Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F8PT89

Protein Details
Accession F8PT89    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-37GGGANKMRRRRVEVMKKWIRMGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-65RKRIGSGDIRNGGGANKMRRRRVEVMKKWIRMGIQKRPSGGNKKERKGPMVGLGKGRGPVA
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040648  HMGXB3_CxC4  
Pfam View protein in Pfam  
PF18717  CxC4  
Amino Acid Sequences MDWRRKRIGSGDIRNGGGANKMRRRRVEVMKKWIRMGIQKRPSGGNKKERKGPMVGLGKGRGPVAMRKFAEMPKCRKYLMEKQRCFIGPDLQESGLFNFNNHLVFTHDLLDEYTSAFSKLYCFLCSKASPENSVDVDDVSDSSAGIQSSGESHEEGTDTLLKWMDEIPEIFARLQTVNTAQAQLFLSHFGSLSSKGYPPSVYRNLFMQASIHIVILSAEALTAEESILQMINRLCRVWLGYQVYMMFVGTTMSEKREVYPPDMISLCFWLYERAWEVLKKLLAKEAPLADNVRAASERNDSGSHWQKTGCLYSMPQIQSRPQYPHLKYDLCSEPGGRCGDKCSKYYSQYGEQRLTGGIIICYGFHCIPRGEGRNDVFSAIVTRWPKAPKVVVYDFACALGPYCLTHTLFVVDGFHARGHIKCSRAAFLTTYANADPRLAQINLSAAECGNSALKQIRFPINLESSEGPQNAGYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.52
3 0.43
4 0.39
5 0.36
6 0.35
7 0.41
8 0.48
9 0.56
10 0.61
11 0.69
12 0.71
13 0.75
14 0.77
15 0.78
16 0.81
17 0.83
18 0.81
19 0.75
20 0.69
21 0.63
22 0.61
23 0.6
24 0.59
25 0.59
26 0.58
27 0.59
28 0.63
29 0.67
30 0.68
31 0.69
32 0.69
33 0.7
34 0.73
35 0.8
36 0.78
37 0.74
38 0.69
39 0.63
40 0.62
41 0.6
42 0.57
43 0.53
44 0.49
45 0.46
46 0.42
47 0.38
48 0.3
49 0.23
50 0.27
51 0.28
52 0.35
53 0.34
54 0.36
55 0.4
56 0.43
57 0.51
58 0.52
59 0.54
60 0.53
61 0.55
62 0.53
63 0.53
64 0.56
65 0.57
66 0.6
67 0.63
68 0.59
69 0.58
70 0.65
71 0.62
72 0.57
73 0.48
74 0.45
75 0.37
76 0.37
77 0.38
78 0.31
79 0.3
80 0.28
81 0.28
82 0.24
83 0.21
84 0.17
85 0.15
86 0.16
87 0.16
88 0.15
89 0.14
90 0.12
91 0.14
92 0.15
93 0.16
94 0.15
95 0.14
96 0.14
97 0.15
98 0.12
99 0.11
100 0.1
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.13
107 0.14
108 0.15
109 0.16
110 0.17
111 0.22
112 0.23
113 0.25
114 0.28
115 0.28
116 0.29
117 0.29
118 0.31
119 0.27
120 0.28
121 0.25
122 0.17
123 0.15
124 0.13
125 0.11
126 0.08
127 0.07
128 0.05
129 0.05
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.1
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.12
156 0.13
157 0.12
158 0.11
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.09
163 0.09
164 0.11
165 0.11
166 0.13
167 0.11
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.1
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.12
184 0.13
185 0.14
186 0.2
187 0.26
188 0.26
189 0.25
190 0.26
191 0.27
192 0.26
193 0.24
194 0.18
195 0.11
196 0.12
197 0.12
198 0.1
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.04
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.04
215 0.03
216 0.06
217 0.06
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.11
224 0.09
225 0.14
226 0.15
227 0.15
228 0.16
229 0.16
230 0.16
231 0.14
232 0.13
233 0.07
234 0.04
235 0.04
236 0.03
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.08
241 0.08
242 0.1
243 0.16
244 0.17
245 0.19
246 0.23
247 0.22
248 0.23
249 0.23
250 0.22
251 0.16
252 0.16
253 0.13
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.12
262 0.13
263 0.14
264 0.15
265 0.17
266 0.17
267 0.16
268 0.18
269 0.18
270 0.18
271 0.2
272 0.2
273 0.18
274 0.19
275 0.2
276 0.16
277 0.17
278 0.16
279 0.14
280 0.11
281 0.11
282 0.12
283 0.13
284 0.14
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.22
289 0.3
290 0.3
291 0.28
292 0.27
293 0.27
294 0.29
295 0.31
296 0.24
297 0.16
298 0.15
299 0.18
300 0.25
301 0.26
302 0.26
303 0.25
304 0.28
305 0.32
306 0.35
307 0.36
308 0.36
309 0.44
310 0.43
311 0.49
312 0.51
313 0.48
314 0.45
315 0.47
316 0.44
317 0.37
318 0.36
319 0.3
320 0.25
321 0.27
322 0.29
323 0.23
324 0.18
325 0.22
326 0.3
327 0.32
328 0.33
329 0.35
330 0.38
331 0.41
332 0.47
333 0.46
334 0.47
335 0.51
336 0.55
337 0.51
338 0.45
339 0.42
340 0.37
341 0.32
342 0.23
343 0.17
344 0.11
345 0.09
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.12
353 0.12
354 0.15
355 0.22
356 0.28
357 0.27
358 0.33
359 0.34
360 0.36
361 0.37
362 0.34
363 0.27
364 0.21
365 0.21
366 0.15
367 0.19
368 0.16
369 0.17
370 0.21
371 0.24
372 0.26
373 0.29
374 0.34
375 0.33
376 0.4
377 0.42
378 0.44
379 0.44
380 0.44
381 0.39
382 0.34
383 0.29
384 0.21
385 0.19
386 0.12
387 0.1
388 0.08
389 0.1
390 0.13
391 0.14
392 0.14
393 0.14
394 0.15
395 0.15
396 0.14
397 0.14
398 0.11
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.12
403 0.14
404 0.15
405 0.19
406 0.23
407 0.24
408 0.27
409 0.3
410 0.33
411 0.33
412 0.34
413 0.3
414 0.3
415 0.33
416 0.29
417 0.29
418 0.26
419 0.25
420 0.24
421 0.23
422 0.19
423 0.17
424 0.21
425 0.18
426 0.17
427 0.17
428 0.2
429 0.21
430 0.2
431 0.18
432 0.13
433 0.14
434 0.14
435 0.13
436 0.11
437 0.1
438 0.13
439 0.19
440 0.21
441 0.23
442 0.3
443 0.36
444 0.36
445 0.38
446 0.43
447 0.42
448 0.41
449 0.42
450 0.38
451 0.34
452 0.38
453 0.37
454 0.3