Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R033

Protein Details
Accession C4R033    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-64SNEIREQGKQKKKPISEVRQDKKKKLDPAFHydrophilic
205-233LAERKRKDELKKKRQQQQKEKEKEKEKEEBasic
327-358DDEKLLKKSLKRKEVKKRKSEKEWKDRKETIEBasic
360-396TQKARQDKREENLRLRKENKGKKRKDQTRLKKFSGIVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-59KQKKKPISEVRQDKKKK
173-229RNKLTAKINNMREKRKAPGTNAKGAPMSREQILAERKRKDELKKKRQQQQKEKEKEK
319-410GIEGKKIKDDEKLLKKSLKRKEVKKRKSEKEWKDRKETIEITQKARQDKREENLRLRKENKGKKRKDQTRLKKFSGIVKPTRAGFEGKHKRK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029190  Rrp14/SURF6_C  
IPR029188  Rrp14_N  
IPR007019  SURF6  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG ppa:PAS_chr2-1_0245  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15459  RRP14  
PF04935  SURF6  
Amino Acid Sequences MSNSLEERLKSHASSFDGLLSLIPAKYYYEDSNKSNEIREQGKQKKKPISEVRQDKKKKLDPAFHSENVETATVKDVMRNREKAGKGAVIPGNKKIQVDAQDTSETDEKDNDNNHNILDAELEKDREVPAPLKTQEPATIFDDEGNEIKSKEMSSEEIAQQKAMKEKRLSELRNKLTAKINNMREKRKAPGTNAKGAPMSREQILAERKRKDELKKKRQQQQKEKEKEKEKEEDSDSDDDDEEKIDADVMFNNIKFTDGEKVSSDLSSLRKVKKKGPSHGDFKAHLQLLERQKEKFSKLDKEQQAQIQEKARWNKALAGIEGKKIKDDEKLLKKSLKRKEVKKRKSEKEWKDRKETIEITQKARQDKREENLRLRKENKGKKRKDQTRLKKFSGIVKPTRAGFEGKHKRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.27
4 0.24
5 0.23
6 0.2
7 0.16
8 0.14
9 0.12
10 0.11
11 0.1
12 0.11
13 0.13
14 0.17
15 0.21
16 0.27
17 0.31
18 0.34
19 0.39
20 0.43
21 0.42
22 0.42
23 0.41
24 0.39
25 0.39
26 0.43
27 0.48
28 0.54
29 0.63
30 0.67
31 0.72
32 0.76
33 0.76
34 0.8
35 0.8
36 0.8
37 0.81
38 0.84
39 0.85
40 0.86
41 0.88
42 0.85
43 0.84
44 0.81
45 0.8
46 0.78
47 0.78
48 0.74
49 0.76
50 0.77
51 0.7
52 0.66
53 0.56
54 0.48
55 0.4
56 0.33
57 0.24
58 0.17
59 0.16
60 0.15
61 0.15
62 0.18
63 0.22
64 0.3
65 0.37
66 0.4
67 0.4
68 0.46
69 0.47
70 0.46
71 0.45
72 0.41
73 0.34
74 0.38
75 0.39
76 0.37
77 0.37
78 0.39
79 0.4
80 0.38
81 0.37
82 0.3
83 0.31
84 0.31
85 0.34
86 0.31
87 0.28
88 0.28
89 0.28
90 0.31
91 0.29
92 0.23
93 0.19
94 0.2
95 0.18
96 0.21
97 0.24
98 0.24
99 0.25
100 0.25
101 0.24
102 0.22
103 0.21
104 0.17
105 0.15
106 0.12
107 0.1
108 0.11
109 0.12
110 0.11
111 0.12
112 0.12
113 0.12
114 0.14
115 0.14
116 0.16
117 0.21
118 0.23
119 0.24
120 0.24
121 0.23
122 0.26
123 0.25
124 0.26
125 0.22
126 0.22
127 0.2
128 0.2
129 0.2
130 0.16
131 0.15
132 0.13
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.13
142 0.16
143 0.19
144 0.22
145 0.22
146 0.22
147 0.22
148 0.21
149 0.26
150 0.25
151 0.28
152 0.26
153 0.29
154 0.36
155 0.43
156 0.46
157 0.48
158 0.55
159 0.54
160 0.59
161 0.57
162 0.53
163 0.52
164 0.51
165 0.49
166 0.48
167 0.51
168 0.51
169 0.56
170 0.58
171 0.56
172 0.55
173 0.53
174 0.54
175 0.5
176 0.48
177 0.52
178 0.52
179 0.55
180 0.53
181 0.49
182 0.42
183 0.38
184 0.34
185 0.26
186 0.22
187 0.15
188 0.15
189 0.13
190 0.17
191 0.24
192 0.29
193 0.33
194 0.35
195 0.36
196 0.39
197 0.45
198 0.49
199 0.52
200 0.57
201 0.61
202 0.67
203 0.75
204 0.8
205 0.83
206 0.85
207 0.85
208 0.85
209 0.85
210 0.86
211 0.85
212 0.85
213 0.85
214 0.8
215 0.75
216 0.71
217 0.62
218 0.57
219 0.52
220 0.46
221 0.4
222 0.36
223 0.31
224 0.24
225 0.22
226 0.17
227 0.14
228 0.12
229 0.08
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.07
237 0.09
238 0.08
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.14
245 0.14
246 0.15
247 0.16
248 0.17
249 0.17
250 0.17
251 0.16
252 0.12
253 0.14
254 0.19
255 0.24
256 0.3
257 0.36
258 0.39
259 0.46
260 0.53
261 0.6
262 0.63
263 0.68
264 0.68
265 0.68
266 0.72
267 0.7
268 0.61
269 0.56
270 0.52
271 0.43
272 0.36
273 0.32
274 0.32
275 0.36
276 0.42
277 0.4
278 0.35
279 0.39
280 0.43
281 0.44
282 0.43
283 0.42
284 0.43
285 0.49
286 0.58
287 0.6
288 0.6
289 0.62
290 0.59
291 0.6
292 0.54
293 0.51
294 0.47
295 0.45
296 0.48
297 0.51
298 0.5
299 0.46
300 0.44
301 0.44
302 0.43
303 0.42
304 0.36
305 0.37
306 0.35
307 0.38
308 0.41
309 0.36
310 0.32
311 0.3
312 0.3
313 0.27
314 0.32
315 0.37
316 0.44
317 0.5
318 0.53
319 0.59
320 0.64
321 0.67
322 0.7
323 0.71
324 0.7
325 0.74
326 0.8
327 0.84
328 0.89
329 0.9
330 0.91
331 0.91
332 0.93
333 0.94
334 0.93
335 0.93
336 0.94
337 0.91
338 0.9
339 0.85
340 0.78
341 0.77
342 0.69
343 0.66
344 0.65
345 0.62
346 0.58
347 0.57
348 0.57
349 0.57
350 0.6
351 0.59
352 0.57
353 0.61
354 0.64
355 0.69
356 0.73
357 0.74
358 0.78
359 0.79
360 0.8
361 0.76
362 0.78
363 0.78
364 0.8
365 0.81
366 0.82
367 0.84
368 0.85
369 0.92
370 0.92
371 0.92
372 0.93
373 0.93
374 0.93
375 0.93
376 0.88
377 0.84
378 0.77
379 0.77
380 0.76
381 0.74
382 0.7
383 0.68
384 0.66
385 0.61
386 0.61
387 0.53
388 0.46
389 0.41
390 0.44