Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F8PFN3

Protein Details
Accession F8PFN3    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-47KKALEEKKKLDQLRKEKEEEBasic
160-200EMQQRNGIKPKKDKKDKKRDKQEKKKDKKKDRDLEVRGRERBasic
301-344DDRRKEPPRRFAEDDRKRRRSYTPPSPRGKRSRLSRSPPPASRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
166-204GIKPKKDKKDKKRDKQEKKKDKKKDRDLEVRGRERSRSR
303-339RRKEPPRRFAEDDRKRRRSYTPPSPRGKRSRLSRSPP
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR022209  CWC25  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
PF12542  CWC25  
Amino Acid Sequences MGGGDLNMKKSWHPLLLKNQERVWLEEKKALEEKKKLDQLRKEKEEERQLQELQRLQEEQTGKKRTEKLEWMYTTPATGSSQNANELEDYLLGKKRVDKILTADENAKLGAAHKSFIAVQNANNTRDIAAKIREDPLLAIKKQEQAAYEALMANPLRLREMQQRNGIKPKKDKKDKKRDKQEKKKDKKKDRDLEVRGRERSRSRTLSPVDGYRRRSPSYDRYDRSRRSRSPYYRRSRSPPSHPRYDDRRYSQDDSRARLRSRSRTPDSRYRARDDMSRGQPGGRVKVWPRSDESDDNGPIDDRRKEPPRRFAEDDRKRRRSYTPPSPRGKRSRLSRSPPPASRSTQSVSKQQNNAAEERAARLAAMQSGATSMTAERQQRLNAMLEKEKAEMEAEERARAKSKGMGGFLSHEQKKVFGGVGGLEDRIRRGRGGLVADMD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.51
3 0.61
4 0.67
5 0.67
6 0.64
7 0.64
8 0.6
9 0.57
10 0.52
11 0.49
12 0.45
13 0.45
14 0.43
15 0.43
16 0.48
17 0.49
18 0.52
19 0.52
20 0.54
21 0.59
22 0.67
23 0.67
24 0.69
25 0.73
26 0.76
27 0.79
28 0.81
29 0.77
30 0.74
31 0.76
32 0.78
33 0.75
34 0.71
35 0.66
36 0.63
37 0.61
38 0.61
39 0.57
40 0.49
41 0.44
42 0.39
43 0.34
44 0.36
45 0.35
46 0.37
47 0.41
48 0.44
49 0.42
50 0.49
51 0.54
52 0.53
53 0.58
54 0.59
55 0.57
56 0.61
57 0.62
58 0.57
59 0.54
60 0.49
61 0.41
62 0.32
63 0.27
64 0.19
65 0.17
66 0.17
67 0.18
68 0.19
69 0.22
70 0.22
71 0.21
72 0.19
73 0.19
74 0.17
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.16
79 0.16
80 0.17
81 0.22
82 0.27
83 0.33
84 0.33
85 0.33
86 0.34
87 0.44
88 0.45
89 0.42
90 0.38
91 0.33
92 0.31
93 0.29
94 0.23
95 0.13
96 0.12
97 0.15
98 0.13
99 0.13
100 0.12
101 0.14
102 0.15
103 0.19
104 0.23
105 0.18
106 0.19
107 0.28
108 0.32
109 0.32
110 0.32
111 0.28
112 0.24
113 0.25
114 0.25
115 0.2
116 0.19
117 0.2
118 0.21
119 0.23
120 0.23
121 0.21
122 0.2
123 0.24
124 0.26
125 0.24
126 0.25
127 0.25
128 0.29
129 0.31
130 0.31
131 0.25
132 0.22
133 0.22
134 0.21
135 0.19
136 0.15
137 0.13
138 0.15
139 0.14
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.11
144 0.1
145 0.14
146 0.22
147 0.3
148 0.35
149 0.42
150 0.47
151 0.5
152 0.6
153 0.62
154 0.58
155 0.61
156 0.65
157 0.67
158 0.73
159 0.8
160 0.81
161 0.87
162 0.92
163 0.93
164 0.94
165 0.95
166 0.95
167 0.96
168 0.96
169 0.96
170 0.96
171 0.95
172 0.94
173 0.94
174 0.93
175 0.93
176 0.91
177 0.89
178 0.88
179 0.86
180 0.85
181 0.83
182 0.78
183 0.72
184 0.64
185 0.59
186 0.53
187 0.52
188 0.49
189 0.45
190 0.41
191 0.44
192 0.44
193 0.44
194 0.42
195 0.41
196 0.41
197 0.42
198 0.45
199 0.44
200 0.45
201 0.42
202 0.42
203 0.42
204 0.44
205 0.48
206 0.52
207 0.48
208 0.52
209 0.6
210 0.65
211 0.68
212 0.68
213 0.63
214 0.62
215 0.69
216 0.72
217 0.74
218 0.77
219 0.79
220 0.78
221 0.78
222 0.76
223 0.76
224 0.73
225 0.73
226 0.74
227 0.7
228 0.71
229 0.69
230 0.69
231 0.67
232 0.68
233 0.65
234 0.59
235 0.59
236 0.56
237 0.58
238 0.55
239 0.55
240 0.52
241 0.48
242 0.5
243 0.49
244 0.44
245 0.46
246 0.48
247 0.49
248 0.54
249 0.59
250 0.59
251 0.62
252 0.68
253 0.71
254 0.73
255 0.73
256 0.69
257 0.65
258 0.61
259 0.54
260 0.53
261 0.49
262 0.51
263 0.46
264 0.45
265 0.4
266 0.37
267 0.39
268 0.36
269 0.33
270 0.25
271 0.25
272 0.24
273 0.33
274 0.35
275 0.34
276 0.36
277 0.37
278 0.41
279 0.39
280 0.4
281 0.37
282 0.36
283 0.34
284 0.3
285 0.25
286 0.21
287 0.23
288 0.22
289 0.19
290 0.26
291 0.35
292 0.44
293 0.51
294 0.6
295 0.64
296 0.68
297 0.72
298 0.75
299 0.77
300 0.78
301 0.81
302 0.82
303 0.82
304 0.76
305 0.73
306 0.7
307 0.69
308 0.69
309 0.69
310 0.69
311 0.71
312 0.79
313 0.83
314 0.85
315 0.84
316 0.82
317 0.79
318 0.77
319 0.79
320 0.79
321 0.79
322 0.8
323 0.8
324 0.83
325 0.8
326 0.76
327 0.71
328 0.66
329 0.6
330 0.55
331 0.49
332 0.47
333 0.45
334 0.48
335 0.51
336 0.54
337 0.56
338 0.55
339 0.58
340 0.53
341 0.51
342 0.44
343 0.38
344 0.31
345 0.29
346 0.26
347 0.19
348 0.16
349 0.15
350 0.14
351 0.12
352 0.12
353 0.1
354 0.08
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.08
359 0.07
360 0.1
361 0.15
362 0.18
363 0.21
364 0.24
365 0.25
366 0.28
367 0.3
368 0.32
369 0.32
370 0.34
371 0.37
372 0.37
373 0.37
374 0.35
375 0.33
376 0.28
377 0.23
378 0.19
379 0.16
380 0.21
381 0.21
382 0.25
383 0.26
384 0.28
385 0.31
386 0.3
387 0.3
388 0.28
389 0.34
390 0.35
391 0.35
392 0.35
393 0.33
394 0.37
395 0.41
396 0.44
397 0.39
398 0.36
399 0.34
400 0.34
401 0.33
402 0.31
403 0.25
404 0.17
405 0.16
406 0.15
407 0.18
408 0.18
409 0.18
410 0.17
411 0.17
412 0.2
413 0.23
414 0.23
415 0.2
416 0.21
417 0.25
418 0.28
419 0.32