Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0U6D4

Protein Details
Accession Q0U6D4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-41QQTTHTLRENQYRRLRKRRRGDVSHDSSSPHydrophilic
347-368NVNYTKRSKFCNERKQMEHHHRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-30RKRR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007224  TIF_Rrn11  
Gene Ontology GO:0070860  C:RNA polymerase I core factor complex  
GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
KEGG pno:SNOG_12680  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04090  RNA_pol_I_TF  
Amino Acid Sequences MQYFTTQLNSNQQTTHTLRENQYRRLRKRRRGDVSHDSSSPEPEATSKSASRDQSYASHASTEIAQLRVAGLLPDDESDVPPSPFPHAPVKAAEGRYGAGQLQEEIAKPPARLYAVDALYKNRPTNKQNEATSLRKTHLNVLSTLMHRCLLEGDYERAGRAWGMLLRTHVAGGHPVDPRNHGRWGVGAEILLRKAPNRIIDSNNMSNIDGQFREHDMFSEEGFDLAREYYERFIIQFPYRKLTPHSVDERTFYPAMFSLWVFEVCEKTRAQEDAVQTEELARAREIAERLDQLIASPPFDKQASLLHLRGHVSLWISTLLLGRSTDDEDWDMDTTSELEDSNSPTANVNYTKRSKFCNERKQMEHHHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.42
3 0.39
4 0.42
5 0.46
6 0.56
7 0.61
8 0.63
9 0.7
10 0.74
11 0.77
12 0.81
13 0.86
14 0.86
15 0.91
16 0.92
17 0.92
18 0.91
19 0.9
20 0.89
21 0.87
22 0.82
23 0.72
24 0.64
25 0.54
26 0.48
27 0.4
28 0.29
29 0.21
30 0.18
31 0.21
32 0.2
33 0.24
34 0.23
35 0.26
36 0.32
37 0.35
38 0.36
39 0.34
40 0.34
41 0.34
42 0.37
43 0.36
44 0.3
45 0.27
46 0.24
47 0.23
48 0.21
49 0.21
50 0.19
51 0.16
52 0.15
53 0.14
54 0.14
55 0.13
56 0.13
57 0.09
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.09
65 0.12
66 0.13
67 0.13
68 0.14
69 0.14
70 0.18
71 0.18
72 0.21
73 0.26
74 0.26
75 0.28
76 0.29
77 0.32
78 0.34
79 0.34
80 0.32
81 0.25
82 0.23
83 0.21
84 0.21
85 0.16
86 0.11
87 0.11
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.11
93 0.14
94 0.15
95 0.14
96 0.15
97 0.16
98 0.16
99 0.16
100 0.18
101 0.21
102 0.21
103 0.25
104 0.25
105 0.25
106 0.29
107 0.31
108 0.31
109 0.29
110 0.34
111 0.35
112 0.42
113 0.47
114 0.5
115 0.49
116 0.53
117 0.53
118 0.51
119 0.52
120 0.47
121 0.4
122 0.36
123 0.35
124 0.36
125 0.34
126 0.32
127 0.27
128 0.28
129 0.3
130 0.28
131 0.28
132 0.21
133 0.17
134 0.15
135 0.15
136 0.12
137 0.09
138 0.1
139 0.11
140 0.13
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.13
145 0.12
146 0.1
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.12
161 0.13
162 0.15
163 0.16
164 0.19
165 0.23
166 0.24
167 0.24
168 0.2
169 0.19
170 0.19
171 0.19
172 0.17
173 0.13
174 0.1
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.09
182 0.11
183 0.14
184 0.18
185 0.21
186 0.23
187 0.28
188 0.33
189 0.33
190 0.32
191 0.28
192 0.24
193 0.22
194 0.2
195 0.17
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.12
200 0.13
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.12
205 0.11
206 0.12
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.07
212 0.06
213 0.07
214 0.05
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.14
222 0.18
223 0.24
224 0.25
225 0.29
226 0.29
227 0.3
228 0.33
229 0.36
230 0.36
231 0.36
232 0.41
233 0.41
234 0.42
235 0.43
236 0.4
237 0.37
238 0.33
239 0.26
240 0.2
241 0.16
242 0.15
243 0.14
244 0.12
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.1
249 0.1
250 0.13
251 0.13
252 0.16
253 0.14
254 0.15
255 0.18
256 0.19
257 0.2
258 0.21
259 0.23
260 0.24
261 0.26
262 0.24
263 0.21
264 0.21
265 0.21
266 0.17
267 0.15
268 0.12
269 0.1
270 0.11
271 0.15
272 0.15
273 0.15
274 0.17
275 0.17
276 0.19
277 0.18
278 0.17
279 0.14
280 0.2
281 0.19
282 0.17
283 0.17
284 0.16
285 0.18
286 0.19
287 0.19
288 0.12
289 0.17
290 0.21
291 0.26
292 0.27
293 0.27
294 0.29
295 0.31
296 0.3
297 0.25
298 0.22
299 0.18
300 0.17
301 0.16
302 0.13
303 0.12
304 0.12
305 0.14
306 0.12
307 0.12
308 0.11
309 0.12
310 0.13
311 0.16
312 0.16
313 0.15
314 0.16
315 0.16
316 0.18
317 0.17
318 0.16
319 0.13
320 0.13
321 0.12
322 0.11
323 0.1
324 0.08
325 0.09
326 0.1
327 0.14
328 0.16
329 0.16
330 0.16
331 0.17
332 0.18
333 0.22
334 0.26
335 0.27
336 0.34
337 0.41
338 0.48
339 0.49
340 0.55
341 0.59
342 0.64
343 0.7
344 0.73
345 0.76
346 0.78
347 0.81
348 0.83