Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F8PJV3

Protein Details
Accession F8PJV3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-278SENGKKSYSEQKKEGEKKRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
252-276REKEKKGSENGKKSYSEQKKEGEKK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MDSLPRIETPPPKEAQLEAFVKQEVEKAVRAIRMLYQSQLDEALEEVSVLERKLKKQSSPPPERTERSRTALEKPENFSGDKKKYRAFRESLLLHFEDDAIYFKDDRKKISFMLSFMKEGEAAAFRTDWLENRVDAQQMGLDITNTYGSWPYFADKMEERFKDSFEKEAAKNEILTLKQGNETAQAFFERFEDKKRWAGHKNRINEEFLISLLRRNMNKPLVDRVIYGGHIPRDYQEWKRELIRMDYIWREREKEKKGSENGKKSYSEQKKEGEKKRDGTGYTYTGNGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.39
3 0.39
4 0.36
5 0.31
6 0.31
7 0.29
8 0.28
9 0.26
10 0.25
11 0.2
12 0.2
13 0.19
14 0.2
15 0.24
16 0.25
17 0.25
18 0.23
19 0.24
20 0.27
21 0.27
22 0.26
23 0.25
24 0.23
25 0.24
26 0.23
27 0.19
28 0.13
29 0.12
30 0.11
31 0.08
32 0.07
33 0.06
34 0.07
35 0.08
36 0.08
37 0.14
38 0.17
39 0.21
40 0.3
41 0.34
42 0.38
43 0.47
44 0.57
45 0.62
46 0.69
47 0.73
48 0.72
49 0.76
50 0.75
51 0.72
52 0.7
53 0.65
54 0.6
55 0.59
56 0.53
57 0.53
58 0.57
59 0.57
60 0.54
61 0.52
62 0.52
63 0.48
64 0.46
65 0.43
66 0.43
67 0.45
68 0.47
69 0.46
70 0.47
71 0.52
72 0.58
73 0.61
74 0.55
75 0.5
76 0.52
77 0.51
78 0.48
79 0.44
80 0.38
81 0.3
82 0.26
83 0.22
84 0.14
85 0.12
86 0.11
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.13
91 0.2
92 0.22
93 0.26
94 0.28
95 0.29
96 0.29
97 0.36
98 0.34
99 0.29
100 0.34
101 0.31
102 0.28
103 0.26
104 0.25
105 0.17
106 0.15
107 0.14
108 0.09
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.1
117 0.11
118 0.1
119 0.12
120 0.13
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.08
125 0.07
126 0.08
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.11
142 0.11
143 0.16
144 0.22
145 0.22
146 0.25
147 0.25
148 0.26
149 0.29
150 0.28
151 0.26
152 0.22
153 0.26
154 0.22
155 0.27
156 0.28
157 0.23
158 0.22
159 0.2
160 0.21
161 0.17
162 0.18
163 0.14
164 0.12
165 0.13
166 0.14
167 0.13
168 0.13
169 0.14
170 0.13
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.12
178 0.17
179 0.2
180 0.22
181 0.28
182 0.34
183 0.4
184 0.46
185 0.55
186 0.6
187 0.64
188 0.69
189 0.7
190 0.67
191 0.63
192 0.54
193 0.46
194 0.36
195 0.29
196 0.24
197 0.17
198 0.16
199 0.17
200 0.2
201 0.2
202 0.22
203 0.29
204 0.32
205 0.35
206 0.35
207 0.4
208 0.4
209 0.39
210 0.38
211 0.33
212 0.29
213 0.26
214 0.25
215 0.21
216 0.19
217 0.18
218 0.18
219 0.16
220 0.2
221 0.24
222 0.29
223 0.33
224 0.33
225 0.36
226 0.4
227 0.43
228 0.41
229 0.41
230 0.4
231 0.34
232 0.37
233 0.42
234 0.42
235 0.44
236 0.44
237 0.44
238 0.44
239 0.51
240 0.53
241 0.55
242 0.57
243 0.61
244 0.67
245 0.73
246 0.78
247 0.79
248 0.78
249 0.74
250 0.7
251 0.65
252 0.67
253 0.66
254 0.64
255 0.6
256 0.62
257 0.67
258 0.75
259 0.81
260 0.8
261 0.77
262 0.74
263 0.76
264 0.75
265 0.66
266 0.6
267 0.56
268 0.51
269 0.44