Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F8PR68

Protein Details
Accession F8PR68    Localization Confidence High Confidence Score 24.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-32SSSTSPSPPPSSKKRKRDAKVQPVAVVHydrophilic
76-100DIVLSHAERRRQKKQERKSIALDKSHydrophilic
116-140ASSKKSSKAKDPKATAKQKRQNSVWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-22KKRKR
84-135RRRQKKQERKSIALDKSSPSKKRKLEDGTSAPASSKKSSKAKDPKATAKQKR
292-301HKPGKGKGRE
362-402GGPRVAGAAGSGERGMGGRGGTRGGRDGGRGGKPRGGKWER
443-470RGGGRGGDRGRGRGRGSDRFLSRSRAKP
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTPSSSSSTSPSPPPSSKKRKRDAKVQPVAVVDDSDDSDSDAKDDADSGSDEDSDDENEPAGSENVAGDAPSDDEDIVLSHAERRRQKKQERKSIALDKSSPSKKRKLEDGTSAPASSKKSSKAKDPKATAKQKRQNSVWVGNLAFKTTPDALKGFFDGVGEITRVHMPMKAGSQEDNMGFAYVDFASPDVKVIAITLSERDFQGRKLLIKDGDDFTGRPAAKPTPTEPSTDPNLPSDPSTASTKPAVGQSKFAQKTLRNQKQPPAPTLFFGNLGFETTDEDLKALVEMHRHKPGKGKGREEAKGEDEGEDKAKEGEEKFAFIDFTSVQHATDALTNPRVHRLQGRELVVEYASAEAVRRGGGPRVAGAAGSGERGMGGRGGTRGGRDGGRGGKPRGGKWERGTRDSTRTNQWEQNGGGDDHDGDGHVEEQGGESETQSRFGRGGGRGGDRGRGRGRGSDRFLSRSRAKPGAALAQAPRESAAIIPSSGQKITF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.61
3 0.68
4 0.74
5 0.79
6 0.83
7 0.86
8 0.88
9 0.9
10 0.9
11 0.9
12 0.9
13 0.84
14 0.78
15 0.69
16 0.64
17 0.53
18 0.42
19 0.31
20 0.23
21 0.19
22 0.15
23 0.13
24 0.12
25 0.13
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.11
30 0.1
31 0.11
32 0.1
33 0.1
34 0.11
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.12
40 0.12
41 0.13
42 0.13
43 0.12
44 0.12
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.09
50 0.07
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.08
59 0.09
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.12
68 0.16
69 0.24
70 0.32
71 0.4
72 0.49
73 0.59
74 0.7
75 0.75
76 0.83
77 0.86
78 0.87
79 0.86
80 0.85
81 0.84
82 0.8
83 0.75
84 0.67
85 0.59
86 0.6
87 0.61
88 0.6
89 0.57
90 0.59
91 0.6
92 0.62
93 0.68
94 0.68
95 0.66
96 0.67
97 0.68
98 0.65
99 0.6
100 0.55
101 0.46
102 0.4
103 0.37
104 0.31
105 0.28
106 0.3
107 0.36
108 0.39
109 0.49
110 0.57
111 0.64
112 0.7
113 0.73
114 0.76
115 0.78
116 0.86
117 0.85
118 0.85
119 0.84
120 0.82
121 0.83
122 0.75
123 0.73
124 0.7
125 0.65
126 0.58
127 0.53
128 0.45
129 0.41
130 0.38
131 0.31
132 0.24
133 0.18
134 0.18
135 0.16
136 0.16
137 0.14
138 0.15
139 0.15
140 0.16
141 0.16
142 0.13
143 0.11
144 0.11
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.09
156 0.11
157 0.14
158 0.15
159 0.15
160 0.16
161 0.17
162 0.17
163 0.16
164 0.16
165 0.13
166 0.11
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.07
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.1
189 0.11
190 0.11
191 0.17
192 0.17
193 0.18
194 0.2
195 0.23
196 0.22
197 0.24
198 0.26
199 0.21
200 0.21
201 0.2
202 0.17
203 0.15
204 0.2
205 0.18
206 0.15
207 0.16
208 0.17
209 0.18
210 0.2
211 0.21
212 0.23
213 0.24
214 0.27
215 0.25
216 0.27
217 0.3
218 0.3
219 0.29
220 0.22
221 0.22
222 0.2
223 0.19
224 0.16
225 0.13
226 0.13
227 0.16
228 0.14
229 0.15
230 0.15
231 0.15
232 0.15
233 0.19
234 0.22
235 0.18
236 0.21
237 0.22
238 0.31
239 0.32
240 0.32
241 0.31
242 0.28
243 0.38
244 0.46
245 0.52
246 0.5
247 0.52
248 0.57
249 0.6
250 0.61
251 0.56
252 0.51
253 0.43
254 0.37
255 0.36
256 0.3
257 0.24
258 0.21
259 0.17
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.1
275 0.15
276 0.18
277 0.27
278 0.28
279 0.29
280 0.37
281 0.43
282 0.49
283 0.52
284 0.54
285 0.52
286 0.59
287 0.61
288 0.56
289 0.52
290 0.44
291 0.39
292 0.34
293 0.28
294 0.21
295 0.19
296 0.18
297 0.14
298 0.12
299 0.1
300 0.1
301 0.12
302 0.11
303 0.17
304 0.15
305 0.17
306 0.17
307 0.17
308 0.17
309 0.14
310 0.15
311 0.09
312 0.09
313 0.12
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.1
319 0.12
320 0.13
321 0.12
322 0.17
323 0.18
324 0.19
325 0.25
326 0.25
327 0.24
328 0.28
329 0.31
330 0.34
331 0.39
332 0.41
333 0.36
334 0.35
335 0.35
336 0.28
337 0.23
338 0.16
339 0.1
340 0.07
341 0.06
342 0.06
343 0.05
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.08
348 0.11
349 0.13
350 0.13
351 0.13
352 0.15
353 0.14
354 0.13
355 0.12
356 0.1
357 0.09
358 0.09
359 0.08
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.1
369 0.11
370 0.11
371 0.13
372 0.15
373 0.15
374 0.15
375 0.19
376 0.23
377 0.3
378 0.35
379 0.35
380 0.38
381 0.41
382 0.42
383 0.49
384 0.47
385 0.48
386 0.5
387 0.58
388 0.58
389 0.6
390 0.63
391 0.57
392 0.61
393 0.6
394 0.57
395 0.56
396 0.57
397 0.58
398 0.58
399 0.55
400 0.53
401 0.46
402 0.46
403 0.4
404 0.33
405 0.28
406 0.23
407 0.21
408 0.15
409 0.15
410 0.11
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.07
418 0.08
419 0.09
420 0.08
421 0.09
422 0.14
423 0.14
424 0.19
425 0.19
426 0.19
427 0.17
428 0.19
429 0.25
430 0.22
431 0.27
432 0.29
433 0.32
434 0.36
435 0.37
436 0.43
437 0.39
438 0.44
439 0.42
440 0.43
441 0.41
442 0.44
443 0.5
444 0.52
445 0.57
446 0.58
447 0.58
448 0.58
449 0.59
450 0.59
451 0.6
452 0.59
453 0.59
454 0.56
455 0.53
456 0.5
457 0.52
458 0.52
459 0.46
460 0.43
461 0.39
462 0.41
463 0.41
464 0.38
465 0.34
466 0.25
467 0.23
468 0.19
469 0.19
470 0.13
471 0.12
472 0.14
473 0.17
474 0.2