Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0UBB4

Protein Details
Accession Q0UBB4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-44DSSRPAKKCWWSYRMYKNADHydrophilic
423-447VEPTSTPVRSPRRKQKQDDDSSDSSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002562  3'-5'_exonuclease_dom  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR002121  HRDC_dom  
IPR044876  HRDC_dom_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008408  F:3'-5' exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0006139  P:nucleobase-containing compound metabolic process  
KEGG pno:SNOG_10950  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01612  DNA_pol_A_exo1  
PF00570  HRDC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50967  HRDC  
CDD cd06141  WRN_exo  
Amino Acid Sequences MAARIQAAGPLRRKPNRHYRLLGFDSSRPAKKCWWSYRMYKNADNKLPEILYSKTKEDSEKIVKQFLNEPVVGFDMEWPWNDWKKETLQNKIGLIQIASESKIGLIHIGLHPGKTVQDIIAPSLKKLIEDPSIGKLGVGILHADFARLRRFFKLSPRGAVELSHLYRLVKFGGNKPEHVSTKMVSLARIVEDQLGHPLYKGDVRTSNWSKPLSTDQINYAAGDAYAGYMLYHCMNYKRLQMKPTPPLPVHAETYQTYKMSGINALRLDGKAKDGTVMTSETFFGVAMSDSVASKKGGTVEEKKSPATSKSKALVIPKELTDAASQALYQELVICRAELAEKAGLPAYRISSNTVLVALALQRPADKDQLLSVKGVGAKTQETYGQAWLDVIAKYLDSDPLPVAAVATDSAIAADPESEQHVAVEPTSTPVRSPRRKQKQDDDSSDSSAAFGSPVQRTPQLHTGLSFTMAETNLNAEEADTEQYESDASLPSLDFGDTPSLLPPQLKRKRTESPMREASQRLQQMTRPREDISIAPPEAISTPKKGTTAPQVPLTPQSRITRNKLQAFSKLVTRKMAQRPVDAPPIISERTLSLIVVRAPQTMKELERIPGIDALILACQQTGTDLLKNVVKFAGASN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.72
3 0.74
4 0.78
5 0.78
6 0.75
7 0.77
8 0.77
9 0.74
10 0.67
11 0.61
12 0.6
13 0.59
14 0.59
15 0.52
16 0.49
17 0.5
18 0.56
19 0.63
20 0.63
21 0.63
22 0.64
23 0.71
24 0.78
25 0.8
26 0.78
27 0.75
28 0.75
29 0.78
30 0.78
31 0.72
32 0.63
33 0.58
34 0.52
35 0.45
36 0.39
37 0.33
38 0.33
39 0.32
40 0.34
41 0.32
42 0.34
43 0.36
44 0.36
45 0.42
46 0.44
47 0.48
48 0.49
49 0.53
50 0.51
51 0.49
52 0.53
53 0.5
54 0.46
55 0.38
56 0.35
57 0.29
58 0.29
59 0.27
60 0.2
61 0.16
62 0.14
63 0.14
64 0.15
65 0.17
66 0.21
67 0.27
68 0.29
69 0.29
70 0.3
71 0.35
72 0.43
73 0.47
74 0.5
75 0.51
76 0.54
77 0.54
78 0.53
79 0.49
80 0.41
81 0.34
82 0.25
83 0.21
84 0.17
85 0.17
86 0.14
87 0.11
88 0.1
89 0.11
90 0.1
91 0.08
92 0.07
93 0.09
94 0.1
95 0.17
96 0.17
97 0.16
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.15
102 0.16
103 0.09
104 0.13
105 0.13
106 0.16
107 0.21
108 0.21
109 0.2
110 0.23
111 0.23
112 0.19
113 0.2
114 0.22
115 0.2
116 0.23
117 0.25
118 0.24
119 0.26
120 0.25
121 0.23
122 0.19
123 0.15
124 0.13
125 0.12
126 0.08
127 0.07
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.11
133 0.17
134 0.18
135 0.2
136 0.23
137 0.27
138 0.3
139 0.39
140 0.47
141 0.45
142 0.49
143 0.51
144 0.49
145 0.45
146 0.43
147 0.36
148 0.33
149 0.3
150 0.26
151 0.22
152 0.2
153 0.2
154 0.21
155 0.2
156 0.16
157 0.18
158 0.23
159 0.33
160 0.34
161 0.36
162 0.38
163 0.43
164 0.4
165 0.4
166 0.36
167 0.26
168 0.27
169 0.3
170 0.26
171 0.2
172 0.19
173 0.18
174 0.17
175 0.17
176 0.15
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.14
181 0.14
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.11
186 0.14
187 0.14
188 0.14
189 0.17
190 0.2
191 0.29
192 0.34
193 0.37
194 0.39
195 0.4
196 0.37
197 0.35
198 0.39
199 0.35
200 0.32
201 0.29
202 0.26
203 0.29
204 0.29
205 0.26
206 0.2
207 0.15
208 0.12
209 0.1
210 0.08
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.09
221 0.11
222 0.14
223 0.22
224 0.27
225 0.3
226 0.34
227 0.4
228 0.46
229 0.51
230 0.54
231 0.52
232 0.46
233 0.46
234 0.47
235 0.42
236 0.38
237 0.3
238 0.29
239 0.23
240 0.27
241 0.26
242 0.2
243 0.18
244 0.15
245 0.15
246 0.13
247 0.16
248 0.13
249 0.14
250 0.15
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.12
256 0.14
257 0.11
258 0.1
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.06
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.08
283 0.1
284 0.14
285 0.2
286 0.24
287 0.3
288 0.31
289 0.31
290 0.3
291 0.3
292 0.31
293 0.31
294 0.29
295 0.28
296 0.29
297 0.31
298 0.32
299 0.35
300 0.33
301 0.3
302 0.29
303 0.24
304 0.24
305 0.21
306 0.19
307 0.15
308 0.12
309 0.09
310 0.07
311 0.07
312 0.05
313 0.05
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.05
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.09
330 0.08
331 0.09
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.13
337 0.13
338 0.13
339 0.13
340 0.12
341 0.1
342 0.08
343 0.08
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.08
350 0.1
351 0.11
352 0.11
353 0.1
354 0.13
355 0.17
356 0.17
357 0.16
358 0.14
359 0.14
360 0.15
361 0.15
362 0.13
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.12
367 0.11
368 0.11
369 0.12
370 0.13
371 0.12
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.11
376 0.09
377 0.08
378 0.07
379 0.06
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.07
384 0.08
385 0.07
386 0.08
387 0.08
388 0.07
389 0.07
390 0.05
391 0.05
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.06
404 0.07
405 0.06
406 0.07
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.07
412 0.09
413 0.11
414 0.11
415 0.1
416 0.18
417 0.28
418 0.36
419 0.46
420 0.55
421 0.65
422 0.75
423 0.82
424 0.85
425 0.86
426 0.86
427 0.84
428 0.81
429 0.72
430 0.66
431 0.58
432 0.47
433 0.36
434 0.26
435 0.18
436 0.11
437 0.09
438 0.1
439 0.11
440 0.13
441 0.15
442 0.19
443 0.21
444 0.25
445 0.32
446 0.31
447 0.3
448 0.29
449 0.29
450 0.26
451 0.26
452 0.21
453 0.14
454 0.13
455 0.12
456 0.12
457 0.09
458 0.1
459 0.09
460 0.09
461 0.08
462 0.06
463 0.07
464 0.08
465 0.09
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.08
472 0.07
473 0.07
474 0.06
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.08
479 0.08
480 0.07
481 0.07
482 0.1
483 0.09
484 0.1
485 0.11
486 0.11
487 0.12
488 0.15
489 0.18
490 0.27
491 0.36
492 0.41
493 0.45
494 0.51
495 0.59
496 0.67
497 0.73
498 0.69
499 0.7
500 0.73
501 0.71
502 0.69
503 0.62
504 0.57
505 0.54
506 0.52
507 0.45
508 0.38
509 0.4
510 0.45
511 0.49
512 0.5
513 0.45
514 0.42
515 0.4
516 0.4
517 0.38
518 0.33
519 0.33
520 0.28
521 0.26
522 0.24
523 0.23
524 0.22
525 0.23
526 0.2
527 0.17
528 0.2
529 0.22
530 0.24
531 0.24
532 0.28
533 0.35
534 0.4
535 0.4
536 0.43
537 0.42
538 0.43
539 0.5
540 0.49
541 0.41
542 0.39
543 0.41
544 0.44
545 0.49
546 0.55
547 0.57
548 0.63
549 0.69
550 0.69
551 0.67
552 0.66
553 0.64
554 0.59
555 0.58
556 0.55
557 0.49
558 0.48
559 0.47
560 0.49
561 0.53
562 0.6
563 0.55
564 0.55
565 0.56
566 0.57
567 0.62
568 0.53
569 0.44
570 0.39
571 0.4
572 0.34
573 0.31
574 0.25
575 0.18
576 0.21
577 0.21
578 0.17
579 0.13
580 0.15
581 0.17
582 0.21
583 0.21
584 0.22
585 0.22
586 0.23
587 0.26
588 0.27
589 0.28
590 0.28
591 0.29
592 0.28
593 0.31
594 0.31
595 0.29
596 0.27
597 0.25
598 0.2
599 0.18
600 0.16
601 0.13
602 0.12
603 0.1
604 0.08
605 0.07
606 0.07
607 0.08
608 0.1
609 0.12
610 0.15
611 0.16
612 0.2
613 0.24
614 0.24
615 0.25
616 0.22
617 0.2