Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R8A1

Protein Details
Accession C4R8A1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-130ATERLKKTTQRLNRKKQESRIVQHydrophilic
233-263QSSKRTTPLQSKTPSKRHHSSRSPKNNVFIYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 16.5, mito_nucl 13.5, nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG ppa:PAS_chr4_0565  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MKEKLRGARSLYELASAKCIRSIKLIKDVGEVPVHVVEPILAKMGAHQLEAIEKMCPHLALSTDKIWQNLIEKDFSNRPLNDGRLRRTKPKDLYMKYRQEMEDLRKDATERLKKTTQRLNRKKQESRIVQIDQLIDPSARRKRPEQFQAHKTPIMQKARQEALLKSKMFKEGIRFNQAPKTEKMRVPGGFKMALQKGEKYEPITRGVKGTVSIAVKDGKSLKGNAKSSEEITQSSKRTTPLQSKTPSKRHHSSRSPKNNVFIYNS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.38
3 0.33
4 0.28
5 0.29
6 0.3
7 0.25
8 0.32
9 0.38
10 0.36
11 0.45
12 0.48
13 0.44
14 0.46
15 0.46
16 0.41
17 0.35
18 0.3
19 0.22
20 0.2
21 0.19
22 0.14
23 0.13
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.08
29 0.08
30 0.09
31 0.16
32 0.15
33 0.14
34 0.14
35 0.13
36 0.15
37 0.16
38 0.15
39 0.11
40 0.1
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.1
45 0.1
46 0.12
47 0.15
48 0.18
49 0.19
50 0.23
51 0.24
52 0.24
53 0.23
54 0.22
55 0.22
56 0.24
57 0.23
58 0.21
59 0.2
60 0.24
61 0.27
62 0.3
63 0.33
64 0.28
65 0.3
66 0.32
67 0.37
68 0.4
69 0.42
70 0.44
71 0.48
72 0.52
73 0.58
74 0.6
75 0.65
76 0.63
77 0.66
78 0.7
79 0.66
80 0.72
81 0.72
82 0.73
83 0.65
84 0.64
85 0.55
86 0.48
87 0.47
88 0.44
89 0.42
90 0.35
91 0.34
92 0.3
93 0.3
94 0.31
95 0.35
96 0.36
97 0.3
98 0.35
99 0.41
100 0.44
101 0.5
102 0.55
103 0.55
104 0.59
105 0.67
106 0.72
107 0.75
108 0.81
109 0.81
110 0.8
111 0.8
112 0.74
113 0.69
114 0.64
115 0.56
116 0.48
117 0.43
118 0.36
119 0.26
120 0.21
121 0.16
122 0.1
123 0.09
124 0.14
125 0.19
126 0.21
127 0.23
128 0.28
129 0.35
130 0.43
131 0.53
132 0.57
133 0.59
134 0.64
135 0.7
136 0.68
137 0.62
138 0.55
139 0.51
140 0.49
141 0.48
142 0.42
143 0.37
144 0.4
145 0.4
146 0.43
147 0.38
148 0.33
149 0.34
150 0.38
151 0.36
152 0.31
153 0.31
154 0.31
155 0.3
156 0.29
157 0.28
158 0.3
159 0.35
160 0.41
161 0.4
162 0.39
163 0.44
164 0.46
165 0.43
166 0.38
167 0.4
168 0.39
169 0.4
170 0.42
171 0.43
172 0.42
173 0.43
174 0.42
175 0.38
176 0.32
177 0.31
178 0.34
179 0.3
180 0.31
181 0.28
182 0.28
183 0.28
184 0.3
185 0.32
186 0.29
187 0.32
188 0.3
189 0.34
190 0.35
191 0.32
192 0.3
193 0.29
194 0.26
195 0.21
196 0.2
197 0.19
198 0.17
199 0.17
200 0.17
201 0.2
202 0.18
203 0.21
204 0.22
205 0.21
206 0.23
207 0.26
208 0.33
209 0.38
210 0.42
211 0.43
212 0.45
213 0.44
214 0.44
215 0.45
216 0.39
217 0.33
218 0.35
219 0.37
220 0.34
221 0.35
222 0.35
223 0.32
224 0.36
225 0.41
226 0.46
227 0.47
228 0.54
229 0.59
230 0.67
231 0.75
232 0.79
233 0.8
234 0.79
235 0.81
236 0.82
237 0.84
238 0.84
239 0.85
240 0.86
241 0.89
242 0.91
243 0.86
244 0.84
245 0.79