Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F9XEF6

Protein Details
Accession F9XEF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-131VDERMSKRRKISREERERQEREEBasic
163-184EVGDLTGKNRRNKQNMRQRFYAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-122KRRKISRE
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9.666, nucl 9.5, cyto 9.5, cyto_mito 6.833, mito_nucl 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG ztr:MYCGRDRAFT_72776  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF14559  TPR_19  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSGRKDFLSQQAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEEQIKEALAKRAAALGNAPPTAYGVKKKDGDDAEVEEQFRDAENEEGLFATGNYDRDDDEADRIYQDVDERMSKRRKISREERERQEREEFERKNPKIQQQFADLKRALGTITDEDWASIPEVGDLTGKNRRNKQNMRQRFYAVPDSVLAGARDSTQLGTEIQDDGMATDAPGGSNEQQADGTMTNFAAVGAARDKVLKVRLDQAAQSQGGTETSGTSTAIDPKGYLTSLTKSEQKAGEIQVGDIKRARVLLESVIKTNPRHGPGWIAAARLEEYAGKIVAARNVIRRGCEMCPKSEDVWLESMRLNDNSNAKIIAAKAIEHNNRSVNLWIEASKLETIPTSKKRVLRKALDHIPQSVAIWREAVNLEDDPSDAKLLLAKATEIIPLSVELWLALARLETPEQAQVVLNKARKAIPSSFEIWVAAARLQEQTGNEAMVFKVMNRAVKALARESAMLKREEWIAQAELCEDEGALVTCRAIIQETIGWGLDKDDDRKKLWLDDAKSSVNRGQYETARAIYAVAMKEFYHRKSVWLSAADLERSHGSKENLWKILESAVNSIPNSSELWMQFAREKWLAGDVEGARRVLGEAFSKNPDNEDIYLAAVKLEADNGQSDQARRLLAQAREEARTDRVFIRSVAFERQINDKDRALELANEGLGIFPKADKLWMMKGQIYESKNMLPQAREAYSAGTRNCPKSVPLWLLASRLEEKMGVTVKARSILDRARLAVPKNPQLWTETIRLELRAKNVPAANQKLAQALQECPKSGLIWSERIWNLEARTQRKPRILEAIQKAENDPILFITAARIFWSERKLDKADSWFQKAVLLDPDYGDTWAWWYKFLLQHGTDEKRAEVVEKCVQNEPKHGEYWQGVRKAPENAGKGIEEVLKIVARGLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.33
3 0.26
4 0.24
5 0.17
6 0.11
7 0.09
8 0.09
9 0.08
10 0.09
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.27
37 0.28
38 0.27
39 0.32
40 0.31
41 0.26
42 0.25
43 0.23
44 0.26
45 0.25
46 0.25
47 0.19
48 0.2
49 0.22
50 0.23
51 0.27
52 0.26
53 0.34
54 0.39
55 0.4
56 0.46
57 0.46
58 0.47
59 0.42
60 0.44
61 0.42
62 0.39
63 0.39
64 0.31
65 0.28
66 0.24
67 0.21
68 0.15
69 0.12
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.11
76 0.1
77 0.08
78 0.09
79 0.11
80 0.12
81 0.13
82 0.13
83 0.14
84 0.15
85 0.18
86 0.17
87 0.18
88 0.19
89 0.18
90 0.18
91 0.18
92 0.17
93 0.15
94 0.15
95 0.14
96 0.14
97 0.2
98 0.22
99 0.31
100 0.39
101 0.43
102 0.5
103 0.57
104 0.62
105 0.66
106 0.75
107 0.77
108 0.8
109 0.85
110 0.86
111 0.88
112 0.84
113 0.79
114 0.76
115 0.7
116 0.67
117 0.67
118 0.6
119 0.59
120 0.66
121 0.63
122 0.64
123 0.66
124 0.68
125 0.67
126 0.7
127 0.64
128 0.62
129 0.7
130 0.63
131 0.65
132 0.56
133 0.47
134 0.42
135 0.38
136 0.29
137 0.2
138 0.2
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.12
147 0.1
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.12
155 0.2
156 0.26
157 0.33
158 0.43
159 0.52
160 0.61
161 0.71
162 0.77
163 0.8
164 0.85
165 0.84
166 0.8
167 0.75
168 0.69
169 0.64
170 0.62
171 0.51
172 0.41
173 0.35
174 0.32
175 0.28
176 0.25
177 0.19
178 0.11
179 0.11
180 0.1
181 0.11
182 0.1
183 0.09
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.08
202 0.08
203 0.11
204 0.12
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.13
209 0.12
210 0.11
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.12
225 0.17
226 0.18
227 0.19
228 0.25
229 0.29
230 0.3
231 0.31
232 0.31
233 0.31
234 0.29
235 0.27
236 0.2
237 0.17
238 0.15
239 0.15
240 0.11
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.13
248 0.14
249 0.13
250 0.12
251 0.13
252 0.14
253 0.14
254 0.14
255 0.11
256 0.13
257 0.16
258 0.19
259 0.23
260 0.22
261 0.27
262 0.27
263 0.26
264 0.27
265 0.26
266 0.27
267 0.22
268 0.22
269 0.23
270 0.22
271 0.22
272 0.2
273 0.19
274 0.15
275 0.15
276 0.15
277 0.11
278 0.12
279 0.16
280 0.21
281 0.22
282 0.23
283 0.25
284 0.27
285 0.26
286 0.31
287 0.31
288 0.28
289 0.27
290 0.26
291 0.28
292 0.27
293 0.34
294 0.29
295 0.24
296 0.21
297 0.21
298 0.21
299 0.16
300 0.15
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.1
309 0.12
310 0.13
311 0.17
312 0.23
313 0.24
314 0.24
315 0.25
316 0.26
317 0.27
318 0.34
319 0.31
320 0.28
321 0.31
322 0.33
323 0.32
324 0.32
325 0.3
326 0.23
327 0.25
328 0.23
329 0.21
330 0.19
331 0.19
332 0.17
333 0.17
334 0.17
335 0.16
336 0.18
337 0.17
338 0.17
339 0.16
340 0.14
341 0.14
342 0.13
343 0.13
344 0.1
345 0.1
346 0.13
347 0.2
348 0.23
349 0.23
350 0.25
351 0.24
352 0.24
353 0.25
354 0.23
355 0.17
356 0.15
357 0.15
358 0.13
359 0.12
360 0.12
361 0.12
362 0.11
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.1
367 0.16
368 0.21
369 0.25
370 0.29
371 0.35
372 0.43
373 0.51
374 0.57
375 0.58
376 0.6
377 0.63
378 0.67
379 0.67
380 0.6
381 0.53
382 0.45
383 0.38
384 0.31
385 0.25
386 0.18
387 0.13
388 0.12
389 0.11
390 0.11
391 0.11
392 0.11
393 0.1
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.06
402 0.05
403 0.06
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.06
408 0.07
409 0.07
410 0.08
411 0.07
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.05
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.03
424 0.03
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.06
430 0.07
431 0.07
432 0.08
433 0.08
434 0.11
435 0.15
436 0.17
437 0.17
438 0.18
439 0.19
440 0.2
441 0.23
442 0.22
443 0.19
444 0.21
445 0.23
446 0.22
447 0.21
448 0.2
449 0.16
450 0.13
451 0.12
452 0.09
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.08
458 0.07
459 0.09
460 0.08
461 0.08
462 0.07
463 0.08
464 0.07
465 0.07
466 0.07
467 0.05
468 0.09
469 0.1
470 0.12
471 0.12
472 0.12
473 0.13
474 0.15
475 0.16
476 0.13
477 0.13
478 0.12
479 0.13
480 0.14
481 0.17
482 0.17
483 0.17
484 0.16
485 0.15
486 0.16
487 0.16
488 0.15
489 0.13
490 0.11
491 0.11
492 0.11
493 0.1
494 0.08
495 0.08
496 0.07
497 0.05
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.05
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.08
518 0.08
519 0.13
520 0.17
521 0.2
522 0.22
523 0.24
524 0.25
525 0.24
526 0.29
527 0.3
528 0.28
529 0.3
530 0.32
531 0.33
532 0.33
533 0.32
534 0.3
535 0.27
536 0.25
537 0.23
538 0.22
539 0.21
540 0.24
541 0.24
542 0.22
543 0.18
544 0.17
545 0.15
546 0.12
547 0.13
548 0.1
549 0.09
550 0.09
551 0.09
552 0.14
553 0.17
554 0.17
555 0.21
556 0.2
557 0.22
558 0.25
559 0.27
560 0.26
561 0.25
562 0.24
563 0.21
564 0.22
565 0.21
566 0.18
567 0.16
568 0.14
569 0.13
570 0.14
571 0.15
572 0.15
573 0.18
574 0.26
575 0.31
576 0.33
577 0.33
578 0.31
579 0.28
580 0.3
581 0.28
582 0.21
583 0.17
584 0.16
585 0.17
586 0.17
587 0.17
588 0.13
589 0.13
590 0.12
591 0.1
592 0.11
593 0.1
594 0.14
595 0.14
596 0.14
597 0.16
598 0.17
599 0.21
600 0.18
601 0.18
602 0.15
603 0.19
604 0.18
605 0.15
606 0.19
607 0.15
608 0.18
609 0.19
610 0.19
611 0.15
612 0.14
613 0.15
614 0.1
615 0.1
616 0.1
617 0.1
618 0.13
619 0.16
620 0.18
621 0.18
622 0.18
623 0.19
624 0.19
625 0.18
626 0.17
627 0.14
628 0.13
629 0.14
630 0.12
631 0.11
632 0.08
633 0.07
634 0.05
635 0.06
636 0.05
637 0.06
638 0.07
639 0.07
640 0.1
641 0.11
642 0.12
643 0.14
644 0.15
645 0.15
646 0.14
647 0.18
648 0.22
649 0.23
650 0.26
651 0.3
652 0.3
653 0.32
654 0.33
655 0.31
656 0.28
657 0.26
658 0.26
659 0.22
660 0.22
661 0.21
662 0.21
663 0.22
664 0.2
665 0.22
666 0.23
667 0.23
668 0.23
669 0.23
670 0.29
671 0.32
672 0.33
673 0.35
674 0.32
675 0.32
676 0.31
677 0.31
678 0.25
679 0.21
680 0.18
681 0.16
682 0.14
683 0.11
684 0.1
685 0.09
686 0.08
687 0.07
688 0.06
689 0.05
690 0.06
691 0.07
692 0.08
693 0.09
694 0.12
695 0.17
696 0.21
697 0.24
698 0.25
699 0.26
700 0.29
701 0.34
702 0.33
703 0.29
704 0.27
705 0.27
706 0.26
707 0.29
708 0.28
709 0.23
710 0.24
711 0.27
712 0.26
713 0.26
714 0.24
715 0.23
716 0.24
717 0.28
718 0.26
719 0.29
720 0.32
721 0.34
722 0.35
723 0.32
724 0.3
725 0.28
726 0.34
727 0.31
728 0.29
729 0.31
730 0.31
731 0.32
732 0.31
733 0.31
734 0.26
735 0.23
736 0.2
737 0.16
738 0.15
739 0.17
740 0.18
741 0.16
742 0.15
743 0.18
744 0.19
745 0.23
746 0.23
747 0.2
748 0.23
749 0.27
750 0.31
751 0.31
752 0.33
753 0.33
754 0.37
755 0.37
756 0.38
757 0.4
758 0.42
759 0.43
760 0.42
761 0.38
762 0.37
763 0.39
764 0.37
765 0.35
766 0.28
767 0.29
768 0.29
769 0.3
770 0.31
771 0.31
772 0.31
773 0.33
774 0.33
775 0.34
776 0.35
777 0.39
778 0.43
779 0.46
780 0.45
781 0.41
782 0.41
783 0.38
784 0.37
785 0.33
786 0.27
787 0.25
788 0.29
789 0.29
790 0.29
791 0.27
792 0.28
793 0.25
794 0.24
795 0.27
796 0.23
797 0.25
798 0.25
799 0.32
800 0.32
801 0.33
802 0.34
803 0.3
804 0.29
805 0.3
806 0.37
807 0.34
808 0.43
809 0.49
810 0.55
811 0.59
812 0.6
813 0.59
814 0.62
815 0.61
816 0.61
817 0.62
818 0.63
819 0.59
820 0.57
821 0.53
822 0.45
823 0.42
824 0.32
825 0.24
826 0.16
827 0.15
828 0.14
829 0.12
830 0.14
831 0.13
832 0.13
833 0.14
834 0.14
835 0.14
836 0.19
837 0.24
838 0.26
839 0.27
840 0.34
841 0.36
842 0.38
843 0.42
844 0.45
845 0.5
846 0.52
847 0.56
848 0.51
849 0.47
850 0.47
851 0.42
852 0.38
853 0.34
854 0.29
855 0.23
856 0.22
857 0.24
858 0.22
859 0.22
860 0.19
861 0.13
862 0.14
863 0.18
864 0.18
865 0.17
866 0.17
867 0.23
868 0.28
869 0.31
870 0.36
871 0.32
872 0.39
873 0.46
874 0.5
875 0.47
876 0.44
877 0.41
878 0.36
879 0.35
880 0.31
881 0.26
882 0.27
883 0.32
884 0.34
885 0.36
886 0.42
887 0.48
888 0.48
889 0.53
890 0.54
891 0.49
892 0.48
893 0.46
894 0.44
895 0.41
896 0.47
897 0.46
898 0.45
899 0.44
900 0.45
901 0.49
902 0.48
903 0.51
904 0.5
905 0.46
906 0.43
907 0.44
908 0.41
909 0.37
910 0.35
911 0.3
912 0.22
913 0.19
914 0.19
915 0.17
916 0.16