Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F8QIS5

Protein Details
Accession F8QIS5    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-53STAPEHSGQPPQKKRKKSNQRSRRNQQVRHWDDPDHydrophilic
215-234AVYHCQKRSRQGQNIANTNDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-42QKKRKKSNQRSRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MRQLVSYDDISLPQAAGQSTAPEHSGQPPQKKRKKSNQRSRRNQQVRHWDDPDRSGDKTISEEGAADIDEDGEDESRELTHDEVWDDSALIDAWNSATAEYEEYHGPTKDWKNQSVKKSPLWFNVPITRSSHNAASAVDISQDDLSMEDDSKPIDFESFVPTHDPSLALPELPDPPPVSEPNYLMSSTYNPLEVDQDEAFSRALNAMYWGGYWTAVYHCQKRSRQGQNIANTNDEQNHVEDEDSGLEPEDDVNLVPTQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.11
3 0.12
4 0.11
5 0.12
6 0.12
7 0.14
8 0.14
9 0.14
10 0.15
11 0.19
12 0.28
13 0.33
14 0.43
15 0.52
16 0.62
17 0.7
18 0.79
19 0.84
20 0.86
21 0.9
22 0.91
23 0.92
24 0.92
25 0.94
26 0.95
27 0.95
28 0.95
29 0.93
30 0.91
31 0.89
32 0.89
33 0.86
34 0.83
35 0.77
36 0.71
37 0.64
38 0.59
39 0.56
40 0.48
41 0.41
42 0.36
43 0.32
44 0.27
45 0.27
46 0.25
47 0.19
48 0.15
49 0.14
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.08
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.04
80 0.04
81 0.05
82 0.05
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.11
92 0.11
93 0.11
94 0.16
95 0.2
96 0.27
97 0.3
98 0.35
99 0.43
100 0.49
101 0.57
102 0.59
103 0.59
104 0.55
105 0.59
106 0.56
107 0.52
108 0.5
109 0.45
110 0.39
111 0.42
112 0.38
113 0.32
114 0.31
115 0.28
116 0.25
117 0.24
118 0.22
119 0.16
120 0.16
121 0.14
122 0.12
123 0.11
124 0.09
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.08
153 0.12
154 0.12
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.13
159 0.14
160 0.15
161 0.12
162 0.13
163 0.16
164 0.17
165 0.19
166 0.18
167 0.19
168 0.2
169 0.21
170 0.2
171 0.18
172 0.17
173 0.16
174 0.16
175 0.15
176 0.13
177 0.12
178 0.12
179 0.14
180 0.13
181 0.14
182 0.12
183 0.13
184 0.12
185 0.13
186 0.13
187 0.11
188 0.11
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.09
202 0.16
203 0.21
204 0.27
205 0.33
206 0.42
207 0.47
208 0.55
209 0.63
210 0.66
211 0.7
212 0.74
213 0.76
214 0.76
215 0.8
216 0.74
217 0.66
218 0.57
219 0.5
220 0.42
221 0.37
222 0.29
223 0.22
224 0.22
225 0.19
226 0.18
227 0.16
228 0.15
229 0.15
230 0.14
231 0.13
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.1
237 0.08
238 0.07
239 0.09