Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F8PJY1

Protein Details
Accession F8PJY1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-93QNPAESTSKRHRGKSRKKQNTRVTKSASKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-95GLSKKRKAQNQNPAESTSKRHRGKSRKKQNTRVTKSASKSP
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 12, mito_nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
CDD cd15517  PHD_TCF19_like  
Amino Acid Sequences MSSRGSPMVYPKDLPLSPLSSLSDLASKLNSDPGPGPSIEELVLMAKKPVKATQGLSKKRKAQNQNPAESTSKRHRGKSRKKQNTRVTKSASKSPRKLCCAWPTIPRKDSEFNRQFIQCDGCKAWYHYGCVGIVVGDERLERDETFLCPPCSSKNDKGLLKPSERCRRPDCGYAEQGLDPDEYFVERIVGRKQVGRQQFIWLVKWEGYPISMAEWISGDAMQDHIKLAEQFIDDALAEGIDLVPEDTALLMEARRGGWVT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.33
3 0.29
4 0.27
5 0.28
6 0.28
7 0.22
8 0.23
9 0.21
10 0.2
11 0.17
12 0.17
13 0.15
14 0.14
15 0.14
16 0.19
17 0.18
18 0.18
19 0.2
20 0.21
21 0.23
22 0.22
23 0.24
24 0.18
25 0.19
26 0.16
27 0.14
28 0.12
29 0.12
30 0.13
31 0.1
32 0.12
33 0.14
34 0.15
35 0.18
36 0.21
37 0.21
38 0.24
39 0.28
40 0.36
41 0.43
42 0.52
43 0.57
44 0.61
45 0.67
46 0.71
47 0.76
48 0.77
49 0.76
50 0.77
51 0.79
52 0.8
53 0.73
54 0.69
55 0.64
56 0.55
57 0.51
58 0.5
59 0.5
60 0.47
61 0.53
62 0.59
63 0.66
64 0.76
65 0.81
66 0.83
67 0.84
68 0.9
69 0.92
70 0.93
71 0.93
72 0.9
73 0.87
74 0.82
75 0.78
76 0.72
77 0.7
78 0.7
79 0.67
80 0.67
81 0.67
82 0.68
83 0.66
84 0.66
85 0.64
86 0.62
87 0.59
88 0.54
89 0.55
90 0.55
91 0.57
92 0.55
93 0.5
94 0.46
95 0.48
96 0.48
97 0.5
98 0.47
99 0.42
100 0.42
101 0.42
102 0.38
103 0.33
104 0.33
105 0.23
106 0.2
107 0.19
108 0.18
109 0.18
110 0.19
111 0.23
112 0.2
113 0.21
114 0.19
115 0.19
116 0.17
117 0.16
118 0.14
119 0.08
120 0.07
121 0.05
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.08
130 0.09
131 0.1
132 0.14
133 0.17
134 0.17
135 0.16
136 0.17
137 0.19
138 0.22
139 0.28
140 0.29
141 0.33
142 0.39
143 0.42
144 0.45
145 0.49
146 0.5
147 0.49
148 0.51
149 0.53
150 0.56
151 0.57
152 0.59
153 0.55
154 0.58
155 0.57
156 0.58
157 0.55
158 0.51
159 0.51
160 0.47
161 0.44
162 0.36
163 0.32
164 0.25
165 0.19
166 0.12
167 0.1
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.1
175 0.12
176 0.16
177 0.17
178 0.2
179 0.25
180 0.31
181 0.37
182 0.39
183 0.38
184 0.39
185 0.45
186 0.43
187 0.41
188 0.36
189 0.31
190 0.28
191 0.28
192 0.23
193 0.17
194 0.15
195 0.13
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.13
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.04
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.07
239 0.09
240 0.09