Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F8PHS1

Protein Details
Accession F8PHS1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
283-303SDTGKKPYSEQKKEGEKKKDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
276-301REKEKKGSDTGKKPYSEQKKEGEKKK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MSNLEYRDLPEPSNSTDSAFTREMMDALPRIDTPPPKEARLEAYVKQEVEKAIRQTQMHYQSQLDEALEEVSVLERKLKKQIPPPPEKVERSRTALEKPENFSGDKKKYRAFRESLLLHFEDDAVYFKDDRKKISFVLSFMKEGEAAAFRTDWLENRVDAQQLGLDITNTYGSWPYFADKMEERFKDSFERETAKNEILTLRQGNETAQAFFERFEEKKRWAEYTNRINEEFLISLLRRNMNKPLVDRVIYGGHIPRDYQEWKKELIRIDYIWREREKEKKGSDTGKKPYSEQKKEGEKKKDGTGYTYTGSGERMEVDKAKFRTEGRCYPFSRKGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.27
3 0.29
4 0.3
5 0.31
6 0.29
7 0.25
8 0.23
9 0.23
10 0.22
11 0.18
12 0.2
13 0.16
14 0.15
15 0.16
16 0.14
17 0.16
18 0.21
19 0.26
20 0.28
21 0.35
22 0.38
23 0.39
24 0.41
25 0.41
26 0.41
27 0.42
28 0.42
29 0.37
30 0.41
31 0.42
32 0.41
33 0.39
34 0.36
35 0.32
36 0.32
37 0.33
38 0.3
39 0.32
40 0.37
41 0.36
42 0.37
43 0.44
44 0.47
45 0.45
46 0.42
47 0.38
48 0.34
49 0.35
50 0.33
51 0.24
52 0.16
53 0.13
54 0.11
55 0.1
56 0.08
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.13
62 0.16
63 0.18
64 0.27
65 0.33
66 0.38
67 0.46
68 0.55
69 0.59
70 0.66
71 0.7
72 0.7
73 0.73
74 0.72
75 0.7
76 0.69
77 0.64
78 0.6
79 0.58
80 0.52
81 0.49
82 0.51
83 0.51
84 0.48
85 0.47
86 0.46
87 0.43
88 0.41
89 0.41
90 0.42
91 0.44
92 0.45
93 0.45
94 0.45
95 0.51
96 0.56
97 0.6
98 0.54
99 0.49
100 0.51
101 0.5
102 0.47
103 0.43
104 0.37
105 0.29
106 0.26
107 0.22
108 0.14
109 0.11
110 0.11
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.12
115 0.2
116 0.21
117 0.25
118 0.27
119 0.28
120 0.28
121 0.35
122 0.34
123 0.28
124 0.33
125 0.31
126 0.28
127 0.26
128 0.25
129 0.17
130 0.15
131 0.14
132 0.09
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.1
141 0.11
142 0.1
143 0.12
144 0.13
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.06
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.11
166 0.11
167 0.16
168 0.22
169 0.22
170 0.25
171 0.25
172 0.26
173 0.28
174 0.28
175 0.27
176 0.23
177 0.26
178 0.23
179 0.26
180 0.27
181 0.23
182 0.22
183 0.2
184 0.18
185 0.15
186 0.17
187 0.15
188 0.14
189 0.13
190 0.13
191 0.13
192 0.16
193 0.16
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.12
199 0.13
200 0.12
201 0.12
202 0.16
203 0.2
204 0.23
205 0.29
206 0.31
207 0.33
208 0.33
209 0.41
210 0.45
211 0.51
212 0.56
213 0.52
214 0.51
215 0.47
216 0.44
217 0.38
218 0.29
219 0.19
220 0.14
221 0.11
222 0.13
223 0.16
224 0.2
225 0.19
226 0.21
227 0.28
228 0.31
229 0.34
230 0.34
231 0.39
232 0.39
233 0.38
234 0.36
235 0.32
236 0.28
237 0.25
238 0.24
239 0.2
240 0.18
241 0.17
242 0.17
243 0.15
244 0.19
245 0.23
246 0.28
247 0.31
248 0.32
249 0.35
250 0.39
251 0.42
252 0.42
253 0.42
254 0.39
255 0.35
256 0.39
257 0.44
258 0.44
259 0.46
260 0.44
261 0.43
262 0.44
263 0.52
264 0.52
265 0.53
266 0.54
267 0.56
268 0.61
269 0.67
270 0.72
271 0.72
272 0.74
273 0.72
274 0.68
275 0.64
276 0.66
277 0.67
278 0.66
279 0.63
280 0.63
281 0.67
282 0.75
283 0.81
284 0.81
285 0.78
286 0.74
287 0.76
288 0.74
289 0.64
290 0.6
291 0.55
292 0.49
293 0.43
294 0.39
295 0.31
296 0.25
297 0.25
298 0.2
299 0.16
300 0.14
301 0.14
302 0.16
303 0.2
304 0.23
305 0.3
306 0.31
307 0.34
308 0.36
309 0.37
310 0.44
311 0.47
312 0.54
313 0.53
314 0.59
315 0.61
316 0.66