Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q0UB85

Protein Details
Accession Q0UB85    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-216FSPNSSPKPKRRTSGSKRAPPAATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
200-210KPKRRTSGSKR
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0019905  F:syntaxin binding  
GO:0006896  P:Golgi to vacuole transport  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
KEGG pno:SNOG_10979  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07928  Vps54  
Amino Acid Sequences MSSPRSPRRSTESLDILSPAPPQNQYPFPQQNDWVSRPSSTGGRYQPRRGSTASSIHSVGGVLDSGFKNSMGAVREQNQNAISTLLQPPIVRTGMLPHTAAQVSAGQRPPSAKDIPPVTLANVPHVEPSAFNPYLSQVGGLYEAFQRAKAEAEAEAAQPVRRGSKKSDRAESLERGIHVSSPAVTPQLSGAAFSPNSSPKPKRRTSGSKRAPPAATPLSTIPTVYFDENFHLENPRTFDIVSERSEVVRPIRTKSDDVDFTNGSLDAPQVQGRKALATNAILQEKLSWYMDTVEVHLISAISSASTSFFAALGSLRELQSEASESVARIKGLREDLKRLDEQMAIGGLKVVGMKRRRQNLRRLTNSVDQLQAVIVGLSHCDEVVNKGELEMAMTRLDAVERLITGALDTTDPAYVSWLNASLPPDIIDLRGLRAMEGVFDGIQELKFRVGRGFEARFVDTLLTDLREHVKSVPSQHTLERWVTASSKARGIQQKAKSTLPAYLNTSEKLRSDLRVNLYGLSGAQFTNQASASFRDAIMKEMKTIIRKYLPSSSDDDAESMTSVSTRGGRGHSQQDKNSILARNLRAMDPADAEEFFTNIFTDVGEVLRRLSTLVKVLLDVTSGVSTPPLSAGGLRSPRSPYMHNIDSYMGNGTPAPASNDLQMELMQALDMSSLLGQAVDAAQTQITKLLKVRSEATANLPLERFLRYFNLCRLFADECEAVSGRSGAALKSIVNNHITEFVPKFGDFEKQELAKAMDSDRWEPKDFESDDTEVLARILKGMESDPPSWSDAGDLLRTIEVPATNGDSTATNGAAEEKPKEKSKTTTPAIVDEEKYTISSSSTFVLRGIERFEILLSAIPSMTSEVSSSLCDYIKLFNSRLCQLILGAGAMHSAGLKNINTKHLAIASQTLSFVIAILPYIRECARRRIANAANKSAIGEFDNVKRLLQDQQVSIHDKLTDILSGRATVHMRSLKKVEWDTEAEANKDVSSSMESLTKDTVTMHKVINKYLSEMQVRMIMGPVFESYREQVGRVIQEAAVKTPEGKARLLRESKLFDAKLGPIDGAGNVGAYLIGLVVSKQVAQPAQAKPKTEVEKSEEKPEAAENAAQKSTADAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.49
3 0.41
4 0.35
5 0.34
6 0.28
7 0.23
8 0.23
9 0.26
10 0.3
11 0.35
12 0.38
13 0.44
14 0.5
15 0.52
16 0.55
17 0.56
18 0.59
19 0.61
20 0.6
21 0.55
22 0.48
23 0.43
24 0.4
25 0.39
26 0.35
27 0.29
28 0.34
29 0.38
30 0.47
31 0.53
32 0.6
33 0.65
34 0.64
35 0.66
36 0.6
37 0.58
38 0.54
39 0.56
40 0.5
41 0.46
42 0.42
43 0.38
44 0.36
45 0.29
46 0.22
47 0.14
48 0.11
49 0.07
50 0.11
51 0.11
52 0.13
53 0.14
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.17
58 0.15
59 0.18
60 0.22
61 0.27
62 0.34
63 0.35
64 0.38
65 0.35
66 0.34
67 0.31
68 0.27
69 0.22
70 0.19
71 0.21
72 0.19
73 0.19
74 0.18
75 0.19
76 0.23
77 0.23
78 0.19
79 0.16
80 0.21
81 0.24
82 0.26
83 0.25
84 0.21
85 0.25
86 0.25
87 0.25
88 0.2
89 0.2
90 0.2
91 0.25
92 0.29
93 0.25
94 0.27
95 0.3
96 0.32
97 0.33
98 0.35
99 0.31
100 0.34
101 0.37
102 0.37
103 0.39
104 0.36
105 0.33
106 0.33
107 0.31
108 0.29
109 0.27
110 0.25
111 0.22
112 0.22
113 0.2
114 0.16
115 0.2
116 0.23
117 0.22
118 0.21
119 0.21
120 0.21
121 0.23
122 0.22
123 0.18
124 0.1
125 0.1
126 0.12
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.14
131 0.14
132 0.15
133 0.15
134 0.14
135 0.16
136 0.15
137 0.15
138 0.12
139 0.15
140 0.16
141 0.15
142 0.17
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.17
147 0.22
148 0.24
149 0.27
150 0.33
151 0.44
152 0.53
153 0.59
154 0.67
155 0.64
156 0.68
157 0.71
158 0.67
159 0.61
160 0.54
161 0.47
162 0.4
163 0.35
164 0.29
165 0.23
166 0.19
167 0.15
168 0.12
169 0.13
170 0.12
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.14
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.15
179 0.15
180 0.15
181 0.18
182 0.19
183 0.23
184 0.31
185 0.38
186 0.43
187 0.53
188 0.59
189 0.62
190 0.67
191 0.75
192 0.77
193 0.81
194 0.82
195 0.82
196 0.81
197 0.81
198 0.73
199 0.63
200 0.6
201 0.54
202 0.45
203 0.38
204 0.33
205 0.29
206 0.27
207 0.26
208 0.18
209 0.16
210 0.17
211 0.16
212 0.16
213 0.14
214 0.17
215 0.18
216 0.19
217 0.17
218 0.2
219 0.2
220 0.21
221 0.25
222 0.24
223 0.23
224 0.22
225 0.22
226 0.23
227 0.25
228 0.25
229 0.23
230 0.22
231 0.23
232 0.24
233 0.25
234 0.22
235 0.26
236 0.26
237 0.27
238 0.33
239 0.36
240 0.37
241 0.37
242 0.41
243 0.38
244 0.39
245 0.39
246 0.33
247 0.29
248 0.29
249 0.25
250 0.18
251 0.14
252 0.11
253 0.08
254 0.09
255 0.12
256 0.13
257 0.13
258 0.15
259 0.15
260 0.18
261 0.17
262 0.18
263 0.17
264 0.17
265 0.21
266 0.22
267 0.23
268 0.2
269 0.2
270 0.19
271 0.18
272 0.18
273 0.15
274 0.11
275 0.11
276 0.13
277 0.15
278 0.14
279 0.14
280 0.13
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.1
285 0.08
286 0.08
287 0.06
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.05
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.08
301 0.1
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.14
313 0.15
314 0.15
315 0.13
316 0.14
317 0.16
318 0.22
319 0.29
320 0.28
321 0.33
322 0.36
323 0.4
324 0.4
325 0.38
326 0.34
327 0.27
328 0.24
329 0.19
330 0.17
331 0.12
332 0.11
333 0.09
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.13
339 0.18
340 0.25
341 0.32
342 0.42
343 0.52
344 0.57
345 0.67
346 0.71
347 0.77
348 0.77
349 0.75
350 0.72
351 0.68
352 0.65
353 0.57
354 0.47
355 0.36
356 0.29
357 0.23
358 0.17
359 0.11
360 0.07
361 0.05
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.05
369 0.07
370 0.1
371 0.11
372 0.1
373 0.1
374 0.11
375 0.11
376 0.12
377 0.11
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.07
401 0.06
402 0.06
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.09
407 0.1
408 0.09
409 0.09
410 0.09
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.09
416 0.09
417 0.11
418 0.1
419 0.09
420 0.1
421 0.09
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.06
431 0.06
432 0.08
433 0.09
434 0.09
435 0.1
436 0.11
437 0.13
438 0.18
439 0.2
440 0.21
441 0.22
442 0.22
443 0.21
444 0.2
445 0.18
446 0.12
447 0.11
448 0.09
449 0.08
450 0.07
451 0.08
452 0.11
453 0.11
454 0.12
455 0.13
456 0.15
457 0.15
458 0.2
459 0.25
460 0.25
461 0.26
462 0.27
463 0.27
464 0.28
465 0.27
466 0.23
467 0.18
468 0.16
469 0.16
470 0.18
471 0.21
472 0.19
473 0.22
474 0.22
475 0.27
476 0.31
477 0.35
478 0.4
479 0.42
480 0.47
481 0.47
482 0.47
483 0.43
484 0.38
485 0.39
486 0.32
487 0.28
488 0.24
489 0.24
490 0.24
491 0.23
492 0.24
493 0.19
494 0.17
495 0.18
496 0.16
497 0.15
498 0.17
499 0.21
500 0.23
501 0.26
502 0.26
503 0.22
504 0.21
505 0.19
506 0.16
507 0.12
508 0.09
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.07
515 0.07
516 0.08
517 0.09
518 0.11
519 0.11
520 0.11
521 0.12
522 0.12
523 0.15
524 0.17
525 0.16
526 0.15
527 0.17
528 0.19
529 0.19
530 0.2
531 0.21
532 0.21
533 0.22
534 0.24
535 0.28
536 0.27
537 0.26
538 0.29
539 0.27
540 0.24
541 0.23
542 0.21
543 0.14
544 0.13
545 0.11
546 0.07
547 0.05
548 0.04
549 0.04
550 0.04
551 0.05
552 0.06
553 0.07
554 0.09
555 0.11
556 0.15
557 0.23
558 0.31
559 0.34
560 0.35
561 0.39
562 0.38
563 0.38
564 0.38
565 0.31
566 0.25
567 0.26
568 0.25
569 0.24
570 0.23
571 0.22
572 0.2
573 0.19
574 0.17
575 0.13
576 0.13
577 0.1
578 0.09
579 0.1
580 0.08
581 0.08
582 0.07
583 0.06
584 0.05
585 0.05
586 0.05
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.05
594 0.06
595 0.06
596 0.06
597 0.07
598 0.07
599 0.09
600 0.1
601 0.09
602 0.09
603 0.1
604 0.09
605 0.08
606 0.08
607 0.06
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.05
613 0.04
614 0.05
615 0.04
616 0.04
617 0.05
618 0.06
619 0.1
620 0.14
621 0.15
622 0.17
623 0.18
624 0.21
625 0.23
626 0.24
627 0.24
628 0.27
629 0.29
630 0.28
631 0.27
632 0.26
633 0.24
634 0.22
635 0.19
636 0.12
637 0.09
638 0.08
639 0.08
640 0.06
641 0.07
642 0.08
643 0.09
644 0.1
645 0.11
646 0.11
647 0.11
648 0.11
649 0.11
650 0.09
651 0.07
652 0.06
653 0.05
654 0.04
655 0.04
656 0.03
657 0.03
658 0.03
659 0.03
660 0.03
661 0.03
662 0.03
663 0.03
664 0.03
665 0.03
666 0.03
667 0.03
668 0.03
669 0.04
670 0.04
671 0.04
672 0.08
673 0.08
674 0.09
675 0.11
676 0.16
677 0.17
678 0.19
679 0.22
680 0.21
681 0.23
682 0.23
683 0.25
684 0.28
685 0.26
686 0.26
687 0.23
688 0.21
689 0.2
690 0.21
691 0.17
692 0.11
693 0.15
694 0.17
695 0.19
696 0.24
697 0.29
698 0.27
699 0.27
700 0.29
701 0.27
702 0.24
703 0.26
704 0.2
705 0.14
706 0.16
707 0.16
708 0.12
709 0.11
710 0.11
711 0.06
712 0.07
713 0.08
714 0.06
715 0.07
716 0.07
717 0.08
718 0.11
719 0.13
720 0.14
721 0.15
722 0.15
723 0.15
724 0.17
725 0.17
726 0.17
727 0.16
728 0.15
729 0.15
730 0.15
731 0.16
732 0.13
733 0.2
734 0.18
735 0.19
736 0.22
737 0.21
738 0.22
739 0.22
740 0.22
741 0.17
742 0.17
743 0.16
744 0.15
745 0.16
746 0.2
747 0.24
748 0.27
749 0.28
750 0.28
751 0.28
752 0.33
753 0.32
754 0.31
755 0.29
756 0.27
757 0.25
758 0.24
759 0.23
760 0.15
761 0.14
762 0.12
763 0.08
764 0.07
765 0.07
766 0.06
767 0.07
768 0.07
769 0.12
770 0.15
771 0.16
772 0.17
773 0.18
774 0.2
775 0.19
776 0.18
777 0.14
778 0.12
779 0.12
780 0.12
781 0.1
782 0.09
783 0.09
784 0.1
785 0.09
786 0.09
787 0.07
788 0.08
789 0.09
790 0.11
791 0.11
792 0.11
793 0.11
794 0.1
795 0.11
796 0.12
797 0.11
798 0.07
799 0.08
800 0.11
801 0.11
802 0.13
803 0.15
804 0.17
805 0.21
806 0.27
807 0.31
808 0.32
809 0.35
810 0.43
811 0.49
812 0.5
813 0.52
814 0.47
815 0.48
816 0.49
817 0.47
818 0.4
819 0.31
820 0.29
821 0.22
822 0.21
823 0.17
824 0.13
825 0.1
826 0.1
827 0.1
828 0.11
829 0.11
830 0.11
831 0.11
832 0.13
833 0.14
834 0.14
835 0.16
836 0.15
837 0.14
838 0.14
839 0.13
840 0.11
841 0.1
842 0.11
843 0.09
844 0.08
845 0.08
846 0.07
847 0.08
848 0.08
849 0.08
850 0.07
851 0.06
852 0.07
853 0.08
854 0.09
855 0.1
856 0.11
857 0.1
858 0.11
859 0.11
860 0.14
861 0.2
862 0.23
863 0.23
864 0.24
865 0.28
866 0.3
867 0.3
868 0.27
869 0.21
870 0.18
871 0.18
872 0.15
873 0.11
874 0.09
875 0.07
876 0.06
877 0.06
878 0.05
879 0.04
880 0.04
881 0.05
882 0.08
883 0.08
884 0.14
885 0.17
886 0.21
887 0.23
888 0.23
889 0.25
890 0.24
891 0.24
892 0.2
893 0.22
894 0.19
895 0.18
896 0.17
897 0.15
898 0.13
899 0.12
900 0.11
901 0.07
902 0.05
903 0.05
904 0.06
905 0.07
906 0.06
907 0.09
908 0.1
909 0.17
910 0.2
911 0.29
912 0.37
913 0.41
914 0.43
915 0.5
916 0.57
917 0.6
918 0.64
919 0.61
920 0.54
921 0.5
922 0.48
923 0.39
924 0.32
925 0.24
926 0.19
927 0.16
928 0.18
929 0.24
930 0.23
931 0.23
932 0.23
933 0.23
934 0.26
935 0.29
936 0.29
937 0.25
938 0.3
939 0.35
940 0.39
941 0.38
942 0.34
943 0.28
944 0.25
945 0.24
946 0.2
947 0.17
948 0.14
949 0.15
950 0.14
951 0.15
952 0.15
953 0.18
954 0.19
955 0.17
956 0.22
957 0.27
958 0.28
959 0.32
960 0.36
961 0.35
962 0.41
963 0.44
964 0.4
965 0.38
966 0.41
967 0.4
968 0.42
969 0.41
970 0.35
971 0.33
972 0.31
973 0.26
974 0.22
975 0.18
976 0.12
977 0.12
978 0.12
979 0.12
980 0.15
981 0.16
982 0.18
983 0.19
984 0.18
985 0.16
986 0.17
987 0.21
988 0.2
989 0.22
990 0.24
991 0.28
992 0.29
993 0.32
994 0.37
995 0.33
996 0.34
997 0.36
998 0.39
999 0.37
1000 0.35
1001 0.34
1002 0.31
1003 0.31
1004 0.26
1005 0.23
1006 0.17
1007 0.14
1008 0.15
1009 0.15
1010 0.11
1011 0.12
1012 0.14
1013 0.14
1014 0.2
1015 0.21
1016 0.2
1017 0.22
1018 0.25
1019 0.27
1020 0.27
1021 0.26
1022 0.21
1023 0.25
1024 0.25
1025 0.25
1026 0.22
1027 0.19
1028 0.19
1029 0.22
1030 0.26
1031 0.24
1032 0.26
1033 0.3
1034 0.35
1035 0.44
1036 0.48
1037 0.47
1038 0.49
1039 0.52
1040 0.54
1041 0.56
1042 0.5
1043 0.42
1044 0.41
1045 0.4
1046 0.37
1047 0.32
1048 0.27
1049 0.19
1050 0.19
1051 0.18
1052 0.15
1053 0.12
1054 0.08
1055 0.07
1056 0.07
1057 0.06
1058 0.05
1059 0.05
1060 0.03
1061 0.04
1062 0.03
1063 0.04
1064 0.05
1065 0.06
1066 0.07
1067 0.08
1068 0.12
1069 0.13
1070 0.17
1071 0.24
1072 0.31
1073 0.42
1074 0.44
1075 0.47
1076 0.47
1077 0.56
1078 0.59
1079 0.56
1080 0.54
1081 0.51
1082 0.58
1083 0.58
1084 0.63
1085 0.58
1086 0.51
1087 0.48
1088 0.44
1089 0.4
1090 0.32
1091 0.33
1092 0.28
1093 0.29
1094 0.29
1095 0.27
1096 0.24