Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F0U4N6

Protein Details
Accession F0U4N6    Localization Confidence Low Confidence Score 7.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-72ASSWRQSGRNSRRPLNNRGRHNCTRSVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 12.5, nucl 9, extr 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037363  Sec13/Seh1_fam  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005643  C:nuclear pore  
GO:0005198  F:structural molecule activity  
GO:0051028  P:mRNA transport  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MKISDPQGDAMDIMPSIDIYGTLGHVNHMLLGSRPFIPKEEAFSAASSWRQSGRNSRRPLNNRGRHNCTRSVYTYVYSRLKFRPVQPFYVTSKMAQVITNSGHDDMIHDAALDYYGRRLATCSSDKTIKIFEVEGDSHRLLETLKGHEGAVWCIAWAHPKFGTILASSSYDGKVLIWREQAPSTASASTASTWTKVFDFSLHTASVNGISWAPHESGCLLACASSDGNVSVLEFSDNSWTHQLFHAHGMGVNSVSWAPSAAPGSIISTTPSPGQLRRFVTGGSDNLAKIWEYNAENKTYTVTKVLEGHTDWVRDVAWSPSILSKSYIASASQDKTVRIWTSDPSNPNEWTSQHLEFDCVLWRVSWSLSGNVLAISGGDNKVSLWKENLKGQWEKVKDIED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.07
3 0.07
4 0.06
5 0.06
6 0.05
7 0.06
8 0.07
9 0.08
10 0.09
11 0.09
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.1
17 0.11
18 0.13
19 0.14
20 0.17
21 0.19
22 0.19
23 0.21
24 0.26
25 0.26
26 0.31
27 0.31
28 0.31
29 0.3
30 0.29
31 0.28
32 0.25
33 0.27
34 0.21
35 0.2
36 0.22
37 0.23
38 0.27
39 0.37
40 0.46
41 0.52
42 0.59
43 0.65
44 0.71
45 0.75
46 0.81
47 0.81
48 0.79
49 0.81
50 0.82
51 0.83
52 0.82
53 0.8
54 0.78
55 0.71
56 0.68
57 0.61
58 0.58
59 0.51
60 0.44
61 0.42
62 0.41
63 0.43
64 0.38
65 0.4
66 0.37
67 0.42
68 0.45
69 0.49
70 0.53
71 0.5
72 0.55
73 0.54
74 0.56
75 0.54
76 0.54
77 0.47
78 0.37
79 0.36
80 0.32
81 0.29
82 0.25
83 0.21
84 0.18
85 0.19
86 0.2
87 0.18
88 0.17
89 0.15
90 0.14
91 0.14
92 0.13
93 0.12
94 0.1
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.08
100 0.06
101 0.06
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.11
107 0.17
108 0.21
109 0.23
110 0.26
111 0.3
112 0.3
113 0.31
114 0.31
115 0.26
116 0.23
117 0.2
118 0.16
119 0.16
120 0.17
121 0.17
122 0.19
123 0.18
124 0.17
125 0.17
126 0.16
127 0.12
128 0.14
129 0.15
130 0.14
131 0.15
132 0.16
133 0.16
134 0.17
135 0.18
136 0.15
137 0.14
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.09
142 0.13
143 0.13
144 0.14
145 0.13
146 0.14
147 0.15
148 0.15
149 0.17
150 0.11
151 0.11
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.11
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.1
161 0.11
162 0.13
163 0.14
164 0.15
165 0.17
166 0.17
167 0.18
168 0.16
169 0.16
170 0.15
171 0.12
172 0.11
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.11
186 0.12
187 0.14
188 0.13
189 0.13
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.09
194 0.08
195 0.06
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.1
223 0.1
224 0.12
225 0.14
226 0.14
227 0.15
228 0.18
229 0.19
230 0.15
231 0.17
232 0.16
233 0.14
234 0.15
235 0.15
236 0.12
237 0.11
238 0.09
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.13
258 0.13
259 0.16
260 0.2
261 0.26
262 0.28
263 0.29
264 0.29
265 0.26
266 0.27
267 0.27
268 0.24
269 0.2
270 0.18
271 0.16
272 0.16
273 0.16
274 0.13
275 0.1
276 0.1
277 0.12
278 0.12
279 0.19
280 0.21
281 0.23
282 0.24
283 0.24
284 0.26
285 0.22
286 0.22
287 0.19
288 0.18
289 0.17
290 0.21
291 0.22
292 0.22
293 0.22
294 0.25
295 0.24
296 0.24
297 0.22
298 0.18
299 0.17
300 0.14
301 0.15
302 0.13
303 0.12
304 0.11
305 0.12
306 0.16
307 0.17
308 0.17
309 0.18
310 0.17
311 0.16
312 0.18
313 0.18
314 0.14
315 0.17
316 0.21
317 0.21
318 0.25
319 0.26
320 0.24
321 0.25
322 0.3
323 0.28
324 0.26
325 0.26
326 0.24
327 0.29
328 0.35
329 0.38
330 0.38
331 0.41
332 0.4
333 0.41
334 0.4
335 0.34
336 0.33
337 0.34
338 0.31
339 0.31
340 0.3
341 0.29
342 0.27
343 0.27
344 0.26
345 0.21
346 0.19
347 0.15
348 0.16
349 0.15
350 0.15
351 0.19
352 0.17
353 0.18
354 0.19
355 0.19
356 0.18
357 0.17
358 0.16
359 0.11
360 0.09
361 0.09
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.17
368 0.18
369 0.19
370 0.22
371 0.3
372 0.34
373 0.42
374 0.47
375 0.48
376 0.51
377 0.55
378 0.58
379 0.54
380 0.55