Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0V560

Protein Details
Accession Q0V560    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-87PPNPTPSKSKSKPKQPHTQQLRQKLPKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-72KSK
142-157RGKQSQRKKHSGLKSR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito_nucl 13.333, mito 10.5, cyto_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036882  Alba-like_dom_sf  
IPR014612  Pop7/Rpp20  
IPR020241  RNase_P/MRP_Pop7_fungi  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0034965  P:intronic box C/D RNA processing  
GO:0000294  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, RNase MRP-dependent  
GO:0090502  P:RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic  
GO:0006364  P:rRNA processing  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG pno:SNOG_00854  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12328  Rpp20  
Amino Acid Sequences MAGKKRTRTGEVKPSNATQQPQTTTETTPPCAQPQSAANKSTATTHSDQNTTLEGKRATGPPNPTPSKSKSKPKQPHTQQLRQKLPKLPPNTTISRRPLLRPSLPTPFSSSASPKVLYITSSTPFVPALKRIRKLLAEIQQRGKQSQRKKHSGLKSREVEKGIVDELARKKGGAEGEKVYVKATGRAIPKALGLGVEFQGEEGCVVRVEMGSVRAVDDVGVVGKEGDDGDEEDIPETRIRNVSSVTVSIGLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.63
3 0.61
4 0.55
5 0.49
6 0.48
7 0.46
8 0.44
9 0.45
10 0.4
11 0.38
12 0.41
13 0.39
14 0.36
15 0.37
16 0.37
17 0.36
18 0.36
19 0.33
20 0.3
21 0.33
22 0.39
23 0.39
24 0.38
25 0.35
26 0.34
27 0.34
28 0.35
29 0.3
30 0.26
31 0.24
32 0.28
33 0.3
34 0.3
35 0.31
36 0.28
37 0.29
38 0.26
39 0.24
40 0.24
41 0.2
42 0.2
43 0.23
44 0.26
45 0.26
46 0.29
47 0.34
48 0.35
49 0.44
50 0.46
51 0.46
52 0.48
53 0.51
54 0.56
55 0.57
56 0.62
57 0.62
58 0.7
59 0.76
60 0.79
61 0.84
62 0.83
63 0.86
64 0.84
65 0.85
66 0.82
67 0.83
68 0.85
69 0.8
70 0.76
71 0.73
72 0.71
73 0.68
74 0.66
75 0.59
76 0.55
77 0.54
78 0.55
79 0.52
80 0.52
81 0.49
82 0.48
83 0.46
84 0.44
85 0.44
86 0.44
87 0.44
88 0.42
89 0.41
90 0.44
91 0.43
92 0.41
93 0.4
94 0.36
95 0.33
96 0.3
97 0.28
98 0.24
99 0.24
100 0.24
101 0.18
102 0.17
103 0.16
104 0.15
105 0.14
106 0.13
107 0.11
108 0.12
109 0.12
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.1
114 0.14
115 0.22
116 0.26
117 0.28
118 0.3
119 0.32
120 0.32
121 0.35
122 0.36
123 0.36
124 0.38
125 0.39
126 0.43
127 0.44
128 0.44
129 0.43
130 0.42
131 0.41
132 0.42
133 0.49
134 0.53
135 0.57
136 0.62
137 0.69
138 0.72
139 0.75
140 0.73
141 0.73
142 0.7
143 0.67
144 0.65
145 0.58
146 0.49
147 0.39
148 0.33
149 0.24
150 0.19
151 0.14
152 0.16
153 0.17
154 0.2
155 0.19
156 0.18
157 0.17
158 0.19
159 0.24
160 0.21
161 0.22
162 0.21
163 0.25
164 0.26
165 0.26
166 0.24
167 0.21
168 0.19
169 0.19
170 0.19
171 0.2
172 0.22
173 0.24
174 0.24
175 0.23
176 0.22
177 0.2
178 0.18
179 0.12
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.08
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.12
220 0.13
221 0.14
222 0.14
223 0.14
224 0.15
225 0.18
226 0.19
227 0.21
228 0.22
229 0.24
230 0.26
231 0.26
232 0.24