Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F8PLM2

Protein Details
Accession F8PLM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
116-142ITTRRGARRSERLRKRLKKATPSPEKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-146RRGARRSERLRKRLKKATPSPEKVERSR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MLSREFYIWIGEQHVYTRDYIFRGQFPLPEITPIRNPSPVIKQETPPPPQLEFRNVQPRISRSARAIQQYGRCVYSGNDGFITPNRHSPAERSITGGICKTRSRKGDQTNTPSIPITTRRGARRSERLRKRLKKATPSPEKVERSRTALEKPENFSGDKKKYRAFRESLLLHFKDDTVYFKDDRKKISFVLSFMKDGEATAFRTDWLENRVDAQQLGLDITHTYGSWPYFAEKMEERFKDSFEKETAKNEILTLKQGNETAQAFFERFEEKKRWAGYTNRINEEFLISLLRRNMNKPLVDRVIYGGHC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.2
4 0.21
5 0.2
6 0.22
7 0.27
8 0.28
9 0.27
10 0.31
11 0.31
12 0.3
13 0.31
14 0.33
15 0.28
16 0.31
17 0.3
18 0.3
19 0.34
20 0.36
21 0.36
22 0.34
23 0.35
24 0.34
25 0.41
26 0.44
27 0.46
28 0.46
29 0.46
30 0.52
31 0.59
32 0.59
33 0.55
34 0.53
35 0.47
36 0.49
37 0.5
38 0.48
39 0.43
40 0.46
41 0.5
42 0.48
43 0.48
44 0.48
45 0.47
46 0.47
47 0.48
48 0.43
49 0.37
50 0.44
51 0.46
52 0.46
53 0.47
54 0.45
55 0.46
56 0.48
57 0.46
58 0.39
59 0.33
60 0.29
61 0.26
62 0.29
63 0.25
64 0.21
65 0.2
66 0.19
67 0.2
68 0.23
69 0.27
70 0.2
71 0.23
72 0.24
73 0.25
74 0.26
75 0.28
76 0.32
77 0.33
78 0.32
79 0.3
80 0.29
81 0.3
82 0.3
83 0.3
84 0.23
85 0.21
86 0.24
87 0.25
88 0.3
89 0.33
90 0.39
91 0.45
92 0.53
93 0.6
94 0.64
95 0.68
96 0.69
97 0.65
98 0.59
99 0.51
100 0.41
101 0.34
102 0.29
103 0.26
104 0.23
105 0.28
106 0.31
107 0.35
108 0.39
109 0.43
110 0.5
111 0.56
112 0.62
113 0.67
114 0.71
115 0.79
116 0.83
117 0.85
118 0.84
119 0.81
120 0.81
121 0.8
122 0.81
123 0.81
124 0.77
125 0.74
126 0.73
127 0.7
128 0.62
129 0.6
130 0.51
131 0.45
132 0.43
133 0.39
134 0.34
135 0.36
136 0.38
137 0.34
138 0.35
139 0.33
140 0.32
141 0.3
142 0.3
143 0.31
144 0.34
145 0.36
146 0.35
147 0.37
148 0.42
149 0.47
150 0.51
151 0.46
152 0.41
153 0.44
154 0.43
155 0.43
156 0.42
157 0.37
158 0.31
159 0.28
160 0.25
161 0.19
162 0.17
163 0.16
164 0.13
165 0.16
166 0.16
167 0.21
168 0.29
169 0.31
170 0.36
171 0.37
172 0.35
173 0.34
174 0.4
175 0.37
176 0.31
177 0.35
178 0.31
179 0.28
180 0.26
181 0.25
182 0.18
183 0.16
184 0.16
185 0.11
186 0.1
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.12
193 0.14
194 0.14
195 0.13
196 0.15
197 0.16
198 0.16
199 0.15
200 0.13
201 0.11
202 0.09
203 0.09
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.15
219 0.17
220 0.22
221 0.29
222 0.3
223 0.33
224 0.32
225 0.34
226 0.37
227 0.36
228 0.35
229 0.32
230 0.36
231 0.32
232 0.37
233 0.39
234 0.34
235 0.32
236 0.29
237 0.29
238 0.25
239 0.28
240 0.25
241 0.22
242 0.22
243 0.23
244 0.22
245 0.22
246 0.22
247 0.18
248 0.18
249 0.18
250 0.16
251 0.16
252 0.17
253 0.17
254 0.17
255 0.22
256 0.26
257 0.28
258 0.35
259 0.38
260 0.4
261 0.41
262 0.48
263 0.52
264 0.58
265 0.62
266 0.61
267 0.6
268 0.57
269 0.51
270 0.46
271 0.37
272 0.27
273 0.23
274 0.17
275 0.2
276 0.24
277 0.29
278 0.29
279 0.31
280 0.39
281 0.42
282 0.47
283 0.46
284 0.51
285 0.51
286 0.5
287 0.48
288 0.43