Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F8PNQ6

Protein Details
Accession F8PNQ6    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-134IAKPADQKDKEKKERKAKRRPGRRGSKAVPGEBasic
154-182ADEAAKPKKKKKKTNRKSKRKTLPGAEEEBasic
202-226AFAAPRKPRVKKPRAPRPPRPAGEDBasic
262-282VSARIVRRRWGQPRRSKGYGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-129QKDKEKKERKAKRRPGRRGSK
158-174AKPKKKKKKTNRKSKRK
206-222PRKPRVKKPRAPRPPRP
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.833, cyto 13, nucl 12.5, mito_nucl 7.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDAPAAPVTENGVPPATQDNVIEEAPGFKVFAGNLAYSTTDEGLKAFFAPVQDDIISAQVILRGTRSAGYGFVALNSAEAAQTAVDQLNAQELDGRKVIIEIAKPADQKDKEKKERKAKRRPGRRGSKAVPGEVSEAEANGDVKAEDTPAPGADEAAKPKKKKKKTNRKSKRKTLPGAEEEAQQEEAAADWTADSAPAEGAFAAPRKPRVKKPRAPRPPRPAGEDPVGEPSKTMLFVANLGFNVDDAGLASLFTEAGINVVSARIVRRRWGQPRRSKGYGFVDVGGEEEQQKAIEALQGKEVGGRNIAVKVAVNTTRDDDAEGAAPGGLTEITEVTVPATES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.2
4 0.19
5 0.17
6 0.17
7 0.18
8 0.2
9 0.2
10 0.19
11 0.15
12 0.15
13 0.15
14 0.15
15 0.12
16 0.09
17 0.1
18 0.1
19 0.13
20 0.14
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.15
25 0.14
26 0.16
27 0.13
28 0.11
29 0.11
30 0.11
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.11
38 0.11
39 0.13
40 0.13
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.08
52 0.09
53 0.1
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.04
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.06
75 0.06
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.11
80 0.12
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.12
85 0.12
86 0.13
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.15
91 0.18
92 0.19
93 0.2
94 0.27
95 0.27
96 0.35
97 0.43
98 0.5
99 0.57
100 0.66
101 0.74
102 0.77
103 0.86
104 0.88
105 0.89
106 0.9
107 0.9
108 0.91
109 0.93
110 0.92
111 0.93
112 0.91
113 0.88
114 0.81
115 0.8
116 0.72
117 0.62
118 0.52
119 0.42
120 0.36
121 0.26
122 0.24
123 0.14
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.06
129 0.06
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.09
143 0.13
144 0.21
145 0.25
146 0.28
147 0.36
148 0.46
149 0.54
150 0.64
151 0.7
152 0.74
153 0.8
154 0.89
155 0.92
156 0.94
157 0.94
158 0.94
159 0.93
160 0.91
161 0.87
162 0.83
163 0.8
164 0.72
165 0.66
166 0.57
167 0.49
168 0.4
169 0.34
170 0.26
171 0.17
172 0.14
173 0.09
174 0.08
175 0.06
176 0.05
177 0.04
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.03
188 0.04
189 0.05
190 0.06
191 0.09
192 0.1
193 0.17
194 0.24
195 0.29
196 0.39
197 0.49
198 0.59
199 0.64
200 0.73
201 0.78
202 0.83
203 0.88
204 0.88
205 0.87
206 0.87
207 0.82
208 0.79
209 0.72
210 0.66
211 0.6
212 0.51
213 0.42
214 0.39
215 0.37
216 0.28
217 0.23
218 0.2
219 0.16
220 0.16
221 0.15
222 0.08
223 0.08
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.06
233 0.05
234 0.04
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.03
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.08
252 0.13
253 0.14
254 0.2
255 0.27
256 0.37
257 0.48
258 0.57
259 0.65
260 0.7
261 0.8
262 0.83
263 0.81
264 0.73
265 0.7
266 0.68
267 0.64
268 0.55
269 0.46
270 0.38
271 0.33
272 0.32
273 0.25
274 0.18
275 0.12
276 0.11
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.08
281 0.08
282 0.11
283 0.13
284 0.14
285 0.17
286 0.18
287 0.17
288 0.22
289 0.23
290 0.21
291 0.19
292 0.19
293 0.17
294 0.17
295 0.18
296 0.14
297 0.13
298 0.14
299 0.18
300 0.21
301 0.21
302 0.22
303 0.24
304 0.26
305 0.25
306 0.25
307 0.19
308 0.17
309 0.18
310 0.16
311 0.13
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.08
316 0.07
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.07