Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F8PMY3

Protein Details
Accession F8PMY3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
111-130WVRKMFTLSRPQRKLRQPGSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041588  Integrase_H2C2  
Pfam View protein in Pfam  
PF17921  Integrase_H2C2  
Amino Acid Sequences MPANSRNQNLRRISDSKPYTKRVPSIAPSSPAMSESQESVVSPLISSQEFTSKPGFPTYPQYKRIELTYLSCLSPRKRDKALITQVMFDKIWDVLHQPEACDIETPQFRFWVRKMFTLSRPQRKLRQPGSTEDSEDLPAVVLHENRPVAVMEQLYEVFCYCHERANHGGRDKTCAVIRQHYSWVPKELTAQFVKACPTCTLKRSGNPDLVAMVQEQVLNQEENSNRRFPPAPTVEDSCQWTSQNNWPPGGGPLDTPNKMNDCSKELLYPGLPSLSCVPSLSALSTSSYGGSQGLQSHPMSREVSLFNGIPHGWTHLPPPPAEGTCYVVNHPMVDPSKRPRVPNVVYTHNIGRNDSTDGSDIYGDSREVSPKLPALAHVLTDRKSDNHVVLNQPQLGNANDSLPSSLQHLQLSNPVTAAVEYGPYIGQIDPALLIRQGAETTGNTKNNTGSNHYVDSYESEHQEWADFAISKSSSVEVSPQTPVRLKRRLTRTAAPSSLNLNIVTRDDHDFSNYRSHVVPRINTPPSPSSEMTSSITPFPVNLGKVTNTADNLKLDDQAGVQNVVDAGET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.62
3 0.63
4 0.65
5 0.66
6 0.67
7 0.7
8 0.7
9 0.66
10 0.66
11 0.62
12 0.62
13 0.61
14 0.57
15 0.51
16 0.48
17 0.42
18 0.35
19 0.3
20 0.25
21 0.2
22 0.18
23 0.18
24 0.16
25 0.16
26 0.16
27 0.17
28 0.14
29 0.13
30 0.12
31 0.13
32 0.13
33 0.14
34 0.14
35 0.18
36 0.19
37 0.22
38 0.25
39 0.26
40 0.27
41 0.31
42 0.31
43 0.27
44 0.37
45 0.45
46 0.49
47 0.53
48 0.56
49 0.54
50 0.54
51 0.54
52 0.49
53 0.41
54 0.37
55 0.36
56 0.34
57 0.32
58 0.33
59 0.35
60 0.34
61 0.42
62 0.46
63 0.46
64 0.5
65 0.57
66 0.61
67 0.66
68 0.72
69 0.71
70 0.64
71 0.61
72 0.57
73 0.53
74 0.46
75 0.35
76 0.26
77 0.18
78 0.17
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.19
83 0.2
84 0.19
85 0.21
86 0.22
87 0.22
88 0.21
89 0.19
90 0.19
91 0.24
92 0.25
93 0.24
94 0.25
95 0.26
96 0.3
97 0.31
98 0.34
99 0.32
100 0.35
101 0.42
102 0.44
103 0.5
104 0.56
105 0.64
106 0.65
107 0.7
108 0.71
109 0.73
110 0.76
111 0.8
112 0.77
113 0.77
114 0.7
115 0.7
116 0.7
117 0.63
118 0.56
119 0.47
120 0.4
121 0.31
122 0.28
123 0.2
124 0.13
125 0.1
126 0.09
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.14
134 0.13
135 0.12
136 0.13
137 0.12
138 0.09
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.08
145 0.08
146 0.13
147 0.12
148 0.17
149 0.18
150 0.22
151 0.29
152 0.37
153 0.43
154 0.42
155 0.47
156 0.42
157 0.48
158 0.44
159 0.4
160 0.33
161 0.33
162 0.32
163 0.34
164 0.37
165 0.33
166 0.36
167 0.38
168 0.41
169 0.37
170 0.39
171 0.32
172 0.3
173 0.32
174 0.29
175 0.3
176 0.27
177 0.26
178 0.22
179 0.22
180 0.24
181 0.2
182 0.2
183 0.17
184 0.22
185 0.24
186 0.25
187 0.31
188 0.32
189 0.37
190 0.42
191 0.45
192 0.44
193 0.41
194 0.39
195 0.33
196 0.29
197 0.24
198 0.17
199 0.12
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.11
208 0.13
209 0.17
210 0.2
211 0.22
212 0.2
213 0.23
214 0.26
215 0.22
216 0.29
217 0.3
218 0.31
219 0.31
220 0.36
221 0.34
222 0.34
223 0.36
224 0.28
225 0.25
226 0.22
227 0.19
228 0.18
229 0.25
230 0.31
231 0.3
232 0.28
233 0.27
234 0.27
235 0.28
236 0.27
237 0.19
238 0.11
239 0.14
240 0.18
241 0.19
242 0.19
243 0.19
244 0.19
245 0.2
246 0.21
247 0.18
248 0.17
249 0.19
250 0.19
251 0.18
252 0.17
253 0.17
254 0.15
255 0.13
256 0.1
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.07
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.08
281 0.1
282 0.1
283 0.12
284 0.13
285 0.15
286 0.15
287 0.14
288 0.16
289 0.14
290 0.15
291 0.14
292 0.14
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.09
297 0.09
298 0.11
299 0.1
300 0.1
301 0.12
302 0.15
303 0.17
304 0.16
305 0.18
306 0.18
307 0.17
308 0.18
309 0.17
310 0.16
311 0.16
312 0.17
313 0.16
314 0.16
315 0.15
316 0.15
317 0.14
318 0.15
319 0.15
320 0.16
321 0.19
322 0.22
323 0.32
324 0.35
325 0.36
326 0.37
327 0.44
328 0.45
329 0.49
330 0.48
331 0.44
332 0.43
333 0.44
334 0.43
335 0.38
336 0.35
337 0.28
338 0.24
339 0.2
340 0.21
341 0.19
342 0.17
343 0.14
344 0.13
345 0.13
346 0.12
347 0.11
348 0.09
349 0.09
350 0.07
351 0.08
352 0.08
353 0.1
354 0.1
355 0.11
356 0.12
357 0.12
358 0.14
359 0.13
360 0.13
361 0.16
362 0.15
363 0.16
364 0.17
365 0.19
366 0.18
367 0.2
368 0.2
369 0.16
370 0.19
371 0.2
372 0.2
373 0.22
374 0.24
375 0.26
376 0.29
377 0.32
378 0.31
379 0.29
380 0.27
381 0.24
382 0.22
383 0.2
384 0.16
385 0.13
386 0.12
387 0.12
388 0.12
389 0.11
390 0.1
391 0.12
392 0.15
393 0.16
394 0.17
395 0.17
396 0.17
397 0.22
398 0.24
399 0.2
400 0.17
401 0.15
402 0.13
403 0.13
404 0.13
405 0.08
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.06
413 0.07
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.07
418 0.08
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.08
426 0.08
427 0.13
428 0.19
429 0.22
430 0.23
431 0.24
432 0.26
433 0.28
434 0.31
435 0.32
436 0.31
437 0.31
438 0.33
439 0.32
440 0.3
441 0.27
442 0.27
443 0.25
444 0.23
445 0.2
446 0.19
447 0.19
448 0.19
449 0.19
450 0.16
451 0.13
452 0.13
453 0.12
454 0.11
455 0.15
456 0.15
457 0.15
458 0.16
459 0.15
460 0.13
461 0.13
462 0.17
463 0.14
464 0.17
465 0.21
466 0.22
467 0.25
468 0.3
469 0.37
470 0.42
471 0.47
472 0.5
473 0.55
474 0.63
475 0.68
476 0.7
477 0.71
478 0.71
479 0.71
480 0.7
481 0.63
482 0.55
483 0.5
484 0.45
485 0.38
486 0.3
487 0.23
488 0.2
489 0.19
490 0.19
491 0.18
492 0.2
493 0.2
494 0.2
495 0.24
496 0.25
497 0.26
498 0.34
499 0.32
500 0.3
501 0.3
502 0.32
503 0.35
504 0.39
505 0.4
506 0.38
507 0.46
508 0.49
509 0.47
510 0.5
511 0.47
512 0.46
513 0.49
514 0.43
515 0.38
516 0.36
517 0.38
518 0.35
519 0.33
520 0.3
521 0.25
522 0.25
523 0.21
524 0.19
525 0.19
526 0.22
527 0.2
528 0.2
529 0.21
530 0.22
531 0.25
532 0.28
533 0.27
534 0.25
535 0.27
536 0.29
537 0.27
538 0.29
539 0.27
540 0.26
541 0.23
542 0.21
543 0.19
544 0.2
545 0.2
546 0.18
547 0.16
548 0.15
549 0.15