Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R6J1

Protein Details
Accession C4R6J1    Localization Confidence Low Confidence Score 8.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
345-366IDKIVLKHKQNKKQRIGQKILAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 9, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR036986  S4_RNA-bd_sf  
IPR002307  Tyr-tRNA-ligase  
IPR024088  Tyr-tRNA-ligase_bac-type  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0070184  P:mitochondrial tyrosyl-tRNA aminoacylation  
KEGG ppa:PAS_chr3_1110  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
CDD cd00805  TyrRS_core  
Amino Acid Sequences MMKVKILQVGTLSCQLFKRRNSTLQILTKYGIDVTTEDCRRDLDDPILNHLKKRGLLSQCTHEPELSQLCSKRRLSLYCGADPSARSLHIGNLLPLMVLLHFNLRGHNIFPLVGGATGKVGDPSGRETERTEIQHEERESNVENIRKQMKSFFRRGVTFAHRRNQLFKDVEPGTQMLKNNIEWWENIRILDFLSTYGKFIKVNQMLARESIKKRLNSGMGIGFNEFTYQILQAFDFFVLYKNHNVQIQVGGNDQYGNIVAGIDFISRLHRNKADNAVHAPGAFGITVPLLTTSTGEKFGKSAGNAVFIDKYMTPSYQLYQYMINLSDGDVERFLNKFSLLPLSVIDKIVLKHKQNKKQRIGQKILAVELCDLIHGQGEGISNLIISETLFGGFLNFNTLEILEAFRKQGLLKTYKACMIENLSILNVLEDIYRQQKSRTELKKLIKGGSVSLGVKNTRIFDSDLRIKPDDALDGKLILIRVGKKDYHVIEVTSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.35
3 0.4
4 0.43
5 0.48
6 0.49
7 0.56
8 0.6
9 0.64
10 0.66
11 0.68
12 0.66
13 0.61
14 0.54
15 0.47
16 0.41
17 0.34
18 0.25
19 0.17
20 0.14
21 0.15
22 0.23
23 0.25
24 0.25
25 0.25
26 0.25
27 0.27
28 0.28
29 0.28
30 0.25
31 0.29
32 0.29
33 0.37
34 0.46
35 0.44
36 0.44
37 0.45
38 0.42
39 0.39
40 0.42
41 0.42
42 0.4
43 0.47
44 0.5
45 0.54
46 0.56
47 0.58
48 0.56
49 0.47
50 0.4
51 0.38
52 0.38
53 0.32
54 0.32
55 0.31
56 0.34
57 0.42
58 0.42
59 0.44
60 0.45
61 0.46
62 0.47
63 0.51
64 0.53
65 0.51
66 0.52
67 0.46
68 0.42
69 0.39
70 0.36
71 0.29
72 0.23
73 0.19
74 0.18
75 0.19
76 0.22
77 0.23
78 0.19
79 0.18
80 0.17
81 0.16
82 0.15
83 0.13
84 0.07
85 0.07
86 0.06
87 0.07
88 0.09
89 0.09
90 0.11
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.16
95 0.14
96 0.13
97 0.13
98 0.13
99 0.1
100 0.1
101 0.09
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.11
111 0.16
112 0.17
113 0.18
114 0.2
115 0.24
116 0.29
117 0.3
118 0.29
119 0.28
120 0.3
121 0.35
122 0.35
123 0.32
124 0.27
125 0.28
126 0.27
127 0.26
128 0.28
129 0.25
130 0.25
131 0.29
132 0.34
133 0.32
134 0.31
135 0.36
136 0.42
137 0.45
138 0.51
139 0.52
140 0.5
141 0.51
142 0.52
143 0.51
144 0.5
145 0.52
146 0.52
147 0.52
148 0.54
149 0.54
150 0.58
151 0.54
152 0.53
153 0.46
154 0.4
155 0.4
156 0.35
157 0.34
158 0.29
159 0.27
160 0.21
161 0.22
162 0.22
163 0.17
164 0.18
165 0.17
166 0.19
167 0.2
168 0.19
169 0.16
170 0.19
171 0.21
172 0.2
173 0.2
174 0.17
175 0.15
176 0.14
177 0.15
178 0.11
179 0.07
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.12
187 0.2
188 0.2
189 0.23
190 0.25
191 0.27
192 0.27
193 0.28
194 0.3
195 0.28
196 0.27
197 0.32
198 0.35
199 0.32
200 0.34
201 0.37
202 0.36
203 0.3
204 0.31
205 0.27
206 0.22
207 0.22
208 0.2
209 0.15
210 0.13
211 0.12
212 0.1
213 0.06
214 0.06
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.07
225 0.09
226 0.1
227 0.12
228 0.13
229 0.15
230 0.16
231 0.16
232 0.14
233 0.16
234 0.16
235 0.15
236 0.14
237 0.13
238 0.12
239 0.11
240 0.1
241 0.07
242 0.06
243 0.05
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.07
253 0.1
254 0.11
255 0.15
256 0.18
257 0.2
258 0.24
259 0.32
260 0.32
261 0.32
262 0.33
263 0.32
264 0.28
265 0.26
266 0.22
267 0.14
268 0.11
269 0.08
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.06
280 0.07
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.13
286 0.15
287 0.13
288 0.17
289 0.14
290 0.18
291 0.18
292 0.19
293 0.17
294 0.15
295 0.17
296 0.12
297 0.14
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.13
302 0.15
303 0.16
304 0.17
305 0.15
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.15
310 0.14
311 0.1
312 0.1
313 0.12
314 0.12
315 0.12
316 0.1
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.09
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.12
329 0.15
330 0.15
331 0.15
332 0.15
333 0.12
334 0.13
335 0.19
336 0.25
337 0.27
338 0.36
339 0.46
340 0.55
341 0.64
342 0.74
343 0.76
344 0.79
345 0.82
346 0.82
347 0.8
348 0.76
349 0.71
350 0.62
351 0.56
352 0.47
353 0.39
354 0.29
355 0.23
356 0.17
357 0.11
358 0.1
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.05
363 0.06
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.04
372 0.04
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.13
389 0.1
390 0.11
391 0.12
392 0.12
393 0.13
394 0.13
395 0.17
396 0.22
397 0.25
398 0.29
399 0.32
400 0.35
401 0.38
402 0.4
403 0.36
404 0.32
405 0.33
406 0.31
407 0.27
408 0.25
409 0.21
410 0.2
411 0.19
412 0.16
413 0.1
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.09
418 0.15
419 0.18
420 0.19
421 0.22
422 0.27
423 0.33
424 0.43
425 0.48
426 0.52
427 0.58
428 0.66
429 0.71
430 0.7
431 0.69
432 0.63
433 0.56
434 0.48
435 0.43
436 0.39
437 0.32
438 0.3
439 0.3
440 0.27
441 0.28
442 0.28
443 0.27
444 0.24
445 0.25
446 0.25
447 0.24
448 0.32
449 0.4
450 0.43
451 0.46
452 0.47
453 0.45
454 0.44
455 0.42
456 0.4
457 0.32
458 0.31
459 0.26
460 0.24
461 0.24
462 0.23
463 0.22
464 0.16
465 0.19
466 0.2
467 0.23
468 0.28
469 0.29
470 0.3
471 0.38
472 0.39
473 0.41
474 0.38