Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F8PGA3

Protein Details
Accession F8PGA3    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-36SSQNLTKKQKKAVAFRDRKHGKPKTKGQIENAGDHydrophilic
71-94VGVFGKSKEKERPRPRSKEDPDSMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-28KKQKKAVAFRDRKHGKPKTK
76-91KSKEKERPRPRSKEDP
96-105VEPKPKKRKR
271-274RRKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MASSQNLTKKQKKAVAFRDRKHGKPKTKGQIENAGDDEDYVHDVPVQEDQDLADVQGDILGDEDESAPVEVGVFGKSKEKERPRPRSKEDPDSMVVEPKPKKRKREAVVETKVQSAKCKGSGGEENPKTKEIQGNSGHGLGVVEKSDGEEQKDAKNQGKQRFILFLGNLKYTTTMEAIQGHFAACDPPPTIRLLTPKLSYNKPFSSMISKSKGCAFLEFGHHNALQQGLKLHHSQLDGRQINVELTVGGGGRSATRLTKVKERNKELEMQRRKRLGRQIVSNDGRAAARPDGPKRYSTTSGIDQAATKKRTWTVEDSMETAQHRDGKRDTECKRPRVKDWATGVNAIPVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.79
3 0.81
4 0.79
5 0.81
6 0.81
7 0.8
8 0.8
9 0.79
10 0.78
11 0.78
12 0.84
13 0.84
14 0.87
15 0.86
16 0.82
17 0.82
18 0.75
19 0.69
20 0.6
21 0.5
22 0.4
23 0.33
24 0.27
25 0.17
26 0.17
27 0.13
28 0.11
29 0.11
30 0.11
31 0.12
32 0.15
33 0.15
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.13
38 0.13
39 0.12
40 0.08
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.05
46 0.06
47 0.06
48 0.05
49 0.05
50 0.06
51 0.05
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.05
56 0.06
57 0.05
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.14
63 0.16
64 0.21
65 0.31
66 0.4
67 0.5
68 0.6
69 0.71
70 0.75
71 0.84
72 0.86
73 0.88
74 0.85
75 0.85
76 0.78
77 0.72
78 0.64
79 0.58
80 0.51
81 0.45
82 0.38
83 0.35
84 0.37
85 0.4
86 0.48
87 0.51
88 0.59
89 0.64
90 0.73
91 0.72
92 0.78
93 0.78
94 0.78
95 0.79
96 0.76
97 0.67
98 0.62
99 0.58
100 0.47
101 0.41
102 0.34
103 0.3
104 0.26
105 0.26
106 0.22
107 0.24
108 0.3
109 0.32
110 0.38
111 0.4
112 0.42
113 0.42
114 0.42
115 0.38
116 0.34
117 0.33
118 0.25
119 0.28
120 0.28
121 0.29
122 0.29
123 0.29
124 0.27
125 0.22
126 0.2
127 0.12
128 0.09
129 0.07
130 0.05
131 0.05
132 0.06
133 0.09
134 0.09
135 0.11
136 0.12
137 0.13
138 0.17
139 0.21
140 0.23
141 0.24
142 0.3
143 0.35
144 0.4
145 0.45
146 0.42
147 0.39
148 0.4
149 0.37
150 0.33
151 0.27
152 0.24
153 0.2
154 0.19
155 0.18
156 0.16
157 0.15
158 0.12
159 0.13
160 0.1
161 0.08
162 0.08
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.05
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.16
180 0.18
181 0.21
182 0.22
183 0.26
184 0.29
185 0.32
186 0.34
187 0.36
188 0.33
189 0.34
190 0.33
191 0.29
192 0.31
193 0.31
194 0.33
195 0.33
196 0.32
197 0.29
198 0.32
199 0.35
200 0.28
201 0.26
202 0.24
203 0.21
204 0.26
205 0.27
206 0.24
207 0.23
208 0.23
209 0.21
210 0.19
211 0.18
212 0.12
213 0.12
214 0.14
215 0.12
216 0.14
217 0.15
218 0.16
219 0.17
220 0.18
221 0.19
222 0.21
223 0.3
224 0.29
225 0.28
226 0.28
227 0.25
228 0.24
229 0.22
230 0.18
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.12
243 0.17
244 0.2
245 0.3
246 0.39
247 0.48
248 0.57
249 0.64
250 0.65
251 0.63
252 0.69
253 0.68
254 0.69
255 0.71
256 0.69
257 0.7
258 0.72
259 0.72
260 0.7
261 0.72
262 0.71
263 0.68
264 0.69
265 0.68
266 0.7
267 0.71
268 0.65
269 0.55
270 0.47
271 0.39
272 0.31
273 0.27
274 0.19
275 0.22
276 0.26
277 0.32
278 0.39
279 0.4
280 0.43
281 0.44
282 0.48
283 0.47
284 0.44
285 0.44
286 0.41
287 0.44
288 0.42
289 0.38
290 0.34
291 0.37
292 0.42
293 0.39
294 0.34
295 0.33
296 0.37
297 0.41
298 0.44
299 0.44
300 0.42
301 0.47
302 0.48
303 0.47
304 0.43
305 0.42
306 0.37
307 0.32
308 0.29
309 0.28
310 0.27
311 0.3
312 0.32
313 0.37
314 0.44
315 0.52
316 0.52
317 0.57
318 0.65
319 0.69
320 0.76
321 0.75
322 0.74
323 0.75
324 0.77
325 0.75
326 0.74
327 0.73
328 0.66
329 0.63
330 0.57