FuNGI

F8PP13

Protein Details

Accession

F8PP13

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-27	SESLLFHKKKVVKKEPSGSDTS	Hydrophilic
155-178	DAAKGKANGRKKFQKKTRQVFLVP	Hydrophilic
581-605	VANGANVPPKPKKRKPLPGGSVPTG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
153-170	EKDAAKGKANGRKKFQKK
589-596	PKPKKRKP

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MPSKPSESLLFHKKKVVKKEPSGSDTSSLLASPRKSATPRQMPKPEPDDEMKLPEGKYSEFKLMSSALNGWKYDVMKFDSRKSIDVSTWESPIRLNRKESRREEVNTTQVVAGPMLGPDGKPVIGPDGKAVMVDADGRPIHNYNNAGEGSSKEKDAAKGKANGRKKFQKKTRQVFLVPEATRQLRREERYPWVMEDGKQKESPRRRHTLFFMPAETEVFKFVPAHRWYKFQKKPNYHVPNLEEAESIMAKIQKNKDPERWLLHNRNGKAASSATSAIFKAQAEGRVISSGNSLVHTAGQSLGPGNRKLKTVDREVDGLFGDDDDEGGDRRRKRENDGEGDLDENEFEEEFADDEEAVNPADNDDEEAKELEERLKREYKNANKQREGYIDESEEEDDDTLLTKDGKNMKKLIRNLEKNTAYESDEERNPYASSDEEEEEEEPPVVTNEPAIQQQPQQINSRSSSQQPSANTQSGNRGSNGSAAVDSRANSPVPATSPGLGGHSVVAKRATSPKAPKLKSSASRGSSPLSGGAGSRATSPVNGSRATSPTVGNAASPSAPKLSNKRKATDDLTGGAPSPGAVANGANVPPKPKKRKPLPGGSVPTGELEDRMLVEWLKNTTNATTRDCIQHFQPYLTDEAKKSRFTALVKEVAQLKGGVLILKNAYREGSSAASPGPV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.68
3	0.71
4	0.7
5	0.74
6	0.81
7	0.82
8	0.81
9	0.78
10	0.7
11	0.63
12	0.53
13	0.44
14	0.34
15	0.25
16	0.22
17	0.22
18	0.2
19	0.21
20	0.23
21	0.28
22	0.32
23	0.4
24	0.48
25	0.54
26	0.62
27	0.68
28	0.75
29	0.74
30	0.78
31	0.76
32	0.69
33	0.63
34	0.6
35	0.56
36	0.49
37	0.5
38	0.44
39	0.42
40	0.38
41	0.35
42	0.32
43	0.28
44	0.29
45	0.28
46	0.32
47	0.29
48	0.29
49	0.29
50	0.29
51	0.27
52	0.25
53	0.25
54	0.24
55	0.26
56	0.26
57	0.25
58	0.27
59	0.27
60	0.27
61	0.27
62	0.26
63	0.31
64	0.34
65	0.39
66	0.44
67	0.45
68	0.46
69	0.45
70	0.43
71	0.37
72	0.39
73	0.39
74	0.33
75	0.34
76	0.32
77	0.29
78	0.28
79	0.34
80	0.38
81	0.36
82	0.41
83	0.47
84	0.56
85	0.66
86	0.7
87	0.7
88	0.69
89	0.69
90	0.69
91	0.67
92	0.64
93	0.55
94	0.51
95	0.43
96	0.37
97	0.33
98	0.25
99	0.18
100	0.11
101	0.09
102	0.09
103	0.09
104	0.07
105	0.08
106	0.09
107	0.09
108	0.08
109	0.09
110	0.14
111	0.15
112	0.15
113	0.16
114	0.17
115	0.17
116	0.16
117	0.16
118	0.1
119	0.09
120	0.11
121	0.09
122	0.11
123	0.12
124	0.12
125	0.15
126	0.16
127	0.17
128	0.19
129	0.21
130	0.18
131	0.22
132	0.22
133	0.2
134	0.2
135	0.2
136	0.21
137	0.2
138	0.19
139	0.17
140	0.19
141	0.23
142	0.28
143	0.32
144	0.33
145	0.4
146	0.47
147	0.54
148	0.61
149	0.63
150	0.66
151	0.71
152	0.74
153	0.77
154	0.8
155	0.82
156	0.84
157	0.87
158	0.88
159	0.84
160	0.78
161	0.73
162	0.69
163	0.67
164	0.56
165	0.48
166	0.43
167	0.38
168	0.39
169	0.35
170	0.36
171	0.35
172	0.39
173	0.41
174	0.42
175	0.47
176	0.49
177	0.5
178	0.44
179	0.42
180	0.39
181	0.38
182	0.42
183	0.39
184	0.36
185	0.38
186	0.39
187	0.43
188	0.51
189	0.58
190	0.57
191	0.62
192	0.62
193	0.64
194	0.67
195	0.67
196	0.64
197	0.56
198	0.5
199	0.41
200	0.38
201	0.34
202	0.3
203	0.2
204	0.15
205	0.12
206	0.11
207	0.11
208	0.12
209	0.19
210	0.22
211	0.28
212	0.28
213	0.35
214	0.4
215	0.5
216	0.57
217	0.57
218	0.63
219	0.66
220	0.72
221	0.76
222	0.79
223	0.72
224	0.7
225	0.64
226	0.61
227	0.53
228	0.47
229	0.35
230	0.27
231	0.25
232	0.18
233	0.15
234	0.09
235	0.11
236	0.11
237	0.17
238	0.22
239	0.25
240	0.32
241	0.37
242	0.43
243	0.45
244	0.5
245	0.51
246	0.53
247	0.57
248	0.58
249	0.61
250	0.6
251	0.55
252	0.56
253	0.5
254	0.43
255	0.36
256	0.29
257	0.23
258	0.19
259	0.19
260	0.13
261	0.14
262	0.13
263	0.12
264	0.12
265	0.1
266	0.1
267	0.1
268	0.13
269	0.13
270	0.13
271	0.13
272	0.13
273	0.13
274	0.12
275	0.11
276	0.09
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.09
289	0.11
290	0.14
291	0.16
292	0.17
293	0.19
294	0.21
295	0.27
296	0.29
297	0.33
298	0.33
299	0.32
300	0.33
301	0.32
302	0.3
303	0.24
304	0.19
305	0.12
306	0.09
307	0.07
308	0.05
309	0.05
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.07
314	0.12
315	0.13
316	0.16
317	0.24
318	0.26
319	0.32
320	0.4
321	0.45
322	0.47
323	0.49
324	0.47
325	0.4
326	0.39
327	0.32
328	0.23
329	0.16
330	0.09
331	0.06
332	0.04
333	0.04
334	0.03
335	0.03
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.05
350	0.05
351	0.06
352	0.06
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.08
357	0.11
358	0.13
359	0.14
360	0.19
361	0.25
362	0.25
363	0.32
364	0.41
365	0.46
366	0.54
367	0.62
368	0.66
369	0.64
370	0.66
371	0.63
372	0.57
373	0.51
374	0.42
375	0.35
376	0.28
377	0.24
378	0.23
379	0.19
380	0.15
381	0.11
382	0.09
383	0.06
384	0.05
385	0.06
386	0.05
387	0.05
388	0.06
389	0.06
390	0.11
391	0.19
392	0.23
393	0.26
394	0.31
395	0.37
396	0.43
397	0.48
398	0.53
399	0.55
400	0.59
401	0.6
402	0.64
403	0.6
404	0.54
405	0.52
406	0.44
407	0.35
408	0.29
409	0.28
410	0.22
411	0.22
412	0.23
413	0.21
414	0.2
415	0.19
416	0.18
417	0.16
418	0.12
419	0.12
420	0.12
421	0.13
422	0.12
423	0.13
424	0.13
425	0.13
426	0.13
427	0.11
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.07
432	0.06
433	0.06
434	0.07
435	0.08
436	0.1
437	0.11
438	0.11
439	0.13
440	0.2
441	0.23
442	0.25
443	0.3
444	0.32
445	0.34
446	0.35
447	0.37
448	0.33
449	0.34
450	0.35
451	0.32
452	0.33
453	0.32
454	0.36
455	0.37
456	0.38
457	0.34
458	0.3
459	0.35
460	0.35
461	0.35
462	0.29
463	0.25
464	0.23
465	0.24
466	0.24
467	0.16
468	0.13
469	0.11
470	0.12
471	0.12
472	0.12
473	0.12
474	0.13
475	0.13
476	0.12
477	0.12
478	0.12
479	0.13
480	0.16
481	0.15
482	0.14
483	0.15
484	0.15
485	0.16
486	0.15
487	0.13
488	0.11
489	0.13
490	0.12
491	0.13
492	0.14
493	0.12
494	0.15
495	0.22
496	0.24
497	0.28
498	0.36
499	0.44
500	0.53
501	0.54
502	0.56
503	0.56
504	0.62
505	0.61
506	0.62
507	0.62
508	0.55
509	0.57
510	0.54
511	0.5
512	0.42
513	0.35
514	0.28
515	0.2
516	0.17
517	0.13
518	0.13
519	0.11
520	0.11
521	0.11
522	0.11
523	0.11
524	0.11
525	0.14
526	0.17
527	0.19
528	0.19
529	0.2
530	0.22
531	0.24
532	0.26
533	0.25
534	0.2
535	0.19
536	0.21
537	0.19
538	0.16
539	0.14
540	0.13
541	0.13
542	0.13
543	0.13
544	0.14
545	0.15
546	0.19
547	0.29
548	0.38
549	0.47
550	0.52
551	0.55
552	0.57
553	0.62
554	0.63
555	0.6
556	0.52
557	0.45
558	0.42
559	0.37
560	0.33
561	0.26
562	0.2
563	0.13
564	0.11
565	0.09
566	0.07
567	0.07
568	0.06
569	0.07
570	0.1
571	0.11
572	0.13
573	0.13
574	0.19
575	0.28
576	0.38
577	0.48
578	0.54
579	0.64
580	0.73
581	0.83
582	0.87
583	0.89
584	0.87
585	0.87
586	0.86
587	0.79
588	0.7
589	0.6
590	0.51
591	0.41
592	0.32
593	0.22
594	0.16
595	0.13
596	0.11
597	0.11
598	0.11
599	0.1
600	0.11
601	0.14
602	0.16
603	0.17
604	0.17
605	0.18
606	0.21
607	0.27
608	0.3
609	0.32
610	0.32
611	0.34
612	0.41
613	0.41
614	0.41
615	0.37
616	0.43
617	0.4
618	0.38
619	0.37
620	0.31
621	0.34
622	0.35
623	0.36
624	0.29
625	0.36
626	0.39
627	0.39
628	0.39
629	0.39
630	0.41
631	0.39
632	0.46
633	0.43
634	0.47
635	0.45
636	0.48
637	0.47
638	0.42
639	0.41
640	0.32
641	0.25
642	0.21
643	0.21
644	0.18
645	0.14
646	0.17
647	0.19
648	0.22
649	0.23
650	0.2
651	0.21
652	0.19
653	0.2
654	0.2
655	0.19
656	0.17
657	0.18

F8PP13

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer