FuNGI

F8PTM2

Protein Details

Accession

F8PTM2

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
270-388	SSSEDERAKKRKRKSSEKKSRKRKRKRKDDTESDSDSEKESSGDERPKKKSKKRGKVEANEDSDEDDTREKKKKKKRKAKEDSDDSDDDSDDSDAKRSKKKKKKKSRKKAVSSEDESDT	Basic
393-418	SEQDTRRRSSKSKSTRKRSATPQYDL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
276-297	RAKKRKRKSSEKKSRKRKRKRK
314-325	ERPKKKSKKRGK
338-349	REKKKKKKRKAK
365-378	KRSKKKKKKKSRKK
402-408	SKSKSTR

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSGRKLNPQELKLHQAALSNTDKMLTSKEAEKLVPDAGARTAAVNFLLGTGMLKVLSNSAGVISFRAVMKKEIEVKKDMTGEEAMVLSHIQVSANEGIWTKHLKAKTELHQTVIDRCLKSLVQKQLVKSIKAVRHPTRKIYMLAHLEPSVELTGGPWYTDNELDTEFIKLLSTACLHYIRDRSFPKSKKDRSAQDQPLYAIGAAPAYPNALQIQHFLSKSKITETQLNVEHVEMLLNVLVLDGEVEKIPAFGAGMWDANVDEDEDENSGSSSEDERAKKRKRKSSEKKSRKRKRKRKDDTESDSDSEKESSGDERPKKKSKKRGKVEANEDSDEDDTREKKKKKKRKAKEDSDDSDDDSDDSDAKRSKKKKKKKSRKKAVSSEDESDTASSESEQDTRRRSSKSKSTRKRSATPQYDLNAGNSGGAFSYRAVRQERVALGWSQAPCGSCPVFDFCKEKGPTNPQECTYYEEWLRNAAIAIE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.41
3	0.38
4	0.37
5	0.35
6	0.29
7	0.27
8	0.25
9	0.25
10	0.21
11	0.24
12	0.21
13	0.2
14	0.24
15	0.28
16	0.3
17	0.3
18	0.31
19	0.29
20	0.27
21	0.25
22	0.21
23	0.18
24	0.16
25	0.17
26	0.15
27	0.14
28	0.13
29	0.12
30	0.11
31	0.1
32	0.09
33	0.08
34	0.08
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.06
39	0.06
40	0.06
41	0.06
42	0.07
43	0.08
44	0.08
45	0.07
46	0.07
47	0.09
48	0.09
49	0.09
50	0.09
51	0.11
52	0.12
53	0.15
54	0.16
55	0.17
56	0.19
57	0.24
58	0.33
59	0.37
60	0.4
61	0.41
62	0.42
63	0.44
64	0.45
65	0.4
66	0.33
67	0.27
68	0.24
69	0.2
70	0.18
71	0.13
72	0.1
73	0.1
74	0.07
75	0.07
76	0.07
77	0.06
78	0.05
79	0.09
80	0.1
81	0.11
82	0.12
83	0.12
84	0.12
85	0.15
86	0.18
87	0.17
88	0.21
89	0.23
90	0.25
91	0.31
92	0.38
93	0.44
94	0.52
95	0.51
96	0.49
97	0.51
98	0.49
99	0.47
100	0.46
101	0.43
102	0.32
103	0.31
104	0.31
105	0.27
106	0.31
107	0.35
108	0.37
109	0.4
110	0.43
111	0.44
112	0.51
113	0.55
114	0.5
115	0.46
116	0.46
117	0.42
118	0.47
119	0.55
120	0.54
121	0.6
122	0.63
123	0.65
124	0.62
125	0.6
126	0.56
127	0.49
128	0.48
129	0.43
130	0.41
131	0.37
132	0.31
133	0.28
134	0.25
135	0.23
136	0.16
137	0.1
138	0.08
139	0.06
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.07
144	0.08
145	0.09
146	0.1
147	0.1
148	0.09
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.07
157	0.06
158	0.07
159	0.08
160	0.07
161	0.1
162	0.11
163	0.12
164	0.16
165	0.21
166	0.21
167	0.28
168	0.3
169	0.35
170	0.42
171	0.47
172	0.54
173	0.59
174	0.64
175	0.66
176	0.71
177	0.73
178	0.71
179	0.77
180	0.75
181	0.68
182	0.63
183	0.54
184	0.46
185	0.38
186	0.3
187	0.19
188	0.11
189	0.07
190	0.05
191	0.05
192	0.04
193	0.04
194	0.05
195	0.05
196	0.06
197	0.07
198	0.07
199	0.08
200	0.11
201	0.14
202	0.14
203	0.14
204	0.15
205	0.16
206	0.16
207	0.17
208	0.19
209	0.18
210	0.23
211	0.24
212	0.28
213	0.28
214	0.29
215	0.27
216	0.22
217	0.2
218	0.14
219	0.13
220	0.07
221	0.05
222	0.04
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.02
228	0.03
229	0.02
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.03
237	0.03
238	0.03
239	0.04
240	0.04
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.06
259	0.08
260	0.14
261	0.17
262	0.22
263	0.32
264	0.41
265	0.49
266	0.57
267	0.64
268	0.68
269	0.77
270	0.83
271	0.85
272	0.87
273	0.91
274	0.92
275	0.94
276	0.95
277	0.95
278	0.95
279	0.95
280	0.94
281	0.95
282	0.95
283	0.95
284	0.95
285	0.94
286	0.91
287	0.87
288	0.8
289	0.7
290	0.6
291	0.49
292	0.4
293	0.29
294	0.21
295	0.14
296	0.1
297	0.11
298	0.15
299	0.23
300	0.29
301	0.36
302	0.44
303	0.54
304	0.63
305	0.7
306	0.76
307	0.79
308	0.83
309	0.86
310	0.89
311	0.89
312	0.89
313	0.89
314	0.87
315	0.81
316	0.71
317	0.61
318	0.52
319	0.42
320	0.32
321	0.24
322	0.19
323	0.16
324	0.2
325	0.29
326	0.35
327	0.43
328	0.54
329	0.64
330	0.72
331	0.81
332	0.86
333	0.89
334	0.93
335	0.95
336	0.95
337	0.94
338	0.88
339	0.84
340	0.74
341	0.64
342	0.53
343	0.42
344	0.31
345	0.22
346	0.17
347	0.11
348	0.1
349	0.13
350	0.17
351	0.21
352	0.3
353	0.39
354	0.49
355	0.59
356	0.7
357	0.77
358	0.84
359	0.91
360	0.94
361	0.96
362	0.97
363	0.97
364	0.97
365	0.96
366	0.94
367	0.93
368	0.87
369	0.8
370	0.71
371	0.61
372	0.5
373	0.4
374	0.31
375	0.21
376	0.15
377	0.11
378	0.09
379	0.1
380	0.14
381	0.18
382	0.22
383	0.27
384	0.33
385	0.38
386	0.43
387	0.47
388	0.52
389	0.59
390	0.65
391	0.71
392	0.76
393	0.81
394	0.85
395	0.88
396	0.87
397	0.87
398	0.87
399	0.84
400	0.79
401	0.75
402	0.67
403	0.64
404	0.57
405	0.48
406	0.39
407	0.3
408	0.25
409	0.18
410	0.16
411	0.11
412	0.1
413	0.09
414	0.07
415	0.13
416	0.14
417	0.2
418	0.23
419	0.25
420	0.27
421	0.33
422	0.35
423	0.32
424	0.33
425	0.28
426	0.26
427	0.3
428	0.28
429	0.23
430	0.23
431	0.22
432	0.2
433	0.24
434	0.22
435	0.17
436	0.19
437	0.24
438	0.25
439	0.29
440	0.33
441	0.29
442	0.39
443	0.41
444	0.43
445	0.46
446	0.52
447	0.58
448	0.6
449	0.64
450	0.57
451	0.59
452	0.55
453	0.53
454	0.45
455	0.42
456	0.38
457	0.38
458	0.35
459	0.35
460	0.34
461	0.28

F8PTM2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer