
64 0.29
65 0.28
66 0.25
67 0.22
68 0.22
69 0.18
70 0.17
71 0.16
72 0.2
73 0.21
74 0.24
75 0.26
76 0.28
77 0.3
78 0.35
79 0.41
80 0.41
81 0.48
82 0.51
83 0.5
84 0.49
85 0.46
86 0.4
87 0.35
88 0.34
89 0.28
90 0.24
91 0.23
92 0.23
93 0.22
94 0.21
95 0.21
96 0.15
97 0.15
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.18
102 0.16
103 0.14
104 0.15
105 0.15
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.07
110 0.08
111 0.09
112 0.08
113 0.1
114 0.09
115 0.08
116 0.1
117 0.11
118 0.13
119 0.14
120 0.14
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.13
125 0.12
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.11
132 0.12
133 0.16
134 0.19
135 0.19
136 0.23
137 0.27
138 0.27
139 0.27
140 0.29
141 0.31
142 0.32
143 0.36
144 0.35
145 0.35
146 0.34
147 0.37
148 0.35
149 0.31
150 0.37
151 0.33
152 0.32
153 0.33
154 0.31
155 0.27
156 0.25
157 0.24
158 0.16
159 0.16
160 0.13
161 0.08
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.13
166 0.16
167 0.16
168 0.19
169 0.23
170 0.25
171 0.27
172 0.28
173 0.23
174 0.23
175 0.24
176 0.22
177 0.22
178 0.2
179 0.18
180 0.18
181 0.17
182 0.12
183 0.09
184 0.08
185 0.04
186 0.04
187 0.03
188 0.03
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.04
207 0.04
208 0.03
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.02
215 0.02
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.08
221 0.12
222 0.19
223 0.2
224 0.22
225 0.25
226 0.29
227 0.29
228 0.31
229 0.27
230 0.21
231 0.2
232 0.18
233 0.14
234 0.1
235 0.11
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.05
244 0.06
245 0.1
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.13
253 0.09
254 0.11
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.1
266 0.11
267 0.16
268 0.19
269 0.26
270 0.3
271 0.4
272 0.49
273 0.57
274 0.62
275 0.67
276 0.71
277 0.73
278 0.72
279 0.65
280 0.58
281 0.48
282 0.42
283 0.33
284 0.27
285 0.19
286 0.2
287 0.21
288 0.2
289 0.19
290 0.21
291 0.29
292 0.37
293 0.44
294 0.5
295 0.49
296 0.53
297 0.6
298 0.61
299 0.56
300 0.52
301 0.45
302 0.35
303 0.35
304 0.33
305 0.27
306 0.24
307 0.23
308 0.18
309 0.16
310 0.16
311 0.16
312 0.13
313 0.13
314 0.17
315 0.21
316 0.21
317 0.24
318 0.26
319 0.25
320 0.33
321 0.35
322 0.31
323 0.32
324 0.35
325 0.39
326 0.47
327 0.56
328 0.53
329 0.59
330 0.59
331 0.53
332 0.52
333 0.46
334 0.44
335 0.45
336 0.51
337 0.52
338 0.6
339 0.68
340 0.74
341 0.83
342 0.86
343 0.85
344 0.84
345 0.84
346 0.86