Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0U8N5

Protein Details
Accession Q0U8N5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
254-273GQGAKAKRERQRKEKVHVELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-143GRGSGEPSGTGERGNYRGRGRGGRGGGRGGPRADGDRRS
258-269KAKRERQRKEKV
280-351APPPREGGSRGGRGRGDGTRGRGEGRGRGGGEFRGGEGRGRGGDRGEFRGGRGRGDGARGARGDARPRGGRG
Subcellular Location(s) mito 21, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG pno:SNOG_11879  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSAVVSKSRVCAAPPAAIAVREKLGCPPNTHHPAGNDPELDPDRPADPPTRAIEKPVMRHGKRDGTDAPKPAPERTGTQTRAKQTASANENAFRDRGVGADKNRGRGSGEPSGTGERGNYRGRGRGGRGGGRGGPRADGDRRSRTGIGEQEKQAAHGWGGNDGNAELEDEVAGDAIAKAEEKDAVADAAEGENQPEPEPEDRSKSYAAYLVEQAEKKLGLAAQNVRKPNEGSSKKFPEGKALSREEEEEAYMAGQGAKAKRERQRKEKVHVELDGDRMLAPPPREGGSRGGRGRGDGTRGRGEGRGRGGGEFRGGEGRGRGGDRGEFRGGRGRGDGARGARGDARPRGGRGGQSGPNIADSSAFPSLGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.3
4 0.31
5 0.31
6 0.26
7 0.27
8 0.22
9 0.23
10 0.25
11 0.32
12 0.33
13 0.36
14 0.39
15 0.46
16 0.52
17 0.54
18 0.5
19 0.46
20 0.5
21 0.51
22 0.5
23 0.41
24 0.34
25 0.39
26 0.38
27 0.36
28 0.3
29 0.26
30 0.22
31 0.22
32 0.25
33 0.22
34 0.22
35 0.26
36 0.31
37 0.35
38 0.34
39 0.37
40 0.43
41 0.43
42 0.46
43 0.51
44 0.56
45 0.5
46 0.56
47 0.58
48 0.59
49 0.55
50 0.55
51 0.52
52 0.5
53 0.55
54 0.54
55 0.5
56 0.46
57 0.47
58 0.43
59 0.39
60 0.34
61 0.32
62 0.34
63 0.41
64 0.4
65 0.47
66 0.51
67 0.52
68 0.55
69 0.51
70 0.49
71 0.43
72 0.47
73 0.43
74 0.42
75 0.39
76 0.38
77 0.39
78 0.36
79 0.32
80 0.23
81 0.2
82 0.15
83 0.14
84 0.15
85 0.18
86 0.2
87 0.3
88 0.31
89 0.36
90 0.36
91 0.36
92 0.33
93 0.32
94 0.36
95 0.34
96 0.33
97 0.28
98 0.3
99 0.32
100 0.29
101 0.26
102 0.2
103 0.14
104 0.18
105 0.2
106 0.22
107 0.22
108 0.27
109 0.3
110 0.34
111 0.35
112 0.36
113 0.38
114 0.38
115 0.38
116 0.35
117 0.35
118 0.33
119 0.32
120 0.26
121 0.23
122 0.19
123 0.22
124 0.23
125 0.26
126 0.29
127 0.32
128 0.34
129 0.36
130 0.36
131 0.33
132 0.35
133 0.36
134 0.35
135 0.34
136 0.33
137 0.34
138 0.33
139 0.32
140 0.29
141 0.22
142 0.17
143 0.13
144 0.13
145 0.11
146 0.11
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.07
152 0.07
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.08
184 0.09
185 0.13
186 0.14
187 0.18
188 0.19
189 0.21
190 0.21
191 0.2
192 0.19
193 0.19
194 0.18
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.17
199 0.17
200 0.16
201 0.14
202 0.13
203 0.11
204 0.11
205 0.1
206 0.09
207 0.12
208 0.19
209 0.25
210 0.3
211 0.33
212 0.33
213 0.33
214 0.32
215 0.34
216 0.38
217 0.37
218 0.39
219 0.45
220 0.5
221 0.52
222 0.56
223 0.51
224 0.5
225 0.49
226 0.49
227 0.47
228 0.44
229 0.43
230 0.39
231 0.4
232 0.32
233 0.28
234 0.22
235 0.15
236 0.11
237 0.09
238 0.08
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.09
243 0.1
244 0.15
245 0.18
246 0.26
247 0.34
248 0.44
249 0.52
250 0.59
251 0.69
252 0.74
253 0.79
254 0.81
255 0.8
256 0.74
257 0.68
258 0.63
259 0.54
260 0.48
261 0.4
262 0.31
263 0.24
264 0.19
265 0.17
266 0.16
267 0.15
268 0.13
269 0.15
270 0.16
271 0.18
272 0.19
273 0.25
274 0.28
275 0.36
276 0.36
277 0.39
278 0.37
279 0.37
280 0.39
281 0.35
282 0.34
283 0.3
284 0.33
285 0.34
286 0.35
287 0.35
288 0.35
289 0.35
290 0.34
291 0.34
292 0.34
293 0.3
294 0.31
295 0.3
296 0.27
297 0.28
298 0.22
299 0.19
300 0.18
301 0.18
302 0.18
303 0.17
304 0.18
305 0.18
306 0.19
307 0.19
308 0.18
309 0.23
310 0.25
311 0.29
312 0.32
313 0.3
314 0.31
315 0.39
316 0.38
317 0.34
318 0.33
319 0.31
320 0.27
321 0.31
322 0.34
323 0.27
324 0.32
325 0.3
326 0.3
327 0.32
328 0.34
329 0.38
330 0.38
331 0.44
332 0.43
333 0.45
334 0.49
335 0.47
336 0.47
337 0.45
338 0.47
339 0.45
340 0.44
341 0.45
342 0.39
343 0.38
344 0.35
345 0.29
346 0.23
347 0.18
348 0.2
349 0.19