FuNGI

C4R848

Protein Details

Accession

C4R848

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
122-148	ARLVRRANFFRKKTKQVRMVDDQKRKI	Hydrophilic
486-517	DLISTLKHKIHKHPDNKERLKNYVKKLCRFDQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	ppa:PAS_chr4_0518 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSASGNGKLQPDTKIKQEAAVSEVTLKSCTREEIEDVRYHILKFQSQSKVNFNKFTQPVRLHRKDPTNLQFQLTRKEIDERRASKKADKLANEESLADSNKGTGSSEQHGADMSVVAPDGGARLVRRANFFRKKTKQVRMVDDQKRKIRYEEYYPWVLEDYDGENTFVGNYEAGNPDTYVLLVFDNDGFKMIPAEKVYKFTPRNKYATLTLEEAEAKMEKNSKVPRWLMKHMKEDNAAVSNDIRFQRMRTVVGGNKSSKNVEDDDLDFDEEFADDEEAPIMDGNEQENKESEKRMRLEMSRANNVGDLLAEDNDNDLDDLFESRKVNQEGKKLKKVLVKQEKNDIYESDDEENPYLSKSESEEEEEQQEPDVKKEGTEGFPSIKTSTASPLGRKSLSPSLGPKIRVASYKQGYITLKAARSVLKEFPEGEWNPYIVKREIGYDGEIEENSPSKRVKLENSSDSEYGIITEKDVVDIIMEKPLKLKDLISTLKHKIHKHPDNKERLKNYVKKLCRFDQGLLYLKDSV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.45
3	0.47
4	0.47
5	0.42
6	0.37
7	0.35
8	0.29
9	0.25
10	0.26
11	0.22
12	0.21
13	0.2
14	0.19
15	0.19
16	0.21
17	0.2
18	0.22
19	0.27
20	0.32
21	0.37
22	0.38
23	0.39
24	0.4
25	0.39
26	0.36
27	0.35
28	0.32
29	0.31
30	0.31
31	0.37
32	0.41
33	0.45
34	0.5
35	0.56
36	0.62
37	0.62
38	0.66
39	0.59
40	0.6
41	0.6
42	0.6
43	0.59
44	0.57
45	0.62
46	0.66
47	0.71
48	0.65
49	0.68
50	0.72
51	0.69
52	0.72
53	0.7
54	0.68
55	0.63
56	0.62
57	0.59
58	0.53
59	0.54
60	0.47
61	0.41
62	0.34
63	0.41
64	0.42
65	0.45
66	0.52
67	0.5
68	0.55
69	0.6
70	0.62
71	0.6
72	0.63
73	0.63
74	0.61
75	0.59
76	0.58
77	0.57
78	0.57
79	0.51
80	0.45
81	0.38
82	0.33
83	0.31
84	0.24
85	0.18
86	0.14
87	0.14
88	0.13
89	0.13
90	0.12
91	0.14
92	0.17
93	0.21
94	0.21
95	0.2
96	0.2
97	0.19
98	0.17
99	0.13
100	0.1
101	0.06
102	0.06
103	0.05
104	0.05
105	0.04
106	0.04
107	0.05
108	0.06
109	0.06
110	0.09
111	0.13
112	0.16
113	0.21
114	0.27
115	0.37
116	0.46
117	0.52
118	0.6
119	0.65
120	0.73
121	0.78
122	0.81
123	0.8
124	0.79
125	0.8
126	0.8
127	0.82
128	0.81
129	0.8
130	0.79
131	0.76
132	0.74
133	0.67
134	0.61
135	0.56
136	0.51
137	0.51
138	0.5
139	0.49
140	0.48
141	0.46
142	0.42
143	0.37
144	0.32
145	0.23
146	0.17
147	0.13
148	0.12
149	0.13
150	0.12
151	0.11
152	0.11
153	0.11
154	0.1
155	0.08
156	0.05
157	0.05
158	0.07
159	0.09
160	0.09
161	0.1
162	0.09
163	0.09
164	0.09
165	0.09
166	0.07
167	0.06
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.07
175	0.06
176	0.06
177	0.08
178	0.08
179	0.09
180	0.11
181	0.16
182	0.16
183	0.19
184	0.2
185	0.27
186	0.33
187	0.39
188	0.47
189	0.48
190	0.52
191	0.51
192	0.53
193	0.48
194	0.46
195	0.41
196	0.33
197	0.27
198	0.23
199	0.21
200	0.19
201	0.15
202	0.12
203	0.09
204	0.09
205	0.12
206	0.12
207	0.18
208	0.24
209	0.26
210	0.32
211	0.35
212	0.41
213	0.43
214	0.52
215	0.55
216	0.55
217	0.61
218	0.58
219	0.58
220	0.52
221	0.46
222	0.4
223	0.33
224	0.27
225	0.19
226	0.16
227	0.13
228	0.16
229	0.15
230	0.15
231	0.12
232	0.13
233	0.18
234	0.19
235	0.19
236	0.17
237	0.21
238	0.22
239	0.26
240	0.29
241	0.27
242	0.27
243	0.27
244	0.26
245	0.22
246	0.21
247	0.19
248	0.16
249	0.15
250	0.14
251	0.15
252	0.15
253	0.15
254	0.12
255	0.11
256	0.1
257	0.08
258	0.07
259	0.05
260	0.05
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.05
271	0.09
272	0.09
273	0.1
274	0.11
275	0.13
276	0.14
277	0.17
278	0.2
279	0.22
280	0.24
281	0.27
282	0.3
283	0.29
284	0.34
285	0.37
286	0.39
287	0.37
288	0.36
289	0.33
290	0.3
291	0.28
292	0.22
293	0.15
294	0.1
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.05
307	0.06
308	0.08
309	0.09
310	0.1
311	0.16
312	0.19
313	0.24
314	0.27
315	0.36
316	0.44
317	0.51
318	0.59
319	0.55
320	0.57
321	0.58
322	0.6
323	0.62
324	0.63
325	0.63
326	0.58
327	0.66
328	0.64
329	0.61
330	0.55
331	0.45
332	0.37
333	0.32
334	0.31
335	0.24
336	0.21
337	0.19
338	0.18
339	0.18
340	0.15
341	0.13
342	0.11
343	0.08
344	0.08
345	0.09
346	0.11
347	0.12
348	0.17
349	0.19
350	0.2
351	0.23
352	0.23
353	0.21
354	0.2
355	0.24
356	0.19
357	0.18
358	0.21
359	0.17
360	0.17
361	0.2
362	0.23
363	0.2
364	0.22
365	0.22
366	0.21
367	0.22
368	0.24
369	0.21
370	0.19
371	0.17
372	0.16
373	0.18
374	0.22
375	0.24
376	0.25
377	0.29
378	0.32
379	0.32
380	0.31
381	0.33
382	0.33
383	0.33
384	0.33
385	0.33
386	0.37
387	0.41
388	0.42
389	0.38
390	0.35
391	0.35
392	0.36
393	0.36
394	0.38
395	0.36
396	0.39
397	0.37
398	0.39
399	0.38
400	0.37
401	0.37
402	0.32
403	0.3
404	0.28
405	0.29
406	0.26
407	0.27
408	0.29
409	0.29
410	0.26
411	0.27
412	0.27
413	0.27
414	0.33
415	0.31
416	0.31
417	0.28
418	0.26
419	0.26
420	0.27
421	0.29
422	0.22
423	0.23
424	0.19
425	0.21
426	0.23
427	0.23
428	0.23
429	0.19
430	0.19
431	0.19
432	0.18
433	0.15
434	0.14
435	0.15
436	0.14
437	0.17
438	0.16
439	0.16
440	0.21
441	0.25
442	0.32
443	0.38
444	0.46
445	0.51
446	0.56
447	0.59
448	0.55
449	0.51
450	0.43
451	0.33
452	0.26
453	0.21
454	0.15
455	0.1
456	0.12
457	0.12
458	0.12
459	0.12
460	0.11
461	0.09
462	0.11
463	0.11
464	0.16
465	0.17
466	0.16
467	0.2
468	0.21
469	0.23
470	0.22
471	0.23
472	0.2
473	0.29
474	0.35
475	0.37
476	0.43
477	0.47
478	0.54
479	0.59
480	0.6
481	0.62
482	0.67
483	0.71
484	0.74
485	0.79
486	0.81
487	0.86
488	0.9
489	0.9
490	0.85
491	0.84
492	0.84
493	0.82
494	0.82
495	0.81
496	0.8
497	0.79
498	0.81
499	0.79
500	0.77
501	0.73
502	0.66
503	0.65
504	0.62
505	0.62
506	0.56

C4R848

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer