Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QVV5

Protein Details
Accession C4QVV5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
319-343EDKRELEREQRLKKEKWQRLNQLKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
206-240RRSKPPVAMVPPPIAKPSAKLAAKLAARRKKNASK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
KEGG ppa:PAS_chr1-1_0024  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSTLSNLLSQLKGEGGGGSSGQNRPRTVDPAVARLKAERKMEREKQALKEAQQAQEARERRRISHATQIGLRPTSKAPKINSQRPPLSTSRSRPTPPPSARQKVETKSCKPTKPLNFGDLMKKAETIDSSQFAIANKVVVTPKKTNEVPRKRIVRSQPQDNLEASQRASKKPAQLYQEGGSQISRTAPRQTSTRDIQKSLKDNHARRSKPPVAMVPPPIAKPSAKLAAKLAARRKKNASKAQRYDSDVESDLDGFIDDDEDDENQYNDQGYDRNEIWSLFSRNGKRRYDYDDDESDDMEANLEDIEREERMALKSAVLEDKRELEREQRLKKEKWQRLNQLKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.1
4 0.1
5 0.11
6 0.15
7 0.19
8 0.25
9 0.29
10 0.29
11 0.32
12 0.36
13 0.38
14 0.37
15 0.41
16 0.37
17 0.42
18 0.46
19 0.43
20 0.4
21 0.41
22 0.44
23 0.42
24 0.48
25 0.46
26 0.48
27 0.57
28 0.65
29 0.68
30 0.71
31 0.72
32 0.7
33 0.72
34 0.71
35 0.63
36 0.64
37 0.6
38 0.55
39 0.54
40 0.49
41 0.42
42 0.45
43 0.48
44 0.44
45 0.46
46 0.45
47 0.41
48 0.49
49 0.52
50 0.48
51 0.52
52 0.52
53 0.47
54 0.49
55 0.5
56 0.45
57 0.42
58 0.39
59 0.31
60 0.31
61 0.35
62 0.35
63 0.38
64 0.38
65 0.46
66 0.55
67 0.62
68 0.67
69 0.67
70 0.68
71 0.64
72 0.66
73 0.6
74 0.58
75 0.56
76 0.54
77 0.54
78 0.54
79 0.54
80 0.55
81 0.57
82 0.6
83 0.57
84 0.6
85 0.62
86 0.64
87 0.64
88 0.64
89 0.65
90 0.62
91 0.67
92 0.66
93 0.62
94 0.64
95 0.69
96 0.67
97 0.64
98 0.67
99 0.65
100 0.66
101 0.63
102 0.56
103 0.53
104 0.51
105 0.52
106 0.46
107 0.39
108 0.3
109 0.27
110 0.24
111 0.21
112 0.19
113 0.16
114 0.15
115 0.14
116 0.15
117 0.14
118 0.15
119 0.14
120 0.15
121 0.12
122 0.1
123 0.08
124 0.1
125 0.12
126 0.13
127 0.18
128 0.2
129 0.22
130 0.26
131 0.29
132 0.37
133 0.45
134 0.53
135 0.55
136 0.6
137 0.65
138 0.62
139 0.66
140 0.65
141 0.65
142 0.61
143 0.63
144 0.61
145 0.56
146 0.56
147 0.5
148 0.43
149 0.34
150 0.29
151 0.21
152 0.2
153 0.19
154 0.18
155 0.21
156 0.22
157 0.25
158 0.29
159 0.33
160 0.32
161 0.33
162 0.35
163 0.33
164 0.33
165 0.28
166 0.24
167 0.19
168 0.15
169 0.13
170 0.12
171 0.12
172 0.1
173 0.15
174 0.16
175 0.18
176 0.21
177 0.24
178 0.28
179 0.32
180 0.4
181 0.37
182 0.39
183 0.42
184 0.45
185 0.48
186 0.46
187 0.5
188 0.5
189 0.51
190 0.57
191 0.62
192 0.59
193 0.56
194 0.62
195 0.58
196 0.53
197 0.53
198 0.49
199 0.44
200 0.46
201 0.45
202 0.39
203 0.34
204 0.31
205 0.29
206 0.25
207 0.2
208 0.18
209 0.2
210 0.24
211 0.23
212 0.23
213 0.24
214 0.28
215 0.31
216 0.36
217 0.41
218 0.41
219 0.44
220 0.48
221 0.55
222 0.58
223 0.64
224 0.69
225 0.7
226 0.73
227 0.77
228 0.79
229 0.76
230 0.72
231 0.66
232 0.57
233 0.49
234 0.4
235 0.33
236 0.26
237 0.21
238 0.16
239 0.13
240 0.11
241 0.07
242 0.06
243 0.05
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.12
258 0.16
259 0.17
260 0.18
261 0.19
262 0.19
263 0.21
264 0.25
265 0.25
266 0.25
267 0.31
268 0.38
269 0.46
270 0.54
271 0.56
272 0.55
273 0.56
274 0.6
275 0.61
276 0.59
277 0.57
278 0.53
279 0.52
280 0.48
281 0.44
282 0.36
283 0.29
284 0.22
285 0.16
286 0.11
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.09
293 0.08
294 0.09
295 0.1
296 0.12
297 0.14
298 0.19
299 0.17
300 0.17
301 0.18
302 0.21
303 0.28
304 0.27
305 0.28
306 0.26
307 0.32
308 0.33
309 0.35
310 0.34
311 0.33
312 0.42
313 0.5
314 0.56
315 0.61
316 0.66
317 0.69
318 0.77
319 0.81
320 0.8
321 0.81
322 0.83
323 0.84