Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QWD5

Protein Details
Accession C4QWD5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
346-377VLAKGGFKTRRGKNINKQKVRDRPRGKLSQRNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-132GKPVRALTKTRVSRSGRNHTGRIVVRHRGGGHQR
332-336GKSKS
347-376LAKGGFKTRRGKNINKQKVRDRPRGKLSQR
Subcellular Location(s) mito 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR022666  Rbsml_prot_L2_RNA-bd_dom  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR002171  Ribosomal_L2  
IPR005880  Ribosomal_L2_bac/org-type  
IPR022669  Ribosomal_L2_C  
IPR022671  Ribosomal_L2_CS  
IPR014726  Ribosomal_L2_dom3  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:0005762  C:mitochondrial large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0032543  P:mitochondrial translation  
KEGG ppa:PAS_chr1-1_0192  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00181  Ribosomal_L2  
PF03947  Ribosomal_L2_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00467  RIBOSOMAL_L2  
Amino Acid Sequences MFNLPLRSLPRASWGKKLLQTHLFGSVSFFSTGARTLATEPTPRITQAAGDLTDLEKQHEIIARQTKLSKETVQLKKLKPTSPGLRWWRKPMYPYLWKGKPVRALTKTRVSRSGRNHTGRIVVRHRGGGHQRRIRFIDYHRKEPGRQTVVRIEYDPNRTAHIALLKHNDTGNLSYIIACQGLREGDIVESFRSGIPEYLMEEMGGRIDPAILNAKTAQKGNCLPISMIAVGTIVHNVSETVHGPAKYCRAAGANARIVNKIPEKRKAVVRLQSGEERYVSIDACATLGVTSNPDHQHESLGKAGRSRHRGIRPTVRGVAQNKCDHPMGGGRGKSKSNKLSMSPWGVLAKGGFKTRRGKNINKQKVRDRPRGKLSQRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.53
3 0.57
4 0.62
5 0.6
6 0.57
7 0.57
8 0.5
9 0.52
10 0.45
11 0.38
12 0.36
13 0.3
14 0.25
15 0.22
16 0.2
17 0.13
18 0.14
19 0.15
20 0.13
21 0.11
22 0.1
23 0.12
24 0.17
25 0.2
26 0.23
27 0.23
28 0.27
29 0.28
30 0.27
31 0.27
32 0.22
33 0.2
34 0.2
35 0.23
36 0.18
37 0.17
38 0.18
39 0.17
40 0.21
41 0.2
42 0.18
43 0.14
44 0.14
45 0.17
46 0.2
47 0.2
48 0.24
49 0.33
50 0.32
51 0.34
52 0.37
53 0.37
54 0.37
55 0.4
56 0.35
57 0.34
58 0.43
59 0.48
60 0.53
61 0.59
62 0.59
63 0.64
64 0.67
65 0.64
66 0.58
67 0.59
68 0.6
69 0.57
70 0.63
71 0.64
72 0.68
73 0.69
74 0.72
75 0.71
76 0.65
77 0.64
78 0.62
79 0.61
80 0.6
81 0.62
82 0.63
83 0.6
84 0.64
85 0.63
86 0.6
87 0.59
88 0.56
89 0.58
90 0.56
91 0.58
92 0.58
93 0.64
94 0.65
95 0.6
96 0.63
97 0.59
98 0.6
99 0.62
100 0.66
101 0.66
102 0.65
103 0.63
104 0.56
105 0.59
106 0.54
107 0.52
108 0.47
109 0.43
110 0.39
111 0.4
112 0.39
113 0.39
114 0.45
115 0.47
116 0.51
117 0.53
118 0.53
119 0.55
120 0.57
121 0.53
122 0.48
123 0.46
124 0.47
125 0.45
126 0.5
127 0.52
128 0.52
129 0.51
130 0.53
131 0.55
132 0.51
133 0.48
134 0.45
135 0.45
136 0.46
137 0.45
138 0.4
139 0.34
140 0.31
141 0.35
142 0.33
143 0.26
144 0.25
145 0.24
146 0.23
147 0.21
148 0.21
149 0.18
150 0.18
151 0.23
152 0.22
153 0.23
154 0.22
155 0.21
156 0.17
157 0.17
158 0.16
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.03
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.1
198 0.09
199 0.1
200 0.12
201 0.15
202 0.16
203 0.19
204 0.18
205 0.17
206 0.2
207 0.22
208 0.22
209 0.2
210 0.19
211 0.17
212 0.19
213 0.15
214 0.12
215 0.09
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.06
226 0.07
227 0.09
228 0.12
229 0.13
230 0.14
231 0.16
232 0.19
233 0.19
234 0.18
235 0.17
236 0.16
237 0.18
238 0.22
239 0.27
240 0.29
241 0.31
242 0.32
243 0.31
244 0.3
245 0.32
246 0.34
247 0.35
248 0.35
249 0.4
250 0.43
251 0.47
252 0.53
253 0.57
254 0.58
255 0.58
256 0.59
257 0.54
258 0.53
259 0.55
260 0.5
261 0.44
262 0.36
263 0.29
264 0.24
265 0.21
266 0.17
267 0.11
268 0.1
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.14
279 0.16
280 0.18
281 0.21
282 0.21
283 0.26
284 0.26
285 0.27
286 0.28
287 0.31
288 0.3
289 0.3
290 0.37
291 0.4
292 0.45
293 0.47
294 0.5
295 0.55
296 0.61
297 0.66
298 0.7
299 0.69
300 0.69
301 0.69
302 0.62
303 0.6
304 0.58
305 0.58
306 0.55
307 0.55
308 0.5
309 0.48
310 0.46
311 0.39
312 0.37
313 0.35
314 0.34
315 0.34
316 0.36
317 0.36
318 0.39
319 0.45
320 0.5
321 0.52
322 0.53
323 0.53
324 0.54
325 0.54
326 0.56
327 0.58
328 0.58
329 0.5
330 0.46
331 0.4
332 0.35
333 0.32
334 0.27
335 0.24
336 0.21
337 0.28
338 0.27
339 0.33
340 0.42
341 0.49
342 0.58
343 0.62
344 0.69
345 0.72
346 0.81
347 0.86
348 0.86
349 0.87
350 0.87
351 0.89
352 0.89
353 0.89
354 0.87
355 0.86
356 0.86
357 0.88