FuNGI

F0U7C4

Protein Details

Accession

F0U7C4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
10-30	SESSSPPYPKRPRPTDSNDDE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MPDKRKDPSSESSSPPYPKRPRPTDSNDDEESYPPTPKTPTTARLQPKNDPVYGQKHAFPGLDDLGDEEQLCYGPPEDGIEYLRMVRFGISEVMLMAMSPPIRSHEPLPADIRPPTTRATRLAFTRMESMSHTPPKTPQAEASHTSAPDAQEIYYNLLHHRFLLLRSTLKCTPPASVIASLDAERPISLPRSNKYARAEWEKIIQTMDPRMAQLACMDMESVLGSAMCTLYLDGAWAWGLLGRCRTVGEMGSEEVGDIRELGKRAARILVKIRESEVVEAQGLEGEFDMEGGEGGEEEVEENQEKQEEQGVGTGENINRNGNGDDGQVDELDITNDAASADGILGHEEANGDIITSSNGVDTQDELEAAKARLQARLQVQHTSDKLKPGESGIEREENNDEEGGEGKVDDDYKSRNAQQYTRAMLDMIISVIGEFYGQRDLLEFRDIWEEDIGLAW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.63
3	0.65
4	0.66
5	0.7
6	0.75
7	0.76
8	0.76
9	0.79
10	0.82
11	0.82
12	0.79
13	0.76
14	0.68
15	0.63
16	0.57
17	0.49
18	0.44
19	0.36
20	0.32
21	0.25
22	0.24
23	0.24
24	0.24
25	0.29
26	0.31
27	0.35
28	0.4
29	0.49
30	0.56
31	0.63
32	0.67
33	0.68
34	0.71
35	0.71
36	0.64
37	0.59
38	0.55
39	0.53
40	0.54
41	0.49
42	0.43
43	0.39
44	0.4
45	0.37
46	0.32
47	0.28
48	0.24
49	0.21
50	0.17
51	0.17
52	0.16
53	0.16
54	0.15
55	0.1
56	0.09
57	0.09
58	0.09
59	0.08
60	0.07
61	0.07
62	0.07
63	0.09
64	0.1
65	0.11
66	0.12
67	0.13
68	0.13
69	0.15
70	0.15
71	0.13
72	0.12
73	0.12
74	0.1
75	0.11
76	0.12
77	0.1
78	0.09
79	0.09
80	0.09
81	0.08
82	0.08
83	0.07
84	0.07
85	0.06
86	0.07
87	0.07
88	0.11
89	0.14
90	0.16
91	0.18
92	0.23
93	0.26
94	0.3
95	0.34
96	0.32
97	0.33
98	0.33
99	0.35
100	0.29
101	0.29
102	0.28
103	0.29
104	0.29
105	0.31
106	0.33
107	0.32
108	0.33
109	0.37
110	0.34
111	0.31
112	0.33
113	0.29
114	0.26
115	0.25
116	0.26
117	0.28
118	0.34
119	0.33
120	0.29
121	0.32
122	0.38
123	0.38
124	0.35
125	0.34
126	0.33
127	0.38
128	0.39
129	0.4
130	0.37
131	0.34
132	0.33
133	0.29
134	0.23
135	0.19
136	0.17
137	0.12
138	0.12
139	0.13
140	0.15
141	0.14
142	0.14
143	0.14
144	0.16
145	0.15
146	0.13
147	0.14
148	0.12
149	0.12
150	0.15
151	0.16
152	0.19
153	0.21
154	0.27
155	0.28
156	0.29
157	0.31
158	0.27
159	0.27
160	0.24
161	0.25
162	0.21
163	0.19
164	0.18
165	0.16
166	0.16
167	0.15
168	0.14
169	0.12
170	0.09
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.1
175	0.13
176	0.15
177	0.17
178	0.25
179	0.26
180	0.31
181	0.33
182	0.36
183	0.38
184	0.43
185	0.44
186	0.37
187	0.42
188	0.38
189	0.34
190	0.3
191	0.25
192	0.18
193	0.17
194	0.18
195	0.12
196	0.11
197	0.11
198	0.11
199	0.1
200	0.09
201	0.08
202	0.07
203	0.06
204	0.06
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.04
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.05
226	0.05
227	0.06
228	0.07
229	0.08
230	0.08
231	0.08
232	0.09
233	0.08
234	0.08
235	0.09
236	0.09
237	0.09
238	0.09
239	0.08
240	0.08
241	0.07
242	0.07
243	0.05
244	0.04
245	0.05
246	0.06
247	0.07
248	0.08
249	0.1
250	0.1
251	0.11
252	0.16
253	0.16
254	0.18
255	0.25
256	0.3
257	0.3
258	0.3
259	0.3
260	0.28
261	0.28
262	0.27
263	0.2
264	0.15
265	0.13
266	0.12
267	0.11
268	0.09
269	0.08
270	0.06
271	0.05
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.02
284	0.03
285	0.03
286	0.04
287	0.05
288	0.05
289	0.06
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.11
294	0.11
295	0.11
296	0.13
297	0.13
298	0.13
299	0.14
300	0.16
301	0.13
302	0.15
303	0.16
304	0.14
305	0.14
306	0.16
307	0.15
308	0.13
309	0.13
310	0.1
311	0.1
312	0.1
313	0.11
314	0.09
315	0.09
316	0.08
317	0.07
318	0.07
319	0.06
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.06
337	0.06
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.05
345	0.06
346	0.06
347	0.07
348	0.07
349	0.09
350	0.08
351	0.09
352	0.09
353	0.09
354	0.12
355	0.12
356	0.14
357	0.17
358	0.17
359	0.22
360	0.22
361	0.27
362	0.32
363	0.4
364	0.39
365	0.4
366	0.42
367	0.44
368	0.46
369	0.46
370	0.41
371	0.4
372	0.39
373	0.35
374	0.34
375	0.29
376	0.35
377	0.32
378	0.34
379	0.31
380	0.35
381	0.34
382	0.35
383	0.36
384	0.29
385	0.28
386	0.23
387	0.19
388	0.14
389	0.15
390	0.13
391	0.1
392	0.09
393	0.07
394	0.09
395	0.1
396	0.1
397	0.12
398	0.15
399	0.2
400	0.26
401	0.31
402	0.36
403	0.4
404	0.44
405	0.49
406	0.53
407	0.54
408	0.51
409	0.46
410	0.39
411	0.34
412	0.31
413	0.23
414	0.15
415	0.1
416	0.07
417	0.07
418	0.06
419	0.06
420	0.05
421	0.04
422	0.05
423	0.09
424	0.09
425	0.09
426	0.11
427	0.13
428	0.15
429	0.2
430	0.18
431	0.17
432	0.24
433	0.25
434	0.25
435	0.24
436	0.22

F0U7C4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer